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为解决 α-syn 在帕金森病(PD)中的病理机制及 p-α-syn 相关疑问,研究人员开展 α-syn 丝氨酸 129 位点磷酸化研究。结果发现其对相关蛋白互作有调控作用。该研究为 PD 治疗提供潜在靶点,推荐科研读者阅读。
帕金森病(Parkinson’s Disease,PD)是一种常见的神经系统退行性疾病,它就像一个隐藏在身体里的 “小恶魔”,随着全球人口老龄化,越来越多的人受到它的困扰。得了帕金森病的人,不仅会出现运动方面的问题,比如手抖、行动迟缓,还可能有非运动症状,像睡眠障碍、嗅觉减退等,严重影响生活质量。
在帕金森病的研究中,α- 突触核蛋白(α-synuclein,α-syn)成为了大家关注的焦点。它是患者病变组织中蛋白质聚集体的主要成分,与帕金森病的发生紧密相关,甚至被看作是诊断帕金森病的 “金标准”。不过,虽然科学家们在研究 α-syn 方面取得了一些进展,但它在帕金森病发生过程中的具体机制,就像一团迷雾,还没有完全被揭开。
进一步深入研究发现,α-syn 的磷酸化修饰与帕金森病的发展有着千丝万缕的联系。尤其是 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化(pSer 129 α-syn,p-α-syn),在病理状态下,这个位点的磷酸化水平异常升高,参与了 α-syn 的聚集、与细胞膜的结合以及细胞内吞等过程。因此,不少研究人员尝试用 p-α-syn 抗体来检测帕金森病患者外周组织和生物流体中的 α-syn 病变情况,希望以此找到诊断和监测疾病进展的方法。然而,p-α-syn 在帕金森病病理过程中的精确机制,特别是它与非磷酸化 α-syn 的差异,仍然是个未解之谜。
与此同时,科学家们还注意到,帕金森病的病理过程和线粒体相关内质网膜(Mitochondria-Associated Endoplasmic Reticulum Membranes,MAMs)的功能障碍有关。MAMs 就像是细胞内的一个 “信息交流站”,参与钙信号传导、脂质代谢和自噬等重要细胞过程。在 MAMs 上,有两种关键蛋白,分别是囊泡相关膜蛋白相关蛋白 B(Vesicle-Associated Membrane Protein Associated Protein B,VAPB)和线粒体外膜蛋白酪氨酸磷酸酶相互作用蛋白 51(Tyrosine Phosphatase Interacting Protein 51,PTPIP51)。之前有研究发现,α-syn 能够与 VAPB 结合,还会破坏 VAPB-PTPIP51 之间的连接,影响 MAMs 的功能。但 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化是否会调节 VAPB-PTPIP51 之间的相互作用,以及具体的调节方式,都还不清楚。
为了揭开这些谜团,来自相关研究机构的科研人员在《Acta Neuropathologica Communications》期刊上发表了题为 “Phosphorylation of alpha-synuclein at serine 129 regulates its interaction with VAPB and PTPIP51” 的论文。他们通过一系列实验研究,得出了许多重要结论,为帕金森病的研究开辟了新的道路。这些结论不仅有助于我们更深入地了解帕金森病的发病机制,还为开发治疗帕金森病及相关疾病的新方法提供了潜在的靶点,意义十分重大。
在这项研究中,科研人员运用了多种关键技术方法。他们通过蛋白质免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation,CO-IP)和质谱(Mass Spectrometry,MS)技术,鉴定和比较了 Thy1-SNCA 转基因小鼠中脑内磷酸化和总 α-syn 的相互作用蛋白;利用分子动力学(Molecular Dynamics,MD)模拟实验,进一步确认了 α-syn 磷酸化对相关蛋白相互作用的影响;还借助基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,对 p-α-syn 和 VAPB 的共同相互作用蛋白进行了功能注释。
下面我们来详细看看他们的研究结果。
鉴定 Thy1-SNCA 转基因小鼠中脑内 h-α-syn 和 p-α-syn 的相互作用蛋白
科研人员选用了 Thy1-SNCA 转基因小鼠作为实验对象,这种小鼠会过量表达人 α-syn(h-α-syn),能够模拟帕金森病的一些症状。他们先用 h-α-syn 和 p-α-syn 抗体进行 CO-IP 实验,再对感兴趣的蛋白条带进行 MS 分析。结果发现,h-α-syn 和 p-α-syn 的相互作用蛋白存在明显差异,这表明 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化可能对其与相关蛋白的相互作用起着关键的调节作用。
