在这项研究中,研究人员运用了多种关键技术方法。在合成方面,他们利用自制的合成器制备寡糖。对于结构和相互作用的研究,核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)技术发挥了重要作用,通过 1H NMR、COSY、HSQC 等多种 NMR 实验对分子进行分析。同时,分子动力学(Molecular Dynamics,MD)模拟辅助验证分子的构象和相互作用。
研究结果
1. 聚糖催化剂的设计
自然界中,聚糖与底物的结合方式多种多样,研究人员注意到在蛋白质的碳水化合物结合域中,芳香基团丰富,碳水化合物与芳香基团之间可通过 CH–π 相互作用实现结合。基于此,他们以天然存在的唾液酸化路易斯 X 抗原(Sialyl Lewis X)为蓝本设计聚糖催化剂。将 Sialyl Lewis X 中的 Neu5Ac 单元替换为 β - 连接的 Gal 单元,以形成 CH–π 相互作用并招募芳香底物;对 Gal、Fuc 和 GlcNAc 等单元进行一系列修改,优化聚糖结构,使其更适合催化。
2. 利用 CH–π 相互作用招募芳香底物
研究人员通过自动聚糖组装(Automated Glycan Assembly,AGA)制备了初始目标聚糖框架 4mer - I 。利用多种 NMR 实验对其进行分析,NOESY 分析和 MD 模拟证实了其刚性构象以及 Gal 臂的正确取向。以 Trp 为模型底物进行 CH–π 相互作用分析,实验发现 4mer - I 与 Trp 孵育后,Gal 单元出现化学位移变化,表明二者存在 CH–π 相互作用。合成 5mer 进一步验证,5mer 中 Gal 的 α - 面被 Glc 阻碍,与 Trp 的 CH–π 相互作用减弱,证明 4mer - I 可通过 Gal 单元的 CH–π 相互作用识别芳香底物。