《Nature》HIV-1 新发现:SP2 肽触发 MA 晶格成熟的关键机制

【字体: 时间:2025年02月27日 来源:Nature 50

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  为探究 HIV-1 中 MA 晶格成熟机制,研究人员开展相关研究,发现 SP2 肽是 MA 成熟的触发因子,对理解病毒感染机制意义重大。

  

在病毒的微观世界里,HIV-1(人类免疫缺陷病毒 1 型)如同一个隐藏在暗处的 “杀手”,持续威胁着人类健康。HIV-1 的感染过程十分复杂,其中病毒的成熟机制一直是科研人员关注的焦点。HIV-1 在感染细胞后,会释放出不成熟、无感染性的病毒颗粒。这些颗粒要经历一系列的结构变化,才能转变为具有感染性的成熟病毒。在这个过程中,主要结构多聚蛋白 Gag(Group-specific antigen)的蛋白水解切割起着关键作用,它会被切割成多个功能域,进而诱导病毒颗粒重排形成成熟、有感染性的病毒体。其中,MA(matrix)结构域负责在病毒组装过程中将 Gag 招募到宿主细胞膜上,在病毒生命周期中扮演着重要角色。此前研究发现,MA 在不成熟病毒颗粒中会形成六聚体蛋白晶格,在成熟过程中,这个晶格会发生结构转变。然而,MA 晶格成熟的具体机制却一直是个未解之谜,这也阻碍了人们对 HIV-1 感染机制的深入理解,影响了相关治疗策略的开发。

为了揭开这一谜团,相关研究人员开展了深入研究。他们的研究成果发表在《Nature》杂志上。这项研究具有重要意义,不仅揭示了 HIV-1 两个组分之间一种全新的、出乎意料的相互作用,还提供了成熟 MA 的高分辨率结构,确定了 MA 结构成熟的触发因素,并明确了 SP2 肽的功能,为深入理解 HIV-1 的感染机制和开发新的治疗方法提供了关键线索。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。其中,冷冻电镜(cryo-EM)技术发挥了核心作用,通过该技术,研究人员能够获得病毒颗粒中 MA 晶格的高分辨率结构,直观地观察 MA 晶格在不同状态下的细微结构变化。此外,研究人员还构建了多种 Gag 切割位点突变体,利用这些突变体来研究不同切割状态对 MA 晶格成熟的影响,从而确定 MA 晶格成熟所涉及的具体加工步骤。

下面详细介绍研究结果:

  1. 高分辨率病毒内 MA 结构:研究人员应用原位单颗粒分析技术,成功获得了完整病毒内不成熟和成熟 MA 晶格的高分辨率结构。通过对大量数据集的处理和分析,他们克服了其他病毒成分的干扰密度,分别得到了不成熟(PR?)病毒颗粒、成熟病毒颗粒以及 MA-SP1 病毒颗粒中 MA 晶格的重建结构,分辨率分别达到 5.8 ?、3.8 ? 和 3.1 ?。在成熟 MA 晶格中,研究人员发现了一些关键的结构特征,如特定的环参与了三聚体间的相互作用,形成了稳定的界面。同时,他们还发现之前认为与 MA 结合的脂质实际上并不是 MA 成熟的配体,这为后续研究指明了新方向。

  2. Gag 加工对 MA 的影响:研究人员通过制备多种 Gag 切割位点突变体,包括 MA-SP2、MA-NC、MA-SP1:NC-p6 和 NC-p6 等,并利用冷冻电镜对这些突变体的 CA 和 MA 晶格进行表征。通过分析 2D 类平均图像中 MA 层的重复间距,研究人员发现,MA-SP1:NC-p6 和 NC-p6 保留了不成熟的 MA 晶格,而 MA-NC 具有成熟的 MA 晶格结构,MA-SP2 则具有不成熟的 MA 晶格。这些结果表明,NC-SP2-p6 部分的切割,而不是该部分与 MA-SP1 的分离,是 MA 晶格成熟所必需的,并且 SP2 肽的释放与 MA 成熟相关。

  3. SP2 释放与快速融合相关:由于高效的 HIV-1 融合依赖于 Gag 成熟,研究人员利用相同的 Gag 切割突变体来测量 MA 成熟对病毒融合的影响。他们使用了一种基于分裂纳米荧光素酶互补的检测方法,结果发现,未成熟颗粒的膜融合速度比野生型成熟颗粒慢两倍,而当 SP2 从 Gag 中释放时,膜融合速度加快两倍,达到野生型颗粒的水平。这表明 SP2 的释放和 MA 的成熟与野生型样的融合动力学相关。

  4. 游离 SP2 与病毒内 MA 结合:为了探究远处的 SP2 肽释放如何影响与细胞膜结合的 MA 的成熟,研究人员推测 SP2 与 MA 的直接结合可能是 MA 成熟的触发因素。通过一系列实验,他们发现 SP2 的六个 C 末端残基可以自信地拟合到成熟 MA 晶格的冷冻电镜密度中,并且在没有任何输入序列的情况下,自动模型构建也能得到与最终模型匹配的 SP2 肽序列。此外,他们还发现结合的 SP2 通过多种相互作用固定在 MA 上,并似乎有助于成熟 MA 晶格中三聚体间相互作用的形成。

  5. MA 成熟的体外重建:为了验证 SP2 是否足以诱导成熟 MA 晶格的形成,研究人员使用体外重组系统进行研究。他们将纯化的重组肉豆蔻酰化 MA 蛋白在有无 SP2 的情况下添加到模拟 HIV-1 膜内层的脂质单层上,通过冷冻电镜观察发现,在没有 SP2 时,只有少量亚图像显示出成熟样的 MA 晶格;而在有 SP2 存在时,大量亚图像显示出成熟样的 MA 晶格,且在成熟样 MA 晶格中存在与 SP2 对应的额外密度。这表明 SP2 可以通过结合到 MA 的特定裂隙中,在没有任何其他成分的情况下诱导形成成熟的、膜结合的 MA 晶格。

在讨论部分,研究人员指出,SP2 肽在从 Gag 蛋白水解释放后,作为 MA 晶格成熟的触发因子,并成为成熟 MA 晶格三聚体间接触的重要组成部分。SP2 序列的高度保守以及其在病毒成熟过程中的关键作用,表明 SP2 切割和 MA 成熟为病毒带来了复制优势。此外,MA 成熟与病毒获得完全融合能力相关,虽然 HIV-1 突变体 NC-SP2 在标准细胞培养试验中没有明显的感染缺陷,但 MA 处于未成熟状态时较慢的融合动力学可能在原代细胞中受到限制,这为病毒的快速融合提供了进化优势。同时,研究还发现 MA 结合 SP2 的口袋具有多功能性,其配体的交换可能决定了 MA 在病毒复制周期中的功能变化。并且,SP2 介导的 MA 成熟与 SP1 调节 CA 晶格成熟存在相似之处,两者都是通过 Gag 多聚蛋白的蛋白水解切割,在不成熟病毒颗粒向成熟、有感染性的病毒体转化过程中发挥核心作用。

总的来说,这项研究成果揭示了 HIV-1 中 MA 晶格成熟的关键机制,为深入理解 HIV-1 的感染机制提供了重要依据。未来,基于这些发现,有望开发出针对 HIV-1 感染的新型治疗策略,为抗击艾滋病带来新的希望。但目前的研究仍存在一些局限性,如在复杂系统中更接近体内感染条件下的研究还需要进一步开展,以全面了解 MA 成熟对 HIV-1 传播和发病机制的功能相关性。

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