基于 T1加权 MRI 的深度学习模型:精准脑肿瘤分类新突破

【字体: 时间:2025年02月28日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为解决脑肿瘤分类难题,研究人员对比多种深度学习模型,发现 U-Net 表现最佳,助力临床诊断。

  在人体这座神秘的 “城堡” 中,大脑无疑是最关键的 “指挥中心”,掌控着认知、思维、行动等诸多重要功能。一旦大脑出现肿瘤,就如同 “指挥中心” 遭受了入侵,严重威胁着人们的健康。脑肿瘤分为多种类型,像脑膜瘤、垂体瘤这种良性肿瘤,生长相对缓慢,扩散风险较低;而胶质瘤等恶性肿瘤则十分凶险,不仅侵袭周围组织,还可能在中枢神经系统内 “四处逃窜”,治疗难度极大。
在脑肿瘤的诊断过程中,磁共振成像(MRI)是极为重要的 “侦察兵”。它利用强大的磁场,无需让患者承受痛苦,就能为医生呈现出大脑或脊髓的详细图像。然而,面对 MRI 产生的海量数据,传统的诊断方法逐渐力不从心,迫切需要更高效、精准的技术。于是,深度学习技术应运而生,它如同拥有神奇魔力的 “数据魔法师”,在医学影像领域大放异彩,尤其在脑肿瘤的检测、分类和分割任务中表现出色。

为了进一步提升脑肿瘤分类的准确性,来自美国俄克拉荷马大学(University of Oklahoma)的 Mohsen Asghari Ilani、Dingjing Shi 和 Yaser Mike Banad 等研究人员,开展了一项极具意义的研究。他们精心对比了 U-Net 架构、全连接卷积神经网络(CNN)以及基于迁移学习的 Inception-V3、EfficientNetB4 和 VGG19 等模型,评估这些模型在分类脑 MRI 数据方面的效果。该研究成果发表在《Scientific Reports》上,为脑肿瘤的诊断开辟了新的道路。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。数据方面,他们使用了 Figshare 公开数据集,其中包含 3064 张 T1加权增强 MRI 图像,涵盖了脑膜瘤、胶质瘤和垂体瘤三类。数据预处理时,对图像进行了调整大小、灰度转换、滤波、裁剪等操作,并随机划分训练集、验证集和测试集。模型构建上,采用基本全连接 CNN 和 U-Net 架构,同时运用迁移学习,对 Inception-V3、EfficientNetB4 和 VGG19 等预训练模型进行微调。评估模型性能时,使用了准确率、精确率、召回率、F1分数和 ROC 曲线下面积(AUC)等指标,还采用了分层 k 折交叉验证确保结果可靠。

下面来看看具体的研究结果:
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  • 3 层 CNN 的表现:3 层 CNN 作为基础模型,在对 270×270 像素的脑肿瘤图像进行分类时,训练采用稀疏分类交叉熵损失和 Adam 优化器,数据按 80% 训练、20% 测试划分,并进行五折分层交叉验证。最终该模型准确率达到 98% ,F1分数、召回率和精确率均为 98%,AUC 为 99%。
  • U-Net 架构的优势:U-Net 架构专为图像分割设计,在脑肿瘤分类任务中表现卓越。其输入图像标准化为 270×270 像素,通过编码器路径提取特征,瓶颈层进一步细化,再经全局平均池化、Dropout 正则化,最后由密集层进行分类。训练使用 Rectified Adam 优化算法和分类交叉熵损失函数,训练 14 个 epoch,批次大小为 10。结果显示,U-Net 的准确率高达 98.56% ,F1分数、AUC 值、召回率和精确率均达到 99%,在众多模型中脱颖而出。
  • 基于迁移学习的 CNN 成果:研究人员利用 Inception-V3、EfficientNetB4 和 VGG19 进行迁移学习,保留原模型大部分层和参数,替换 Flatten 层为 GlobalAveragePooling2D,加载 ImageNet 数据集预训练权重,添加自定义层,并调整 Dropout 层和应用 L2 正则化。训练使用 RectifiedAdam 优化器和分类交叉熵损失函数,最终 EfficientNetB4 准确率为 98.31% ,F1分数、召回率和精确率为 98%,AUC 值为 99.33%;VGG19 准确率为 97.72% ,各项指标为 97%,AUC 值为 99%;InceptionV3 准确率为 97.27% ,各项指标为 97%,AUC 值为 99%。
  • 外部队列交叉数据集验证:为进一步验证模型的可靠性,研究人员使用来自 Kaggle 存储库的外部脑肿瘤分类数据集进行交叉数据集验证。结果显示,U-Net 依旧表现最佳,准确率达到 96.01% ,F1分数、召回率和精确率为 96%,AUC 值为 99.33%;VGG19 准确率为 93.5% ;InceptionV3 和 3 层 CNN 的准确率分别为 93% 和 94.94%;EfficientNETB4 准确率为 91.07%。

研究结论与讨论部分指出,U-Net 在脑肿瘤分类任务中性能最优,能有效捕捉肿瘤的复杂特征,准确分割肿瘤边界,这对于脑肿瘤的早期发现和治疗方案的制定至关重要。并且,U-Net 在跨数据集验证中展现出良好的泛化能力,在不同临床场景和成像协议下都能保持可靠的性能。虽然基于迁移学习的模型也取得了不错的结果,但 U-Net 的特殊架构使其更适合脑肿瘤分割任务。不过,该研究也存在一些局限性,如依赖大量准确标注的数据,易出现过拟合;成像协议和数据质量的差异会影响模型性能;计算需求大,在资源有限的医疗机构部署困难;模型可解释性差,阻碍临床应用。

未来,研究人员计划整合先进的分割技术,如 nnUNet,与深度分类网络协同工作,探索混合分割 - 分类管道,提升诊断准确性。同时,还将研究基于区域的 CNN 和 Transformer 架构,优化模型架构以降低计算复杂度,提高模型在实际医疗场景中的可行性。这些研究方向有望为脑肿瘤的诊断带来更精准、高效的工具,推动神经肿瘤学领域的发展,最终改善患者的治疗效果和生活质量。

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