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为探究颗粒相关 NCDs 的固氮潜力及差异,作者[第一作者单位] 研究人员开展北太平洋不同颗粒相关 NCDs 研究。结果发现 NCDs 在 FS 颗粒相对丰度高且固氮速率可观。这有助于理解海洋氮循环,推荐科研读者阅读。
在广阔无垠的海洋里,有一个至关重要的过程 —— 氮气(
)固定,它就像海洋生态系统的 “营养输送管”,把生物可利用的氮引入海洋,为海洋里的各种生物提供 “食物”,支撑着海洋的初级生产力。长久以来,科学家们都认为,海洋中的
固定主要是由生活在海洋光合层(能接收到阳光的表层海水区域)的蓝细菌主导的。就好像蓝细菌是这片 “海洋工厂” 里唯一的 “工人”,负责生产海洋生物所需的 “氮营养”。
然而,近年来,一些新的发现打破了这个传统认知。研究人员发现,非蓝细菌固氮菌(NCDs)在海洋里其实广泛存在,而且分布在各种各样的海洋环境中,比如上升流区域、无氧区、深海以及温带沿海地区。这些地方就像是海洋里不同的 “小天地”,NCDs 在其中都有自己的 “身影”。这让科学家们开始思考,难道 NCDs 在
固定过程中也扮演着重要角色?
更有意思的是,有研究猜测,海洋雪(海洋中由有机物和微生物等聚集形成的颗粒)或者其他有机颗粒,可能会为 NCDs 创造一个 “舒适的家”。这些颗粒就像一个个小小的 “庇护所”,不仅能提供低氧环境,还能给 NCDs 提供碳和能量资源。就好比给 NCDs 提供了一个有吃有住的 “小房子”,让它们可以安心 “工作”。但问题来了,虽然知道 NCDs 可能和这些颗粒有关系,可它们在颗粒上的
固定潜力到底有多大?不同类型的颗粒对 NCDs 的
固定又有什么影响呢?这些问题就像一团团迷雾,笼罩着科学家们,也促使他们开展进一步的研究。
为了揭开这些谜团,来自 作者[第一作者单位] 的研究人员在《Nature Communications》期刊上发表了一篇名为 “Particle - associated non - cyanobacterial diazotrophs contribute significantly to nitrogen fixation in the North Pacific Subtropical Gyre” 的论文。通过研究,他们得出了一系列重要结论,这些结论就像一把把钥匙,为我们打开了海洋
固定过程的新大门。他们发现,与快速下沉颗粒(FS)相比,NCDs 在快速下沉颗粒中的相对丰度更高,而且其中 γ - 变形菌(Gammaproteobacteria)是主要的 NCDs,尤其是海杆菌属(
)。同时,他们还发现不同类型颗粒(悬浮颗粒 SUSP、慢速下沉颗粒 SS 和快速下沉颗粒 FS )上的固氮菌群落差异很大,这意味着随着颗粒下沉,固氮菌群落会发生变化。而且,NCDs 的单细胞
固定速率和之前在海洋表层测得的速率处于同一数量级,这表明颗粒相关的 NCDs 在海洋中上层的
固定过程中发挥着重要作用。这些结论让我们对海洋中的
固定过程有了全新的认识,也为进一步研究海洋生态系统的氮循环提供了重要线索。
研究人员在这项研究中用到了几种关键技术方法。他们首先利用海洋雪采集器,在北太平洋 150 米深度采集了悬浮、慢速下沉和快速下沉的颗粒样本。然后,通过
标记实验,来追踪和测量颗粒上微生物的
固定速率。接着,运用催化报告沉积荧光原位杂交(CARD - FISH)技术结合纳米二次离子质谱(nanoSIMS),来识别和分析特定微生物(如 γ - 变形菌)的
固定活性。最后,对样本进行 DNA 提取、
基因测序及生物信息学分析,以此来研究固氮菌的群落组成和多样性。
下面我们来详细看看研究结果。
