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为探究雌激素受体阳性乳腺癌(ER+ BC)内分泌治疗(ET)耐药相关基因,研究人员分析肿瘤标本,发现关键基因,或助改善治疗。
在乳腺癌的治疗领域,内分泌治疗(ET)是雌激素受体阳性乳腺癌(ER
+ BC)的重要治疗手段之一。然而,大约 20 - 40% 的 I - III 期 ER
+ BC 患者在接受内分泌治疗后仍会出现复发,一旦复发,患者死亡风险大幅增加,这表明存在内分泌治疗耐药的问题。目前,精准医学虽已改变乳腺癌治疗格局,但 ER
+ BC 的高度异质性使得靶向药物开发困难重重。现有的基因表达检测手段,如 Oncotype DX? 和 Mammaprint? 等,无法指导内分泌治疗的用药,也没有能够预测内分泌治疗耐药的临床可用生物标志物,且内分泌治疗的副作用还会给患者带来心血管疾病等额外风险。因此,明确驱动 ER
+ BC 治疗耐药、复发以及导致患者生存率降低的分子信号通路迫在眉睫,找到针对这些生物标志物的药物将显著改善乳腺癌患者的死亡率。
为了深入探究这一难题,美国希望之城综合癌症中心(City of Hope Comprehensive Cancer Center)的研究人员开展了相关研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为 ER+ BC 的治疗带来了新的希望。
研究人员采用了多种技术方法来开展此项研究。首先,从希望之城综合癌症中心 2012 - 2016 年接受手术治疗的乳腺癌患者中选取符合条件的病例,收集手术病理标本,这些标本均为福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的 HER2 阴性、ER+ 的肿瘤组织,且患者需有至少 3 年的随访记录,排除转移性乳腺癌患者。然后,设计定制的 NanoString nCounter 面板,检测 145 个基因(包括 128 个内源性基因和 17 个管家基因)的表达情况,涵盖已知的 ER+ BC 相关通路以及与种族相关结局的基因。通过一系列的 RNA 提取、质量检测和基因表达分析操作后,利用负二项回归模型等统计学方法进行数据分析,比较复发组和未复发组以及不同分子亚型之间的基因表达差异,并进行 ROC 曲线分析评估单个基因区分复发和未复发的能力 ,同时进行 Pearson 相关性分析研究基因表达与增殖评分以及基因之间的相关性。
研究结果主要包括以下几个方面:
患者特征 :研究共纳入 79 例患者的 80 个肿瘤标本(1 例患者为双侧疾病),患者平均年龄 56 岁,多数为非西班牙裔白人。大部分患者接受了手术、放疗、内分泌治疗等多种治疗方式。在随访期间,14 例患者(17.7%)出现复发,平均复发时间为 32 个月,其中 7 例为局部区域复发,7 例为远处复发。高增殖指数(Ki - 67≥20%)与复发呈正相关,且管腔 B 型(luminal B)乳腺癌患者比管腔 A 型(luminal A)更易复发(29.6% vs. 13.7% ,p = 0.053)。
基因表达分析 :
复发相关差异表达基因 :与未复发组相比,复发组中 EZH2、WNT11、ITGB6 和 TOP2A 等基因显著上调,SNAI2、ITPR1、CD10、PTEN 等基因显著下调。其中,EZH2 表达是区分复发和未复发组的最显著指标,其 ROC 曲线下面积(AUC)为 0.74 ,p = 0.0042。EZH2 和 TOP2A 与增殖评分呈正相关,而 WNT11 和 ITGB6 可能是独立于增殖的与复发相关的潜在生物标志物。
不同分子亚型的基因表达差异 :在 luminal B 与 luminal A 亚型的比较中,发现了多个差异表达基因。luminal B 亚型中 PTTG1、CCNB1、MELK 等基因显著上调,SFRP1、IGF1、FOXC1 等基因显著下调,这揭示了 luminal B 亚型更具侵袭性的基因表达特征。
基因共表达分析 :通过对所有基因的相关性分析发现,细胞周期调控、DNA 复制和修复以及表观遗传调控相关的基因之间存在显著的共表达,表明这些基因参与驱动乳腺癌进展的致癌网络。
研究结论和讨论部分指出,该研究评估了 ER+ BC 在接受最佳内分泌治疗时复发相关的基因表达,确定了多个与内分泌治疗耐药相关的潜在生物标志物。例如,EZH2 和 TOP2A 参与细胞周期,靶向它们可能克服内分泌治疗耐药,目前已有 EZH2 抑制剂处于临床试验阶段;WNT11 在肿瘤增殖、转移和内分泌治疗耐药中起重要作用,可能是可靶向的生物标志物;而 WNT5A 等基因的下调与复发相关,其在肿瘤发生中的作用复杂,涉及多个通路。该研究的优势在于详细记录了治疗和复发信息,能深入探究耐药相关基因表达,且回顾性分析可评估长期结局。但也存在局限性,如回顾性研究的性质和样本量较小,以及黑人 / 非裔美国患者代表性不足等问题。总体而言,该研究确定的关键差异表达基因(DEGs)为进一步研究内分泌治疗耐药机制、开发新的治疗靶点以及改善 ER+ BC 患者的预后提供了重要依据,未来还需更多研究来验证这些基因的临床效用,并深入研究基因间的相互作用和通路调控。
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