基于植物几何特征的生菜鲜重估算:突破与展望
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时间:2025年02月26日
来源:Plant Methods 4.7
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为解决现有生菜鲜重估算模型的局限性,自然资源研究所芬兰(Luke)的研究人员开展基于植物几何特征估算生菜鲜重的研究,提出新方法,为相关领域提供新思路。
在农业生产的大舞台上,准确监测植物生长状况如同掌握丰收的密码。生菜,作为备受青睐的叶菜类蔬菜,其生长监测至关重要。过去,人们依靠传统方法判断生菜的生长阶段,但这些方法既耗时费力,又难以精准把握生菜的真实生长情况。随着科技的发展,利用颜色和深度(RGBD)相机对生菜进行建模成为热门之选,深度学习技术也被广泛应用于生菜鲜重(FW)的估算。
然而,看似一片光明的研究道路却布满荆棘。现有基于深度学习的模型存在诸多问题,它们往往只适用于特定的数据集,缺乏在不同场景下的适应性,就像一把只能开一把锁的钥匙。而且,公开可用的数据集数量有限,这就如同巧妇难为无米之炊,限制了模型的进一步优化和发展。此外,常见的生菜监测和育种所关注的性状,如鲜重、干重、株高、直径和叶面积等,并不能全面反映生菜的内部结构信息,比如叶密度和分布情况。这些信息对于准确估算生菜鲜重以及开展育种工作至关重要,但却被忽视了。
在这样的背景下,自然资源研究所芬兰(Luke)的研究人员挺身而出,决心攻克这些难题。他们开展了一项旨在通过植物几何特征来估算生菜莲座结构和体积,进而估算生菜鲜重的研究。这一研究成果意义非凡,为生菜的精准种植和科学育种提供了全新的视角和有力的工具。目前,该研究成果尚未提及发表在具体哪一期刊。
研究人员为开展此项研究,运用了多种关键技术方法。在测量系统方面,搭建了由四个 3D 相机(D405,Intel RealSense)组成的测量框架,从三个侧面和顶部对生菜进行 3D 成像,并通过坐标变换将多相机捕获的点云合并为一个点云,同时利用校准技术提高测量精度。在表面重建环节,针对生菜叶片结构复杂、3D 建模困难的问题,开发了基于物理类比的真空包装算法,有效解决了表面孔洞和细节保留的难题。在数据分析阶段,计算多种几何特征,并运用简单和多元线性回归模型预测生菜鲜重,同时使用均方根误差(RMSE)和归一化均方根误差(NRMSE)评估模型准确性。
研究结果如下:
- 植物特征差异:研究选取了编号 40 和 72 的生菜植株,它们的参考鲜重相近,但莲座尺寸明显不同,估算的体积(V)和平均波幅(Amp)差异显著,而株高(Height)相近。这表明即使鲜重相似,生菜的内部结构差异也会对体积估算产生影响。
- 表面重建与鲜重预测相关性:不同表面重建算法的鲜重估算准确性相近,但回归直线斜率差异显著,反映出表面重建细节水平的差异。利用真空包装算法结合顶部和侧面 3D 图像进行鲜重预测,准确性更高。这说明该算法在处理复杂结构的生菜表面重建时具有优势,能更准确地估算鲜重。
- 鲜重与植物特征相关性:在简单回归中,V 与 FW 的相关性最强;在多元回归模型中,所有高精度方程都包含 V。虽然纳入额外特征理论上可提高预测准确性,但在该研究数据集中未明显体现。这表明 V 在预测生菜鲜重中起着关键作用,而其他特征的影响还需进一步研究。
- 几何特征相关性:V 和 Height 呈现强相关性,Amp 与 V 无相关性。这为理解生菜的几何特征之间的关系提供了依据,有助于更深入地分析生菜的结构与鲜重之间的联系。
- 校准准确性:校准准确性在不同时间有所波动,3 月 9 日为 2.6mm,4 月 4 日为 6.2mm。这说明校准过程存在一定的误差,需要进一步优化校准方法,以提高测量的准确性。
研究结论和讨论部分指出,该研究提出的真空包装方法在仅使用顶部 3D 图像时,对生菜鲜重的估算误差与其他研究相当甚至更低。该方法针对生菜莲座结构特点进行表面重建,有效改善了鲜重预测,其回归模型能更准确地反映 V 与 FW 的关系。新提出的几何特征有助于表征生菜叶密度和结构,为育种和鲜重估算提供了新的视角。然而,研究也存在一定的局限性。3D 相机和校准的误差对鲜重预测准确性的影响需进一步分析,目前使用的校准方法有待改进。此外,由于研究仅基于一个有限范围的数据集,回归模型的普适性有待提高,需要更多样化的数据集来完善生菜鲜重估算方法。
总体而言,这项研究为生菜生长监测和鲜重估算开辟了新路径,虽然还有一些问题需要解决,但它为后续研究奠定了坚实基础,有望推动生菜种植和育种领域的进一步发展。
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