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为明确 ZFP36L2 在宿主抵御黄病毒感染中的作用及机制,研究人员开展相关研究。结果发现 ZFP36L2 通过 XRN1 介导的 RNA 降解途径抑制黄病毒复制。该研究为理解 ZFP36L 家族抗病毒机制提供新视角,值得科研读者一读。
在神秘的细胞世界里,病毒与细胞的对抗无时无刻不在上演。细胞为了抵御病毒入侵,进化出了一套又一套的防御机制,其中细胞 RNA 降解机制在抗病毒防御中起着至关重要的作用。像干扰素(IFN)诱导的 2′,5′- 寡腺苷酸合成酶(OAS)和它下游的效应物核糖核酸酶 L(RNase L)组成的系统,还有锌指抗病毒蛋白(ZAP,即锌指 CCCH 型抗病毒 1 蛋白 ZC3HAV1),它们都是细胞防御病毒的 “得力干将”。ZAP 能直接结合病毒 RNA,再召集细胞 mRNA 降解机器来降解病毒 RNA 转录本。
锌指蛋白 36 样(ZFP36L)家族也是细胞防御大军中的一员,这个家族包括 ZFP36L1 和 ZFP36L2,它们属于 CCCH 型 RNA 结合蛋白。之前有研究发现,ZFP36L1 能通过 5′ - 3′ XRN1 和 3′ - 5′ RNA 外切体降解途径来对抗黄病毒感染。但 ZFP36L2 在宿主抵御黄病毒感染过程中扮演着怎样的角色,它的抗病毒机制又是什么,这些问题一直困扰着科学家们。
为了揭开这些谜团,研究人员在不懈努力。[第一作者单位] 的研究人员在《Journal of Biomedical Science》期刊上发表了题为 “Zinc finger protein 36 - like 2 inhibits flavivirus infection through XRN1 - mediated RNA decay pathway” 的论文。他们发现,ZFP36L2 就像细胞里的 “抗病毒卫士”,能通过 XRN1 介导的 RNA 降解途径,在病毒复制复合物(RCs)中结合并降解黄病毒的 RNA,从而抑制黄病毒的复制。这一发现,让我们对 ZFP36L 家族的抗病毒机制有了更深入的了解,为未来对抗黄病毒感染提供了新的思路和方向。
研究人员在探索过程中,用到了几个关键的技术方法。他们利用慢病毒载体技术,构建了过表达或敲低 ZFP36L2 的细胞系;采用噬斑实验来测定病毒滴度;运用免疫荧光和实时定量聚合酶链反应(PCR)来检测病毒 RNA 水平;通过体外转录带有荧光素酶报告基因的 RNA 转录本,评估黄病毒 RNA 的稳定性;还使用 RNA 免疫沉淀实验检测蛋白与 RNA 的结合能力,借助共聚焦显微镜分析蛋白的共定位情况 。
下面我们来看看研究人员通过这些技术方法得到了哪些有趣的结果。
- 过表达的 ZFP36L1 和 ZFP36L2 抑制 JEV 和 DENV 感染:研究人员给 A549 细胞 “注射” 慢病毒载体,让它们分别过表达 HA 标记的 ZFP36L1、ZFP36L2,或者作为对照的增强型绿色荧光蛋白(EGFP)。然后,让这些细胞感染日本脑炎病毒(JEV)和登革热病毒(DENV)。结果发现,和对照组相比,过表达 ZFP36L1 和 ZFP36L2 的细胞里,病毒 NS3 蛋白的水平下降了,而且通过噬斑实验检测发现,感染性病毒粒子的产生也明显减少了。在其他相关的人类细胞系,比如人神经母细胞瘤 SK - N - SH 细胞(针对 JEV)和人脐静脉内皮细胞(HUVECs,针对 DENV)中,也观察到了 ZFP36L2 的这种抗病毒效果。这就说明,ZFP36L1 和 ZFP36L2 就像两把 “抗病毒利剑”,能有效抑制 JEV 和 DENV 的感染。
- 敲低内源性 ZFP36L2 增强 JEV 和 DENV 复制:研究人员又做了相反的实验,他们敲低 A549 细胞里的 ZFP36L2。结果发现,和对照组相比,JEV 和 DENV 在这些细胞里的复制能力增强了。而且,在 JEV 和 DENV 感染细胞的过程中,内源性 ZFP36L2 的水平在感染后期会明显上升。这就好像 ZFP36L2 是细胞里的 “刹车”,能抑制病毒的复制,当 “刹车” 被松开(ZFP36L2 被敲低),病毒就开始疯狂复制了。
- ZFP36L2 通过破坏病毒 RNA 稳定性限制 JEV 复制:研究人员继续深入研究,他们以 JEV 为模型,观察过表达 ZFP36L1、ZFP36L2 和 EGFP 的细胞中病毒 RNA 的水平。免疫荧光实验(IFA)和实时定量 PCR 结果都显示,过表达 ZFP36L1 和 ZFP36L2 的细胞中,JEV RNA 水平明显降低。研究人员还构建了可诱导表达 HA 标记的 ZFP36L1 和 ZFP36L2 的 HEK T - REx - 293 细胞系,将体外转录的带有海肾荧光素酶报告基因的 JEV 复制子 RNA 转染到这些细胞中。结果发现,ZFP36L1 和 ZFP36L2 的过表达会影响复制子 RNA 水平和荧光素酶报告基因的表达。这表明,ZFP36L2 和 ZFP36L1 一样,能让黄病毒 RNA 变得不稳定,从而干扰病毒的复制。
