编辑推荐:
研究人员为探究胞内菌应对宿主脂滴(LDs)的遗传机制,对杀鱼爱德华氏菌研究,发现 ArgR 调控精氨酸代谢助力其抵抗 LDs,为抗菌策略提供思路。
在微观的生物世界里,宿主与病原体之间无时无刻不在进行着一场激烈的 “战争”。脂滴(Lipid Droplets,LDs)作为细胞内的一种特殊细胞器,在这场 “战争” 中扮演着重要角色。它不仅是细胞储存脂质的 “仓库”,还在宿主的先天性免疫防御中冲锋在前,是抵御病原体入侵的 “前沿阵地”。对于胞内病原体来说,能否抵抗宿主 LDs 的 “攻击”,关乎它们能否在宿主体内成功 “安营扎寨” 并逃避宿主免疫系统的 “追捕”。然而,目前病原体抵抗 LDs 上抗菌物质的具体机制还未完全明晰。
为了揭开这层神秘的面纱,华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室等机构的研究人员展开了深入探究。他们将目光聚焦在杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)上,这是一种能对全球水产养殖业造成严重威胁的革兰氏阴性菌,会感染多种重要的水产养殖物种。研究人员期望通过对它的研究,找到胞内病原体抵抗 LDs 的关键机制,为开发新的抗菌策略提供理论依据。最终,他们的研究成果发表在《Communications Biology》上。
研究人员在此次研究中运用了多种关键技术方法。其中,转座子插入测序(Tn - seq)技术用于全面筛选杀鱼爱德华氏菌抵抗 LDs 杀菌作用的关键基因;靶向代谢组学技术则帮助检测细菌在 LDs 处理后的代谢变化,尤其是精氨酸的代谢情况;细胞感染实验和体内感染实验分别在细胞水平和动物模型上探究细菌的致病机制和 LDs 抵抗能力 。
下面来看具体的研究结果:
- 胞内杀鱼爱德华氏菌抵抗 LDs 介导的杀菌作用:研究人员发现,当胞内致病细菌进入宿主细胞后,携带抗菌蛋白的 LDs 会主动出击,试图杀灭细菌。经过蛋白质组分析,在灭活的杀鱼爱德华氏菌刺激后的大菱鲆肝脏 LDs 上发现了多种抗菌蛋白,这进一步证实了 LDs 作为免疫反应细胞器的功能。通过生长曲线测定和抑菌圈实验,研究人员发现杀鱼爱德华氏菌对 LDs 介导的杀菌作用具有明显抗性,在 LDs 处理 9 小时后仍能继续增殖,而大肠杆菌的生长则几乎被完全抑制。
- Tn - seq 分析杀鱼爱德华氏菌抵抗 LDs 杀菌作用的必需基因:利用 Tn - seq 技术,研究人员对杀鱼爱德华氏菌抵抗 LDs 的机制进行了深入挖掘。经过分析,他们确定了 41 个在 LDs 处理后适应性显著变化的基因。这些基因涉及多种功能,近一半与经典的细菌应激反应和耐受途径相关,还有部分与 Ⅲ 型分泌系统(T3SS)以及基础代谢有关,特别是精氨酸代谢途径。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析也表明,精氨酸代谢途径在抵抗 LDs 杀菌作用中至关重要。
- 验证 Tn - seq 分析揭示的抵抗 LDs 杀菌作用的基因:研究人员从序列定义的转座子文库中挑选了 18 个适应性差异显著的插入突变体进行生长测试,并构建了 5 个关键基因(ΔargR、ΔrpoS、ΔesrB、ΔcpxR、ΔacrA)的无痕缺失菌株。实验结果显示,这些突变体在 LDs 处理后的生长均受到明显抑制,且缺失菌株形成的抑菌圈比野生型菌株更大,互补菌株则恢复了对 LDs 的抗性,这充分验证了这些基因在细菌抵抗 LDs 过程中的关键作用。同时,研究人员还检测了相关基因的转录水平,发现 LDs 处理后,argR 和 cpxR 的转录水平显著上调,这表明它们可能在转录水平上参与了对 LDs 的抵抗。
- 精氨酸以细胞内浓度依赖的方式影响杀鱼爱德华氏菌对 LDs 介导的杀菌作用的抗性:通过基因集富集分析(GSEA),研究人员发现精氨酸代谢相关基因对杀鱼爱德华氏菌在 LDs 压力下的生长有着重要影响。靶向代谢组学分析显示,LDs 处理后,细菌细胞内精氨酸显著积累。进一步研究发现,细胞内精氨酸水平过高会削弱杀鱼爱德华氏菌对 LDs 的抗性,而 ArgR 作为精氨酸代谢的核心调节因子,能够通过调节精氨酸代谢相关基因的表达来维持细胞内精氨酸的稳态,从而赋予细菌对 LDs 的抗性。此外,研究人员还发现,在杀鱼爱德华氏菌感染过程中,宿主细胞内的精氨酸水平会逐渐升高,细菌则会相应地调节精氨酸代谢相关基因的表达来维持精氨酸稳态并实现免疫逃逸。
- ArgR 决定杀鱼爱德华氏菌的体外和体内致病机制:研究人员利用精氨酸代谢相关突变体(ΔargR、ΔargO、ΔspeB)和全局应激耐受相关突变体(ΔacrA 和 ΔcpxR)感染 RAW264.7 细胞和大菱鲆,结果发现这些突变体在巨噬细胞内的定植和增殖能力显著下降,感染大菱鲆后的死亡率也明显降低,这表明 ArgR、argO、speB、acrA 和 cpxR 在杀鱼爱德华氏菌的致病过程中起着关键作用。
综合研究结果和讨论部分,这项研究首次揭示了杀鱼爱德华氏菌通过 ArgR 调节精氨酸代谢来抵抗宿主 LDs 杀菌作用的机制。这一发现不仅加深了我们对胞内病原体与宿主相互作用机制的理解,还为开发新型抗菌策略提供了潜在的靶点。然而,目前的研究主要是基于体外 LDs 挑战实验,未来还需要进一步研究宿主内综合的 LDs 介导的先天性免疫反应,以更全面地了解病原体与宿主之间的相互作用机制,为水产养殖业的病害防治提供更有效的理论支持和实践指导。
涓嬭浇瀹夋嵎浼︾數瀛愪功銆婇€氳繃缁嗚優浠h阿鎻ず鏂扮殑鑽墿闈剁偣銆嬫帰绱㈠浣曢€氳繃浠h阿鍒嗘瀽淇冭繘鎮ㄧ殑鑽墿鍙戠幇鐮旂┒
10x Genomics鏂板搧Visium HD 寮€鍚崟缁嗚優鍒嗚鲸鐜囩殑鍏ㄨ浆褰曠粍绌洪棿鍒嗘瀽锛�
娆㈣繋涓嬭浇Twist銆婁笉鏂彉鍖栫殑CRISPR绛涢€夋牸灞€銆嬬數瀛愪功
鍗曠粏鑳炴祴搴忓叆闂ㄥぇ璁插爞 - 娣卞叆浜嗚В浠庣涓€涓崟缁嗚優瀹為獙璁捐鍒版暟鎹川鎺т笌鍙鍖栬В鏋�
涓嬭浇銆婄粏鑳炲唴铔嬬櫧璐ㄤ簰浣滃垎鏋愭柟娉曠數瀛愪功銆