揭秘子痫前期:铁死亡相关基因成诊断与治疗新希望

【字体: 时间:2025年02月22日 来源:BMC Pregnancy and Childbirth 2.8

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  为解决子痫前期(PE)早期诊断和治疗手段有限的问题,福建医科大学附属第一医院的研究人员开展 FRGs 在 PE 中作用的研究。结果发现 4 个关键基因,可作诊断标志物和治疗靶点。推荐科研读者阅读,助于深入了解 PE 发病机制与诊疗新方向。

  
子痫前期(Preeclampsia,PE)是一种严重的妊娠期并发症,就像孕期里突然闯入的 “小怪兽”,给准妈妈和宝宝的健康带来极大威胁。它通常在怀孕 20 周后出现,表现为高血压和终末器官功能障碍,全球有 2 - 8% 的孕妇会受到它的影响。可别小瞧了这个 “小怪兽”,它可是导致母婴死亡的重要原因之一。但尴尬的是,尽管它如此 “嚣张”,我们对它的病因和病理却知之甚少。目前的治疗手段也比较有限,大多只能控制高血压、加强母婴监测,实在没办法了就只能提前终止妊娠,这对妈妈和宝宝来说都是不小的挑战。所以,找到新的方法来早点发现、准确诊断并有效治疗子痫前期,成了医学界的当务之急。

在探索子痫前期秘密的道路上,科研人员发现了一个有趣的 “线索”—— 铁死亡(Ferroptosis)。这是一种铁依赖的细胞死亡方式,和我们熟悉的细胞凋亡、坏死、自噬都不一样。近年来,它在多种疾病的研究中都备受关注,就像一颗闪亮的 “新星”。有研究暗示,铁死亡可能在子痫前期的发病过程中扮演着重要角色,这给科研人员带来了新的希望。

为了揭开子痫前期和铁死亡之间的神秘面纱,福建医科大学附属第一医院的研究人员在《BMC Pregnancy and Childbirth》期刊上发表了题为 “Identification and validation of ferroptosis-related genes as diagnostic biomarkers and therapeutic targets for preeclampsia” 的论文。他们通过一系列研究,找到了 4 个与铁死亡相关的关键基因(NDRG1、P4HA1、LDHA 和 IDO1),这些基因就像是打开子痫前期诊断和治疗新大门的 “钥匙”,为我们理解子痫前期的发病机制提供了新的视角,也为开发新的诊断方法和治疗策略带来了希望。

研究人员为了开展这项研究,用了不少厉害的技术方法。他们从公共数据库(GEO)里下载了相关的基因表达数据,还收集了 ferroptosis - related genes(FRGs,铁死亡相关基因 )的数据。然后利用 R 语言相关的软件包,对这些数据进行各种分析,像找出差异表达基因、进行富集分析等。还用到了一些算法,比如 RandomForest 和 LASSO 算法,来筛选关键基因。另外,通过免疫组化、Western blot 和 RT - qPCR 等实验技术,在胎盘组织和细胞中验证基因的表达情况。

下面来看看研究人员都有哪些重要发现吧:

