ETV4:头颈部鳞状细胞癌预后与免疫治疗的关键新靶点

【字体: 时间:2025年02月28日 来源:Scientific Reports 3.8

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  研究人员为探究 ETV4 在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)中的作用开展研究,发现其可作预后生物标志物及免疫治疗靶点。

  头颈部鳞状细胞癌(Head and Neck Squamous Cell Carcinoma,HNSC)是一种常见的恶性肿瘤,它如同潜藏在人体头颈部的 “恶魔”,严重威胁着人们的生命健康。近年来,尽管在 HNSC 的诊断和治疗方面取得了一些进展,但它的发病率和死亡率依然居高不下。这就如同在黑暗中摸索,始终找不到那盏照亮前行道路的明灯。因此,寻找早期有效的预后生物标志物,探索全新的治疗靶点,成为了医学领域亟待解决的关键问题。
在此背景下,来自右江民族医学院的研究人员挺身而出,开展了一项极具意义的研究。他们将目光聚焦于 ETS 变异转录因子 4(ETS variant transcription factor 4,ETV4),致力于探究其在 HNSC 中的潜在预后价值和致癌作用。经过一系列深入研究,研究人员发现 ETV4 在 HNSC 中显著过表达,并且与患者的临床病理特征和预后密切相关。这一发现意义重大,它表明 ETV4 有望成为 HNSC 预后的生物标志物和免疫治疗的新靶点,为 HNSC 的诊断和治疗开辟了新的方向。该研究成果发表在《Scientific Reports》上。

为开展此项研究,研究人员运用了多种关键技术方法。首先,从癌症基因组图谱计划数据库(The Cancer Genome Atlas Program database,TCGA)下载 HNSC 患者的表达谱及临床信息,并进行标准化处理。之后,借助 R Studio 等软件,利用多种数据库如 STRING、GEPIA、TISIDB 等进行生物信息学分析。此外,还采用了细胞实验,包括用 siRNA 干扰技术敲低鼻咽癌细胞(Nasopharyngeal Carcinoma cells,NPCs)中 ETV4 的表达,运用 CCK-8、Transwell、克隆形成等实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力。

下面来详细看看研究结果:

  1. ETV4 在多种癌症中的表达:通过对多种癌症的分析发现,ETV4 在 24 种癌症类型中相较于正常组织高表达,在 15 种癌症类型中相较于相邻组织上调,在多种癌症的肿瘤与正常组织配对比较中也普遍上调,这表明 ETV4 在多种肿瘤组织中广泛上调,其中包括 HNSC。
  2. ETV4 在 HNSC 中的表达及与临床病理特征的关系:分析 TCGA-HNSC 队列数据可知,HNSC 组织中 ETV4 显著上调,诊断 ROC 曲线显示其对 HNSC 有较高诊断价值。而且,ETV4 表达与 HNSC 患者的年龄、性别、T 分期、M 分期、N 分期和临床分级显著相关。
  3. ETV4 在 HNSC 中的预后价值:经单因素和多因素 Cox 回归分析等发现,T3 & T4 期肿瘤、N2 & N3 期、M1 期、病理分期 III + IV 期、放疗和高 ETV4 表达是 HNSC 的预后危险因素,高 ETV4 表达还是独立危险因素,且高表达 ETV4 的患者总生存期(Overall Survival,OS)、疾病特异性生存期(Disease-Specific Survival,DSS)和无进展生存期(Progression-Free Interval,PFI)更短,说明 ETV4 是 HNSC 的不良预后指标。
  4. ETV4 相互作用及表达相关基因的功能富集:STRING 数据库分析找到与 ETV4 密切相互作用的 50 种蛋白质,GEPIA 数据库分析发现 ETV5 等基因与 ETV4 表达显著正相关。功能富集分析显示相关基因参与上皮管分支形态发生等过程。GSEA 分析表明高 ETV4 表达样本在多个免疫相关通路存在显著富集或抑制,提示 ETV4 在肿瘤免疫过程中可能起负调控作用。
  5. ETV4 共表达网络中的枢纽基因及相关通路:构建 ETV4 共表达基因网络,确定了 10 个枢纽基因,ETV4 是其中之一且与其他枢纽基因呈强正相关。功能和通路富集分析显示这些枢纽基因参与多种癌症相关过程和通路,ETV4 尤其涉及细胞周期调节等多种信号通路的调控。
  6. ETV4 表达与免疫细胞浸润及检查点的相关性:分析发现 ETV4 表达与 24 种免疫细胞类型大多呈负相关,影响 16 种免疫细胞浸润,与免疫评分等呈负相关,还与众多免疫检查点基因呈负相关,表明高 ETV4 表达可能抑制 HNSC 的免疫景观和肿瘤微环境。
  7. ETV4 与免疫调节基因的相关性:利用 TISIDB 数据库分析发现,ETV4 表达与肿瘤浸润淋巴细胞(Tumor-Infiltrating Lymphocytes,TILs)的免疫相关特征分子、免疫抑制剂、免疫刺激剂、MHC 相关分子、趋化因子及其受体大多呈负相关,说明 ETV4 可能是癌症免疫治疗的潜在靶点。
  8. ETV4 表达验证及其对 NPC 生物学行为的影响:qRT-PCR 和 Western blotting 实验表明 CNE1 和 CNE2 细胞中 ETV4 的 mRNA 和蛋白质水平显著高于 NP69 细胞。敲低 ETV4 后,NPC 细胞的增殖、迁移和侵袭能力显著下降,证实了 ETV4 在 NPC 细胞增殖、迁移和侵袭中的重要作用。

研究结论和讨论部分指出,ETV4 在多种肿瘤包括 HNSC 中高表达,与 HNSC 患者的临床病理特征和预后密切相关。它可能通过与多种蛋白质相互作用,参与重要生物学过程和信号通路,影响肿瘤的发生发展。同时,ETV4 在 HNSC 的免疫过程中可能起负调控作用,影响免疫细胞浸润、免疫检查点和免疫调节基因,是潜在的免疫治疗靶点。不过,该研究也存在一定局限性,未来研究可扩大到 HNSC 的其他亚型。总体而言,这项研究为 HNSC 的诊断和治疗提供了新的思路和靶点,对推动 HNSC 的研究和临床实践具有重要意义。

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