在神秘的微生物世界里,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)一直是科学家们重点关注的对象。它引发的结核病,严重威胁着人类的健康。结核分枝杆菌的基因组中蕴含着大量的毒素 - 抗毒素(Toxin-Antitoxin,TA)系统,其中 VapBC 家族更是成员众多。然而,尽管科学家们在 TA 系统的研究领域已经取得了不少进展,但对于大多数 TA 系统在结核分枝杆菌致病过程中所扮演的角色,仍然知之甚少。这就如同在黑暗中摸索,虽然看到了一丝光亮,但周围还有许多未知等待着被揭开。为了深入了解这些神秘的 TA 系统,来自印度转化健康科学与技术研究所(Translational Health Science and Technology Institute)和印度科学研究所(Indian Institute of Science)的研究人员展开了一项重要的研究,他们将目光聚焦在了 VapBC35 TA 系统上。这项研究成果发表在了《Communications Biology》杂志上,为我们认识结核分枝杆菌的生存机制和致病过程提供了新的视角。
研究人员在探索 VapBC35 TA 系统的过程中,运用了多种关键技术方法。在构建突变体和互补菌株时,利用温度敏感型分枝杆菌噬菌体,成功构建出缺失 vapC35或 vapBC35的结核分枝杆菌突变菌株以及相应的互补菌株,这为后续研究该系统在不同条件下的功能变化奠定了基础。通过蛋白纯化技术,对 VapC35、VapB35等多种蛋白进行纯化,为研究蛋白的性质和相互作用提供了纯净的样本。运用微尺度热泳(Microscale Thermophoresis,MST)实验,精确测定了蛋白之间的结合亲和力以及 TA 复合物与启动子的结合情况,从分子层面揭示了其相互作用机制。采用尺寸排阻色谱 - 多角度光散射(Size Exclusion Chromatography-Multi Angle Light Scattering,SEC-MALS)技术,确定了蛋白和 TA 复合物的寡聚状态,让研究人员对其结构有了更深入的认识。
VapBC35 TA 复合物与启动子结合依赖于毒素 - 抗毒素比例:TA 系统的基因调控十分关键,研究人员通过 MST 实验发现,VapBC35复合物与自身启动子的结合亲和力会随着抗毒素浓度的增加而提高。这表明,VapBC35 TA 复合物能够根据毒素和抗毒素的相对比例,精准地调控自身基因的转录,维持细菌体内的平衡状态。
VapC35和 VapBC35对结核分枝杆菌在豚鼠体内建立疾病并非必需:以往研究表明,部分 VapBC TA 系统对结核分枝杆菌在动物体内建立感染至关重要。但此次研究发现,尽管缺失 vapC35或 vapBC35的菌株对氧化应激更为敏感,但在巨噬细胞和豚鼠感染实验中,这些突变菌株与野生型菌株在生长和组织损伤方面并没有明显差异。这一结果暗示,在结核分枝杆菌体内,可能存在功能冗余的 TA 系统,它们共同协作维持细菌在宿主体内的生存。
全长 VapBC 复合物在溶液中呈现多种寡聚状态:利用 SEC-MALS 技术,研究人员发现 VapBC 复合物的寡聚状态会随着抗毒素和毒素的化学计量比变化而改变,既可以形成异源六聚体,也可以形成异源八聚体。这种多变的结构可能与 TA 系统的功能多样性密切相关。
同源和非同源 TA 系统的热稳定性和结合研究:热变性实验表明,VapBC35复合物的热稳定性比游离的毒素或抗毒素更高,并且随着抗毒素浓度的增加,复合物的稳定性进一步增强。MST 实验还发现,VapC35与 VapB35的结合亲和力较高,与非同源抗毒素 VapB3也能结合,但与其他非同源抗毒素则无明显相互作用。
综合研究结果和讨论部分,这项研究首次对结核分枝杆菌的 VapBC35 TA 系统进行了详细的功能和生物物理表征。研究表明,VapC35的诱导表达对耻垢分枝杆菌具有抑菌作用,并且这种作用可以被同源抗毒素 VapB35和非同源抗毒素 VapB3逆转。虽然 VapBC35对结核分枝杆菌适应氧化应激至关重要,但在体内生长过程中却并非必需,这一现象揭示了 TA 系统之间可能存在功能冗余。此外,研究还发现了 VapBC35复合物的多种寡聚状态以及不同 TA 系统之间的相互作用,这为深入理解结核分枝杆菌的调控网络提供了重要线索。未来,研究人员计划构建多个缺失突变体,进一步探究 TA 系统在结核分枝杆菌致病过程中的累积作用,这将为开发针对结核病的新型治疗策略提供更坚实的理论基础。