- ZFP36L2 的锌指基序对其病毒 RNA 结合活性和抗病毒作用至关重要:ZFP36L2 有两个 CCCH 型锌指基序,这两个基序被认为和 RNA 结合能力有关。研究人员构建了一个锌指突变体(C174R/C212R),结果发现,这个突变体和野生型 ZFP36L2 相比,失去了病毒 RNA 结合能力。用共聚焦显微镜观察发现,野生型 ZFP36L2 能和病毒 RNA 在细胞质的核周区域共定位,而突变体却不行。而且,通过蛋白质免疫印迹实验和噬斑实验发现,突变体对 JEV 和 DENV 的抗病毒活性也消失了。这就说明,ZFP36L2 的锌指基序就像它的 “抓手”,没有了这个 “抓手”,它就抓不住病毒 RNA,也就无法发挥抗病毒作用了。
- ZFP36L1 和 ZFP36L2 在黄病毒感染过程中存在不同的抗病毒途径:ZFP36L 家族的蛋白会和细胞 RNA 降解机制的一些成分相互作用,比如 5′ - 3′核酸外切酶 XRN1 和 3′ - 5′ RNA 外切体复合物。之前研究发现,ZFP36L1 的抗病毒活性是通过这两条途径实现的。那么 ZFP36L2 呢?研究人员通过慢病毒转导,敲低过表达 ZFP36L1、ZFP36L2 和 EGFP 细胞中的 XRN1 和 3′ - 5′外切体成分(EXOSC5),然后检测这些细胞的抗病毒能力。结果发现,ZFP36L1 的抗病毒作用依赖于 5′ - 3′ XRN1 和 3′ - 5′ RNA 外切体这两条途径,而 ZFP36L2 则只依赖 5′ - 3′ XRN1 介导的 RNA 降解途径。这表明,虽然 ZFP36L1 和 ZFP36L2 都是抗病毒的 “卫士”,但它们在对抗黄病毒时走的是不同的 “路线”。
- ZFP36L2 定位到加工小体(PBs)并非其抗病毒活性所必需:ZFP36L 家族的 TTP 和 ZFP36L1 蛋白会定位到应激颗粒(SGs)和加工小体(PBs)中。研究人员发现,ZFP36L2 也和 PBs 的标记蛋白 Dcp1a 以及 SGs 的标记蛋白 G3BP1 存在共定位现象,这说明 ZFP36L2 和 PBs、SGs 都有关系。但是,ZFP36L2 在病毒感染细胞中的抗病毒作用和它定位到 PBs 之间有没有关系呢?研究人员利用慢病毒敲低真核翻译起始因子 4E - 转运蛋白(eIF4E - T),破坏 PBs 的形成。结果发现,虽然 PBs 的形成受到了影响,但 ZFP36L2 的抗病毒活性并没有改变。这就说明,ZFP36L2 的抗病毒活性并不依赖于它定位到 PBs。
- ZFP36L2、XRN1、病毒 RNA 和病毒 NS3 在 ER 区域的亚细胞共定位产生抗病毒作用:黄病毒会在源自内质网(ER)网络的病毒诱导的细胞内膜结构上进行复制,这些结构被称为复制复合物(RCs)。研究人员想知道 ZFP36L2 在 RCs 位置的抗病毒效果。他们让 A549 细胞感染高滴度的 JEV,然后转染 mCherry 或 mCherry 融合的 ZFP36L2(mCherry - ZFP36L2)以及 EGFP 融合的 XRN1(EGFP - XRN1)。通过共聚焦显微镜观察发现,mCherry - ZFP36L2、EGFP - XRN1 和病毒双链 RNA(dsRNA)在 JEV 感染的细胞中共定位,而且 mCherry - ZFP36L2、EGFP - XRN1 和病毒 NS3 蛋白也共定位,它们都在 ER 区域。这表明,ZFP36L2 的抗病毒活性是在 RCs 中由 XRN1 介导的。
综合研究结果和讨论部分,我们可以看到,这项研究意义非凡。它首次揭示了 ZFP36L2 在宿主抵御黄病毒感染中的重要作用和独特的抗病毒机制。ZFP36L2 通过 5′ - 3′ XRN1 介导的 RNA 降解途径,在 RCs 中结合并降解黄病毒 RNA,从而抑制病毒复制。而且,它的抗病毒活性不依赖于定位到 PBs 和 SGs。这不仅让我们对 ZFP36L 家族的抗病毒机制有了更全面的认识,也为开发新的抗病毒策略提供了理论依据。未来,或许可以根据 ZFP36L2 的这些特性,研发出更有效的抗病毒药物,帮助我们更好地对抗黄病毒感染,守护人类健康。
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