聚磷酸盐:古老而神秘的多功能代谢物,解锁细胞奥秘的关键?

【字体: 时间:2025年03月06日 来源:BIOspektrum

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  为探究聚磷酸盐(PolyP)功能及代谢机制,研究人员开展相关研究,发现其功能多样但机制不明,极具研究价值。

  在微观的细胞世界里,能量的存储与转化就像一场精密的 “生命游戏”,对于所有细胞的生存与发展至关重要。在众多参与这场 “游戏” 的分子中,聚磷酸盐(PolyP)是一位隐藏的 “神秘玩家”。它结构并不复杂,由至少三个到超过一千个无机磷酸单元()通过磷酸酐键连接而成,这些磷酸单元链可以是线性、环状或分支状。看似简单的它,却有着诸多神奇功能,不仅能存储能量,还参与了细胞内一系列重要的生命活动。然而,长久以来,PolyP 就像一个蒙着面纱的舞者,尽管人们知道它在细胞中活跃,但其在不同生物体内的合成、降解机制以及具体的调控方式,大部分仍处于未知状态,这让科学家们对它充满好奇,迫切想要揭开它神秘的面纱。
为了深入了解 PolyP 这位 “神秘玩家”,来自德国弗莱堡大学(University of Freiburg)生物化学与分子生物学研究所的 Martin Milanov、Markus V?gtle 和 Hans-Georg Koch 等研究人员展开了研究。他们的研究成果发表在《BIOspektrum》杂志上,这一研究对揭示 PolyP 在细胞生命活动中的作用和机制有着重要意义,有望为相关领域的进一步探索打开新的大门。

研究人员在研究过程中,主要采用了基因分析和蛋白质研究相关技术。他们通过分析不同生物体内与 PolyP 合成和降解相关的基因,比如大肠杆菌(Escherichia coli )中的 PPK1 和 PPX 基因,研究这些基因在不同条件下的表达变化。同时,利用蛋白质互作分析技术,探究 PolyP 与其他蛋白质,如 RNA 聚合酶、Ribosomen 等的相互作用,以此来揭示 PolyP 在细胞内的功能机制。

PolyP 的合成与降解


PolyP 的合成曾是个谜团,直到 A. Kornberg 发现大肠杆菌中的聚磷酸盐激酶(PPK),才逐渐揭开其神秘面纱。现在已知的 PPK1 在大肠杆菌中以同源二聚体或同源四聚体形式存在,可催化 ATP 的 γ - 磷酸基团可逆地转移到 PolyP 上。不同生物合成 PolyP 的方式有所差异,在原核生物中,PPK1 主要负责 PolyP 的合成,而在氨基酸序列和结构上不同的 PPK2,主要利用 PolyP 对 GDP 和 ADP 进行磷酸化,比如在结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis )和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa )中就存在这种现象。在真核生物中,酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)液泡膜上的 VTC 复合物可催化由 ATP 合成 PolyP,并同时将其转运到液泡腔中,但大多数真核生物的 PolyP 合成酶仍不明确。PolyP 的降解在原核生物和真核生物中主要通过外切聚磷酸酶(PPX)进行,释放出。在细菌中,短链 PolyP 还可通过核苷酸酶 SurE 降解,真核生物中则还有内切聚磷酸酶,能将 PolyP 链切割成较短的寡磷酸链,但不释放

PolyP 合成的调控机制


在大肠杆菌中,PolyP 的合成受磷酸盐和氨基酸缺乏的刺激。传感器激酶 PhoR 可感知的缺乏,并通过磷酸化 PhoB 来刺激 30 多个基因的转录。当磷酸盐缺乏时,还会产生警报素(p)ppGpp,它能别构调节 RNA 聚合酶的活性,竞争性抑制 GTP 酶。PPK1 和 PPX 的基因在大肠杆菌中位于一个操纵子中,应激诱导的 Sigma 因子(RpoS、RpoN)以及与 RNA 聚合酶结合的蛋白 DksA 都参与调控 PolyP 的形成。此外,PolyP 的合成还存在翻译后调控,不过最初认为的(p)ppGpp 对 PPX 的抑制作用目前受到质疑。研究发现,一种普遍保守的、与核糖体相互作用的 ATP 酶 YchF 可通过选择性抑制相应 mRNA 的翻译来抑制应激蛋白的形成,缺失 ychF 会导致不同原核和真核生物的应激抗性增强,在大肠杆菌中还会增强 rpoS 基因的翻译。有趣的是,同时缺失 ychF 和 ppx 会导致大肠杆菌合成致死,这可能是因为 PolyP 浓度过高会因镁和磷酸盐的限制而产生毒性。在氧化应激条件下,PPX 会因半胱氨酸氧化而受到抑制,从而影响 PolyP 的水平。但总体而言,PolyP 合成的调控机制仍未完全明晰,不同菌株之间的差异也对此产生影响。

PolyP 的细胞功能


尽管 PolyP 结构简单,却影响着众多细胞过程。由于带有负电荷,它常与阳离子结合,有助于抵抗有毒金属。PolyP 还能抑制核酸修饰酶,如 DNA 连接酶或 DNA 聚合酶,这可能是通过与络合引发的。PolyP 既是磷酸盐的储存库,也参与核苷三磷酸(NTP)的再生。此外,它还影响许多应激反应、对抗生素的抗性以及蛋白质稳态。在大肠杆菌中,PolyP 刺激 rpoS 的转录,间接影响 500 多个基因的转录,其中许多基因与应激反应有关。PolyP 通过与核糖体直接相互作用,影响翻译准确性,并通过与蛋白酶 Lon 结合,刺激错误折叠或多余蛋白质的降解,在营养缺乏时提供氨基酸,这可能与严谨反应有关,但具体机制尚未完全清楚。在真核生物中,体外研究发现 PolyP 浓度升高会导致蛋白质在 PASK 簇(多酸性丝氨酸和赖氨酸簇)上发生非酶促多磷酸化,不过这种修饰是共价结合还是非常稳定的非共价结合存在争议,且目前尚无明确证据表明体内存在这种修饰。在真核生物中还发现了组氨酸 - PolyP 修饰,这种修饰似乎会抑制相应酶的活性,可能会抑制细胞周期进程和核糖体生物发生。虽然目前尚不清楚原核生物中是否存在 PolyP 修饰,但由于 PolyP 的普遍保守性以及观察到 Lon 与 PolyP 孵育后的质量变化,这种修饰很可能存在。PolyP 还具有化学伴侣的作用,能够减少热或氧化剂导致的蛋白质聚集,稳定折叠中间体的 β - 折叠结构,并与 ATP 依赖的伴侣蛋白共同促进天然折叠。此外,PolyP 还通过液 - 液相分离(LLPS)影响蛋白质定位。

综上所述,PolyP 及其代谢尽管在进化上具有保守性且功能多样,但目前仍有许多未知之处,是一个极具潜力的研究领域。对 PolyP 的深入研究,有助于我们更全面地理解细胞内的生命活动,为解决细胞生理、应激反应、疾病发生等多方面的问题提供新的思路和方向。未来,随着研究的不断深入,PolyP 这个 “神秘玩家” 或许会为生命科学和健康医学领域带来更多意想不到的惊喜。

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