ICRAFT 平台：开启肿瘤免疫治疗靶点精准发现新时代

为解决抗癌药影响免疫系统问题，研究人员开发 ICRAFT 平台，发现关键靶点，助力免疫治疗药物研发。

　　许多针对癌细胞通路的抗癌药物会损害免疫系统。研究人员开发了一个计算靶点发现平台 —— 免疫相关 CRISPR 筛选功能靶点分析仪（ICRAFT），以便同时检测癌细胞和免疫细胞，从而识别抑制肿瘤进展和增强抗肿瘤免疫的通路。ICRAFT 整合了免疫相关 CRISPR 筛选数据集、单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据以及临床试验的治疗前 RNA 测序数据，为治疗靶点的发现提供了系统级的方法。利用 ICRAFT，研究人员发现了许多能增强癌细胞对免疫攻击的敏感性和 T 细胞活化的靶点，包括肿瘤坏死因子（TNF）α 诱导蛋白 3（TNFAIP3）、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型 2（PTPN2）和细胞因子信号抑制因子 1（SOCS1）。在癌细胞中，Tnfaip3（A20）缺失会激活 TNF - 核因子 κB（NF-κB）通路，促进趋化因子的表达，使 T 细胞募集到肿瘤部位。T 细胞介导的 Tnfaip3 基因敲除癌细胞的清除主要由 TNF 诱导的细胞凋亡驱动。T 细胞中 Tnfaip3 的失活增强了抗肿瘤疗效。通过整合多种功能基因组学和临床数据集，ICRAFT 为深入理解抗肿瘤免疫和免疫肿瘤学药物开发提供了一个交互式资源。