墨西哥新莱昂州肺结核的地理分布与基因分型研究：探寻传播热点与耐药特征

为了解新莱昂州肺结核传播模式等问题，研究人员分析菌株分子流行病学和耐药模式，发现多种信息，助力防控。

　　肺结核（Tuberculosis，TB）是由结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）引起的一种极具威胁性的传染病，在全球范围内肆虐，尤其给中低收入国家带来了沉重的负担。2022 年，全球新诊断出的 TB 病例数飙升至 750 万，超越了 2019 年新冠疫情前 710 万的基线水平 ，它也成为全球十大死因之一，在单一传染病致死原因中仅次于 COVID-19。

在墨西哥，肺结核的发病情况不容乐观。2023 年，该国报告了超过 28000 例各类肺结核病例，其中肺结核（pulmonary tuberculosis，PTB）占比超 90%。新莱昂州（Nuevo Leon）的 PTB 发病率在全国位列前十，每年该州卫生部门都会进行大量微生物培养，众多新病例给防控工作带来巨大挑战。

然而，目前关于新莱昂州肺结核的传播模式和病例聚集情况的信息十分有限，这无疑给精准防控设置了重重障碍。在此背景下，来自墨西哥新莱昂自治大学等机构的研究人员 José Luis Zacarías-Hernández、Amador Flores-Aréchiga 等展开了深入研究，相关成果发表在《Scientific Reports》上，为揭开该地区肺结核的神秘面纱、制定有效的防控策略提供了关键线索。

研究人员采用了多种关键技术方法。在样本选择上，他们收集了 2019 年 6 月至 2020 年 6 月期间，新莱昂州卫生部门确诊的 151 例痰涂片抗酸杆菌阳性且培养阳性的初治肺结核患者的样本。在基因分析方面，运用 Spoligotyping 技术，对结核分枝杆菌的直接重复（DR）基因组区域进行扩增和杂交，以确定菌株的亚型和家族；通过 Mycobacteria Growth Indicator Tube 荧光法，进行一线药物（链霉素、异烟肼、利福平、乙胺丁醇和吡嗪酰胺）的药物敏感性测试；利用 ArcGIS? 软件进行空间分析，绘制 TB 谱系和菌株簇的地图，探索潜在的传播热点。

研究结果如下：

1. 患者基本情况：患者性别比例约为 3:1（男：女），年龄跨度从 18 岁到 96 岁，平均年龄在 40 - 44 岁左右。21.2% 的患者患有 II 型糖尿病，2.65% 的患者 HIV 呈阳性，还有部分患者存在吸烟、吸毒等风险因素，但这些因素与结核分枝杆菌的谱系之间未发现显著关联。
2. 基因分型结果：通过 Spoligotyping 技术，共鉴定出 19 个结核分枝杆菌亚谱系。其中，T1 谱系最为常见，占比 35.1%（n=53） ；其次是 X1 谱系，占 19.2%（n=29）；LAM 家族占 9.93%（n=15） 。此外，还发现了北京谱系（3.3%，n=5）和孤儿菌株（9.9%，n=15） 。
3. 耐药情况：在 151 株临床分离株中，16.55%（n=25）的菌株对至少一种药物耐药（DR-TB），9.93%（n=15）为耐多药 / 利福平耐药结核病（MDR/RR-TB），3.97%（n=6）为异烟肼耐药但利福平敏感的结核病（Hr-TB）。不同药物的耐药率分别为：链霉素 17.9%、异烟肼 15.9%、利福平 9.9%、乙胺丁醇 4.6%、吡嗪酰胺 13.9% ，69.1%（n=105）的临床分离株对所有测试药物敏感。
4. 空间分布与热点：利用 GIS 技术发现，蒙特雷市（Monterrey）的病例数最多。在蒙特雷大都市区，T1 谱系的病例数最多，且集中在瓜达卢佩（Guadalupe）和华雷斯（Juarez）市的边界附近，这表明该区域可能是 TB 传播的热点。

研究结论与讨论：该研究更新了新莱昂州肺结核谱系及其耐药性的信息，发现 T1 谱系在蒙特雷大都市区存在潜在传播热点。X1 谱系与耐药表型关联紧密，其高耐药率和较多的分离株数量，提示需加强防控，防止其传播导致 TB 病例增加。虽然研究发现了潜在热点，但由于研究存在样本数量有限、未使用其他基因分型方法、缺乏患者自然居住地和随访数据等局限性，该热点可能无法完全反映实际传播情况。未来，需要整合地理和遗传信息，并结合动态模型，进一步探究 TB 传播的个体差异，同时开展更深入的地理分析和数学建模研究，评估防控策略的有效性。此外，实施更强大的分子监测方法，对于监测菌株谱系、了解其传入情况和耐药性发展至关重要。总体而言，该研究揭示了新莱昂州肺结核基因型和耐药菌株的多样性，为防控工作提供了重要的数据更新和参考依据。