α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化增加了 VAPB 和 PTPIP51 之间的相互作用
通过 LC-MS/MS 分析,研究人员发现 p-α-syn 能够与 VAPB 和 PTPIP51 相互作用。为了进一步探究 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化对 VAPB-PTPIP51 相互作用的影响,他们在 SHSY5Y 细胞中进行了 IP 实验。结果惊喜地发现,α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化不仅证实了 p-α-syn 与 VAPB-PTPIP51 复合物的相互作用,还首次发现这种磷酸化会增强它们之间的相互作用。
α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化影响了 α-syn-VAPB-PTPIP51 复合物的动力学
为了深入了解 α-syn、VAPB 和 PTPIP51 之间的相互作用机制,科研人员运用 MD 模拟实验进行研究。他们预测了相关蛋白的结构和复合物的结合模式,结果显示,α-syn-VAPB-PTPIP51 和 p-α-syn-VAPB-PTPIP51 复合物在模拟时间内都达到了平衡状态。而且,p-α-syn-VAPB-PTPIP51 复合物中 VAPB 和 PTPIP51 的结合稳定性更高,这意味着 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化对复合物的稳定性有着重要影响。
α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化影响了 α-syn-VAPB 和 α-syn-PTPIP51 复合物的动力学
研究人员还分别研究了 p-α-syn 与 VAPB、PTPIP51 的结合相互作用,并与 α-syn 进行对比。通过 RMSD 和 RMSF 分析以及结合自由能的评估,他们发现 p-α-syn-VAPB 复合物的相互作用比 α-syn-VAPB 复合物更广泛、更复杂,p-α-syn 对 VAPB 的亲和力更高。这表明 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化改变了 α-syn 与 VAPB、PTPIP51 的相互作用模式。
鉴定和功能注释 Thy1-SNCA 转基因小鼠中脑内 VAPB 和 p-α-syn 的共同相互作用蛋白
为了探究 α-syn 过表达或其相互作用对 VAPB 功能的影响,科研人员进行了 CO-IP/MS 实验,鉴定出了 53 种 p-α-syn 和 VAPB 的高可信度共同相互作用蛋白。通过 GO 和 KEGG 分析发现,这些蛋白显著参与了蛋白质结合、金属离子结合、细胞骨架结构组成、中间丝细胞骨架和微管组织等过程,以及帕金森病相关的神经退行性疾病通路,这暗示着它们在帕金森病的发病机制中起着重要作用。
验证与 VAPB 和 p-α-syn 相互作用的下游蛋白
科研人员进一步比较了野生型(Wt)和转基因(Tg)小鼠中脑内 VAPB 的相互作用蛋白,发现有 15 种蛋白是 Tg 组特有的。经过 KEGG 通路富集分析,这些蛋白主要富集在突触小泡循环、钙重吸收、亨廷顿病和细菌侵袭上皮细胞等通路。通过 WB 分析和 CO-IP 实验,他们验证了 p-α-syn 与 CLTC、VAPB 与 CLTC、TUBB4B、CAMK2A、ATP1A3 等蛋白之间的相互作用,为揭示 p-α-syn 和 VAPB 在帕金森病中的协同作用提供了重要线索。
综合研究结果和讨论部分,这项研究意义非凡。研究人员发现 p-α-syn 抗体(CST,#23706)在检测和研究 p-α-syn 方面是个可靠的工具,为后续相关研究提供了有力支持。同时,他们证实了 p-α-syn 和 VAPB 在病理生理情况下,在突触小泡循环和钙重吸收通路中存在协同作用。更重要的是,明确了 α-syn 在丝氨酸 129 位点的磷酸化在调节其蛋白质相互作用组中起着关键作用,尤其是对 α-syn 与 VAPB-PTPIP51 的相互作用影响显著,这使得该位点成为治疗帕金森病及相关疾病的潜在重要靶点。这些发现就像一把把钥匙,为解开帕金森病的神秘面纱打开了新的大门,为未来攻克这一难题带来了新的希望。
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