环境条件
研究人员在北太平洋的考察之旅中,发现海洋里的环境条件就像一个多变的 “小世界”。在不同的纬度和深度,各种环境因素都有很大的差异。叶绿素 a(Chl a)浓度和温度的变化就很有趣,在高纬度地区(大于 32°N),Chl a 浓度相对较高,温度却比较低;而在低纬度地区(小于 32°N),情况则相反。而且,Chl a 浓度在不同深度的变化也不一样,在不同的站点,Chl a 峰值出现在不同的深度,有的在 60 - 70 米,有的在 100 米,还有的在 130 米。温度也随着深度下降,从海洋表层的 15 - 27°C,下降到 150 米处的 12 - 22°C 。在 150 米深度,不同站点的磷酸盐(
)、硝酸盐和亚硝酸盐($NO_3^ - + NO_2^ -
Si(OH)_4$)浓度也各不相同,有的站点浓度高,有的站点浓度低。这些环境因素的变化,就像海洋里的 “小气候”,影响着海洋生物的生存和活动。
颗粒相关的固定速率
研究人员精心挑选了 5 个站点,对不同类型颗粒上的
固定速率进行分析。他们发现,通过显微镜测量,悬浮颗粒、慢速下沉颗粒和快速下沉颗粒的大小范围各不相同。而且,除了用 CARD - FISH 检测到的 γ - 变形菌,还有一些未被该技术检测到但显示
富集的细胞,研究人员把它们称为 “推定的 NCDs”。γ - 变形菌的单细胞
固定速率在不同颗粒类型中有所不同,在悬浮颗粒中通常较高,但不同颗粒类型之间的差异并不显著。有趣的是,推定的 NCDs 的单细胞
固定速率普遍比 γ - 变形菌高,而且在快速下沉颗粒中达到了最高值。这说明不同类型的颗粒,就像不同的 “工作平台”,对 NCDs 的
固定效率有着不同的影响。
固氮菌群落组成
研究人员对不同颗粒类型的
基因进行测序后发现,固氮菌群落的组成就像一个多样化的 “大家庭”。蓝细菌在悬浮颗粒和慢速下沉颗粒中通常占主导地位,但在快速下沉颗粒中,NCDs 的相对丰度明显增加。在 NCDs 这个 “小家庭” 里,γ - 变形菌又是主要成员,在不同站点的相对丰度有所变化。在进行单细胞
固定观测的站点,海杆菌属在所有颗粒类型中都占主导地位。而且,不同的环境条件似乎也影响着 NCDs 的种类分布,比如在温度较低的站点,假单胞菌(
)的相对丰度较高。这表明固氮菌群落的组成会随着颗粒类型和环境条件的变化而变化。
在讨论部分,研究人员发现,他们测量得到的 NCDs 单细胞
固定速率,和一些著名的蓝细菌固氮菌的速率相当。这意味着 NCDs 在海洋中上层可能扮演着和蓝细菌同样重要的角色,尤其是在这个光线有限、初级生产者相对较少的区域,NCDs 可能为海洋提供了重要的氮输入。但是,要准确量化它们对海洋中
固定的贡献,还需要知道不同大小颗粒的数量,以及被活跃 NCDs 定殖的颗粒比例。而且,不同类型颗粒对 NCDs 的影响也很有意思。悬浮颗粒含有较高的碳含量,这可能为 γ - 变形菌提供了足够的能量,所以它们在悬浮颗粒上的
固定活性较高。此外,研究还发现不同颗粒类型上的 NCDs 群落组成差异很大,这和之前的一些研究结果相符,说明随着颗粒下沉,微生物群落会发生变化。
总的来说,这项研究意义重大。它不仅揭示了不同颗粒类型与 NCDs 之间的关系,还表明颗粒相关的 NCDs 在海洋中上层的
固定过程中起着重要作用。这让我们对海洋生态系统的氮循环有了更深入的理解,也为后续研究海洋生态系统的变化和发展提供了重要的理论基础。未来,科学家们还需要进一步研究,以更准确地评估 NCDs 在海洋氮循环中的贡献,探索它们在不同海洋环境中的作用机制,为保护和管理海洋生态系统提供更多的科学依据。
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