机器学习助力揭示疟蚊抗药与敏感品系飞行行为差异,为防控提供新视角

【字体: 时间:2025年02月26日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为解决疟蚊杀虫剂抗性(IR)问题,利物浦热带医学院研究人员开展基于飞行轨迹数据区分 IR 和杀虫剂敏感(IS)疟蚊行为的研究,发现二者飞行行为存在差异,为蚊媒控制策略提供依据。

  在热带的夜晚,当人们试图在蚊帐的庇护下安然入睡时,疟蚊却在蚊帐周围徘徊,伺机寻找叮咬机会。疟疾,这个由疟蚊传播的致命疾病,每年夺走约 100 万人的生命,非洲地区深受其害,占全球病例和死亡人数的 90% 以上。长期以来,杀虫剂处理过的蚊帐(ITNs)是非洲预防疟疾的主要手段,使用比例从 2000 年的不到 5% 大幅提升至 2015 年的 50% 以上,这使得疟疾死亡人数有所下降。然而,近年来疟疾发病率和死亡率却趋于平稳,难以进一步降低。
问题的关键在于疟蚊对杀虫剂产生了抗性(IR)。自大规模使用 ITNs 近 25 年来,疟蚊对其中的拟除虫菊酯类杀虫剂抗性迅速蔓延。抗性的产生源于疟蚊生理变化,如减少杀虫剂到达靶点的量、降低与靶点的结合力,或形成减少接触杀虫剂的行为机制 。在主要的非洲疟疾传播媒介冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)中,多种导致行为或生理抗性的机制已被报道。而且,疟蚊的叮咬模式也发生了改变,更多在户外叮咬,这使得每年新增数百万疟疾病例。尽管如此,ITNs 的使用仍能预防大部分蚊虫叮咬。但目前对于生理抗性机制与疟蚊行为之间的联系了解甚少,生物测定方法和测量疟蚊行为能力的局限性,限制了人们对拟除虫菊酯抗性与疟蚊和 ITNs 相互作用关系的理解。
为了深入探究这一复杂的关系,利物浦热带医学院的研究人员开展了一项重要研究。他们利用机器学习模型,详细分析疟蚊的飞行轨迹,试图识别出在接触杀虫剂之前,IR 和杀虫剂敏感(IS)疟蚊种群的基本或固有行为差异,并通过可解释人工智能(XAI)技术来解读模型,以揭示抗性与行为之间的潜在联系。这项研究成果对于理解疟蚊行为、优化蚊媒控制策略具有重要意义,研究发表于Scientific Reports
在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先,他们在实验室构建了定制的自由飞行气候控制测试室,模拟自然环境,使用特定的摄像系统对疟蚊进行跟踪记录,获取其飞行轨迹数据。然后,采用滑动窗口法将轨迹分割成固定时长的片段,统一轨迹时长并消除时长偏差。通过线性插值处理轨迹中的缺失数据,并引入片段质量指标去除数据偏差较大的片段。接着,从轨迹片段中提取形状描述符和运动学特征等多种特征,并运用 Mann-Whitney U 检验和 Spearman 相关矩阵进行特征选择。最后,使用逻辑回归、随机森林和 XGBoost 等分类模型进行训练和评估,并利用 XAI 技术中的 SHAP 值进行模型解释 。
研究结果如下:
  • 数据处理:通过超参数调整,确定了不同模型的最佳窗口参数,这些参数影响了用于建模的数据集中的轨迹数量和片段数量。
  • 模型评估 —— 杀虫剂抗性状态分类:研究对比了逻辑回归、随机森林和 XGBoost 三种模型对 IR 和 IS 疟蚊的分类性能。结果显示,三种模型的分类性能均显著优于随机分类。其中,XGBoost 模型表现最佳,平衡准确率达到 0.743,ROC 曲线下面积(AUC)为 0.813。通过 SHAP 分析发现,垂直方向速度、分形维数等是区分 IR 和 IS 疟蚊的重要特征。IR 疟蚊在垂直方向飞行速度较慢,分形维数较低,飞行轨迹更直接,消耗能量较少,且能更有效地根据环境线索调整轨迹。
  • 模型评估 —— 探索疟蚊品系差异:研究人员进一步探索了不同疟蚊品系之间的差异。在分类杀虫剂敏感品系(Kisumu 和 N’goussu)时,XGBoost 模型的平衡准确率与随机性能无显著差异;分类杀虫剂抗性品系(Banfora 和 VK7)时,结果同样不显著。而在多类分类(区分所有四个品系)中,模型的平衡准确率显著高于随机基线,表明不同品系之间存在可区分的行为差异。其中,Kisumu 品系更容易区分,而 VK7 品系则较难区分 。
    研究结论与讨论部分指出,机器学习模型能够基于疟蚊的固有飞行轨迹特征成功区分不同品系。IR 和 IS 疟蚊在飞行行为上存在明显差异,IR 疟蚊飞行速度较慢、轨迹更直接,这可能是一种在寻找宿主过程中的适应性策略,但也可能意味着它们在能量利用上存在权衡。研究还发现,不同抗性品系和敏感品系之间既有共性,也有独特的行为特征。此外,XGBoost 模型在分类任务中表现最佳,这表明疟蚊飞行行为特征之间存在复杂的非线性关系。不过,该研究也存在一定局限性,如仅考虑了 4 种疟蚊品系,所得行为差异可能不适用于所有 IR 和 IS 品系。未来研究应扩大样本范围,探索疟蚊在接触多种 ITN 杀虫剂时的行为。总体而言,这项研究为理解疟蚊杀虫剂抗性与行为之间的关系提供了新的视角,有助于开发更有效的蚊媒控制策略,对疟疾防控具有重要意义。
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