  • FRDEGs 的鉴定:研究人员利用‘limma’ R 包分析了子痫前期患者和正常孕妇胎盘组织的基因表达数据,发现了 354 个差异表达基因。接着,他们像 “寻宝” 一样,把这些差异表达基因和已知的 FRGs 进行交叉比对,最终找到了 25 个与铁死亡相关的差异表达基因(FRDEGs)。这 25 个基因里,有的在子痫前期患者中表达升高,有的则降低。研究人员还通过绘制火山图、维恩图和热图,把这些基因的差异表达情况清晰地展示了出来。
  • FRDEGs 的富集分析和 PPI 网络构建:为了搞清楚这 25 个 FRDEGs 都在忙些什么,研究人员进行了 GO 和 KEGG 富集分析。结果发现,这些基因主要参与了细胞对酸性化学物质的反应、髓鞘形成等生物学过程,还和氧化还原酶复合物、葡萄糖跨膜转运等功能有关。在 KEGG 分析中,他们发现这些基因与铁死亡、PPAR 信号通路、HIF - 1 信号通路等密切相关。此外,他们还构建了 PPI 网络,发现 LDHA 这个基因在网络中特别 “活跃”,和很多其他基因都有相互作用。
  • 关键基因的鉴定和诊断模型的构建:从 25 个 FRDEGs 里找到最关键的基因可不是件容易的事,研究人员利用 RandomForest 和 LASSO 回归分析这两个 “得力助手”,经过一番筛选,确定了 11 个重要的 FRDEGs,又从中挑选出 4 个核心的 hub 基因,分别是 NDRG1、P4HA1、LDHA 和 IDO1。他们用这 4 个 hub 基因构建了诊断模型,通过绘制 ROC 曲线进行评估,发现这个模型在训练数据集和验证数据集中都表现出色,有着很高的诊断准确性,就像一个精准的 “探测器”,能帮助医生更好地诊断子痫前期。
  • 免疫浸润分析:免疫细胞在子痫前期的发生发展中也起着重要作用。研究人员用 CIBERSORT 算法分析了免疫细胞的浸润情况,发现子痫前期患者和正常孕妇的免疫细胞组成有很大不同。比如,子痫前期患者的浆细胞、CD8? T 细胞和嗜酸性粒细胞增多,而单核细胞和 M2 巨噬细胞减少。进一步研究发现,这 4 个 hub 基因和不同的免疫细胞之间有着复杂的关联,它们之间的 “互动” 可能影响着子痫前期的病情发展。
  • hub 基因的相互作用网络分析:为了了解这 4 个 hub 基因和其他分子之间的关系,研究人员利用 ENCORI 数据库预测了与它们相互作用的 miRNA,还通过 CHIPBase 数据库找到了相关的转录因子(TFs)。他们构建了 mRNA - miRNA 和 mRNA - TF 相互作用网络,发现这些基因和很多 miRNA、TFs 都有相互作用,形成了一个复杂而有序的 “网络世界”,这有助于我们深入理解这些基因的调控机制。
  • 潜在治疗药物的预测:找到治疗子痫前期的 “神奇药物” 是大家都期待的。研究人员利用 DGIdb 数据库进行药物 - 基因相互作用分析,发现有 19 种药物可能与 3 个 hub 基因(P4HA1、LDHA 和 IDO1)相互作用。其中,Tetrahydro - NAD 对 LDHA 的抑制作用最强,看起来很有成为治疗药物的潜力,为未来的药物研发提供了新的方向。
  • hub FRGs 在 PE 胎盘组织中的差异表达:研究人员通过免疫组化分析,对比了子痫前期患者和正常孕妇胎盘组织中 hub FRGs 的表达情况。结果发现,NDRG1、P4HA1 和 LDHA 在子痫前期胎盘组织中的表达明显升高,而 IDO1 的表达则降低,这进一步证实了这些基因在子痫前期发病过程中的重要作用。
  • 缺氧条件下 hub FRGs 及其蛋白产物的表达:在模拟缺氧的环境下培养 HTR - 8/SVneo 细胞,研究人员发现,和正常条件相比,NDRG1、P4HA1 和 LDHA 的转录水平和蛋白水平都升高了,而 IDO1 则降低了。这表明缺氧可能会影响这些基因的表达,进而参与子痫前期的发病过程。

综合这些研究结果,研究人员发现的这 4 个 hub FRGs(NDRG1、P4HA1、LDHA 和 IDO1)在子痫前期的诊断和治疗方面有着巨大的潜力。它们可以作为新的诊断标志物,帮助医生更早、更准确地发现子痫前期,就像给医生配备了更敏锐的 “眼睛”。同时,这些基因相关的调控网络和潜在治疗药物的发现,也为开发新的治疗方法提供了方向,让我们离攻克子痫前期这个难题又近了一步。

不过,研究人员也很谦虚地指出,这项研究还存在一些不足。比如,虽然用了综合的生物信息学分析和一些实验验证,但对具体机制的研究还不够深入,就像只看到了冰山一角。而且研究使用的原始数据处理方法有一定局限性,数据集也来自相对传统的微阵列技术。未来还需要更多大规模的前瞻性临床试验和更深入的分子生物学实验,来进一步验证这些基因在子痫前期中的作用机制。

尽管如此,这项研究仍然意义重大。它为我们打开了一扇了解子痫前期发病机制的新窗户,让我们看到了铁死亡和免疫细胞在其中的奇妙 “互动”。相信在科研人员的不断努力下,未来我们一定能找到更有效的方法来预防和治疗子痫前期,让准妈妈们能更加安心地迎接新生命的到来。

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