CRISPR/Cas9 编辑 eEF1Bγ:烟草抗病毒新策略

【字体: 时间:2025年03月04日 来源:Plant Cell Reports 5.3

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  为探究编辑 eEF1Bγ能否使植物抗病毒,研究人员编辑本氏烟草 eEF1Bγ基因,发现可降低烟草蚀纹病毒积累。

  植物病毒病如同农业领域的 “定时炸弹”,时刻威胁着全球农业的稳定发展。据统计,每年因植物病毒病造成的经济损失高达数十亿美元。传统的育种方法,比如将野生近缘种的抗性(R)基因导入优良品种,不仅耗时耗力,而且随着新病毒株系的不断出现,现有的抗性基因往往难以应对,使得抗病育种工作困难重重。
在这样的背景下,韩国首尔国立大学的研究人员 Bomi Kang、Jelli Venkatesh 等人开展了一项极具意义的研究,相关成果发表在《Plant Cell Reports》上。他们将目光聚焦于真核翻译延伸因子 1Bγ(eEF1Bγ),试图通过基因编辑的手段,探索其在植物抗病毒过程中的作用,为培育抗病毒植物品种开辟新途径。
在研究方法上,研究人员主要采用了以下几种关键技术:一是病毒诱导基因编辑(VIGE)技术,利用烟草脆裂病毒(TRV)载体将单导向 RNA(sgRNA)导入过表达 Cas9 的本氏烟草植株中,实现对 eEF1Bγ基因的编辑;二是利用生物信息学方法,从数据库中获取 eEF1Bγ基因序列,并进行表达分析;三是通过酶联免疫吸附测定(ELISA)技术,定量检测病毒在植物体内的积累情况;四是运用反转录定量 PCR(RT-qPCR)技术,分析 eEF1Bγ基因在编辑植株中的表达水平 。
研究结果如下:
  • eEF1Bγ基因的鉴定与表达分析:研究人员通过 BLASTP 搜索,在本氏烟草中鉴定出 4 个 eEF1Bγ同源基因(Niben101Scf10540g00002.1、Niben101Scf01552g05010.1、Niben101Scf01552g05013.1 和 Niben101Scf03350g00002.1)。通过分析公共转录组数据,发现这 4 个基因均有表达,表明它们适合进行基因编辑。
  • eEF1Bγ编辑植株的获得:利用 VIGE 方法,研究人员构建了靶向 eEF1Bγ基因的 pTRV-eEF1Bγ-sgRNA 载体,并将其导入本氏烟草中。经过筛选,获得了一些 eEF1Bγ编辑植株。这些植株中,部分同源基因发生了 1-bp 的插入或缺失,导致提前终止密码子的出现,从而使相应蛋白功能丧失。然而,研究人员未能获得 4 个同源基因均被敲除的植株,推测 eEF1Bγ基因的完全缺失可能是致死的。
  • 编辑植株的表型与基因表达分析:研究人员选取了部分 eEF1Bγ编辑植株进行进一步研究,发现这些植株表现出矮化的表型,其株高和第 5 节间长度均显著小于野生型植株。RT-qPCR 分析表明,在编辑植株中,3 个发生突变的 eEF1Bγ同源基因表达水平显著降低,而剩余的 1 个功能拷贝的表达水平与野生型相似,说明功能拷贝并未对缺失的基因进行补偿。
  • 编辑植株的抗病毒性分析:研究人员用马铃薯 X 病毒(PVX)、烟草花叶病毒(TMV)、番茄丛生矮化病毒(TBSV)和烟草蚀纹病毒(TEV)对 eEF1Bγ编辑植株进行接种实验。结果发现,编辑植株对 PVX、TMV 和 TBSV 并未表现出抗性,这些病毒在编辑植株和野生型植株中的积累水平相似。然而,编辑植株对 TEV 表现出部分抗性,在接种 TEV 后,编辑植株的接种叶和系统叶中 TEV 的积累量均显著低于野生型植株 。
研究结论和讨论部分指出,该研究首次证实了 CRISPR/Cas9 介导的 eEF1Bγ基因编辑可使本氏烟草对 TEV 产生部分抗性,表明 eEF1Bγ是 TEV 的宿主因子。这一发现为植物抗病毒研究提供了新的靶点和思路。尽管编辑 eEF1Bγ基因未能使植株对所有测试病毒产生抗性,但这可能是由于基因冗余或遗传补偿机制的作用。未来的研究可以进一步探索如何优化基因编辑策略,以提高植物对多种病毒的抗性。此外,研究人员还提出,通过引入选择性点突变来破坏 eEF1Bγ与 TEV 的相互作用,可能是一种在不影响植物生长发育的前提下,赋予植物抗病毒能力的有效方法。这项研究不仅加深了人们对植物与病毒相互作用机制的理解,更为培育抗病毒作物品种提供了理论基础和技术支持,有望在农业生产中发挥重要作用,助力解决植物病毒病带来的难题,保障全球粮食安全。

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