PANoptosis相关长非编码RNA在肝细胞癌预后评估中的新突破:构建精准风险分层模型

【字体: 时间:2025年02月20日 来源:Scientific Reports 3.8

编辑推荐:

  为解决肝细胞癌(HCC)预后评估难题,研究人员聚焦PANoptosis相关长非编码RNA(PRLs),开展风险分层模型构建研究。通过WGCNA、LASSO分析及多变量Cox评估,成功建立基于PRLs的预后评分系统,并验证其可靠性。该研究为HCC精准预后评估及个性化治疗提供新思路,极具临床应用潜力,值得科研读者关注。

  
肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)是全球最常见的实体恶性肿瘤之一,占据了原发性肝脏恶性肿瘤的约90%。这种癌症的高发病率与慢性病毒感染和酒精摄入密切相关,而其治疗效果却因药物疗效有限而令人担忧。大多数HCC患者在确诊时已处于晚期,手术治疗受限,且现有的药物治疗效果不佳。此外,HCC的风险分层因遗传多样性和分子异质性而变得复杂,现有的治疗手段如酪氨酸激酶抑制剂(TKI)和免疫检查点抑制剂(ICI)在不同患者中的反应差异显著。因此,寻找新的生物标志物以改善HCC的风险评估和治疗效果显得尤为重要。
为了应对这些挑战,中国某研究团队在《期刊原文名称》上发表了一篇题为《论文原文标题》的研究论文。该研究聚焦于PANoptosis相关长非编码RNA(lncRNA,PANoptosis-related lncRNAs, PRLs)在HCC中的作用,并通过一系列生物信息学分析和实验验证,建立了一个基于PRLs的风险评估模型,为HCC的诊断和治疗提供了新的视角。

研究背景与问题

HCC的治疗面临诸多挑战,尤其是在药物疗效和患者个体差异方面。目前,除了甲胎蛋白(Alpha-fetoprotein, AFP)之外,尚无其他获批的生物标志物可用于预测系统治疗对ICI和TKI的反应。长非编码RNA(lncRNA)因其在调控基因表达和细胞功能中的重要作用而受到关注,它们通过影响肿瘤抑制因子和癌基因的活性,展现出作为HCC疗效生物标志物的潜力。此外,PANoptosis是一种新型的细胞死亡方式,结合了焦亡(pyroptosis)、凋亡(apoptosis)和坏死(necroptosis)的特征,其在免疫反应、化疗和PD-1/PD-L1相关治疗中的重要作用使其成为HCC研究的一个新方向。

研究方法

为了探索PRLs在HCC中的作用,研究人员采用了多种关键技术方法。首先,他们利用加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis, WGCNA)筛选与HCC相关的PRLs。接着,通过最小绝对收缩和选择算子(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator, LASSO)分析和多变量Cox回归评估,建立了HCC相关的PRL评分系统。此外,研究人员还利用单样本基因集富集分析(Single-sample Gene Set Enrichment Analysis, ssGSEA)评估免疫浸润情况,并通过体外实验验证了PRLs对HCC细胞行为的影响。

研究结果

HCC相关PRLs的筛选

研究人员从公共数据库中获取了HCC样本的RNA测序数据和临床信息,并通过WGCNA筛选出105个与HCC相关的PRLs。这些PRLs与PANoptosis相关基因(PANoptosis-related genes, PRGs)表现出显著的相关性,提示它们可能在HCC的进展中发挥重要作用。

PRL评分系统的建立与验证

基于筛选出的PRLs,研究人员利用LASSO分析和多变量Cox回归评估,建立了PRL评分系统。该评分系统能够有效预测HCC患者的预后,且在训练组、测试组和整个队列中均显示出良好的诊断效能(ROC曲线下面积AUC分别为0.728、0.728和0.748)。此外,研究人员还利用独立的外部验证队列(ICGC数据库)进一步验证了PRL评分系统的准确性和稳定性,其AUC值为0.656。
婵°倗濮烽崑娑㈡倶濠靛绠熼柨鐕傛嫹 赛默飞全新液相色谱有啥不一样?答卷有礼

PRL评分与临床特征的相关性

研究人员发现,PRL评分与HCC患者的临床特征(如性别、年龄、分级和分期)存在显著关联。特别是,在男性患者中,低PRL评分与更好的预后相关,而在女性患者中未观察到这种差异。此外,PRL评分还与肿瘤突变负荷(Tumor Mutation Burden, TMB)和化疗药物敏感性相关,提示其在个性化治疗中的潜在应用价值。

PRL评分与免疫浸润的关系

通过ssGSEA分析,研究人员发现PRL评分与HCC组织中的免疫细胞浸润水平存在显著相关性。高PRL评分的HCC样本表现出更高的CD4+ T细胞、激活的树突状细胞、Th2细胞和Th17细胞浸润水平,而嗜酸性粒细胞浸润水平则较低。这些结果表明,PRL评分不仅能够预测HCC的预后,还可能反映肿瘤免疫微环境的状态。

体外实验验证

为了进一步验证PRLs在HCC中的作用,研究人员选择了AC026412.3这一具有最高风险系数的PRL进行体外实验。结果表明,AC026412.3的敲低能够显著抑制HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并通过促进PANoptosis相关蛋白(如Caspase-3、Bax、NLRP3和p-MLKL)的表达来诱导细胞死亡。

研究结论与讨论

该研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了PRLs在HCC中的重要作用,并建立了一个基于PRLs的风险评估模型。这一模型不仅能够有效预测HCC患者的预后,还与肿瘤的免疫浸润和化疗药物敏感性相关,为HCC的个性化治疗提供了新的思路。此外,研究人员还发现PRL评分在男性和女性患者中的预后价值存在差异,这可能与性激素在HCC发生发展中的作用有关。未来的研究需要进一步探索PRLs在HCC中的具体分子机制,并通过多中心研究验证PRL评分系统的临床应用价值。
总之,这项研究为HCC的诊断和治疗提供了新的生物标志物和潜在的治疗靶点,具有重要的临床意义。

濠电偞鍨堕幐鎼侇敄閸緷褰掑炊閳规儳浜鹃柣鐔煎亰濡插湱鈧鎸哥€涒晝鈧潧銈搁弫鍌炴倷椤掍焦鐦庨梺璇插缁嬫帡宕濋幒妤€绀夐柣鏃傚帶杩濇繝鐢靛Т濞茬娀宕戦幘鎰佹僵鐎规洖娲ㄩ悾铏圭磽閸屾瑧顦︽俊顐g矒瀹曟洟顢旈崨顖f祫闂佹寧绻傞悧鎾澄熺€n喗鐓欐繛鑼额嚙楠炴﹢鏌曢崶銊ュ摵鐎殿噮鍓熼獮宥夘敊閻e本娈搁梻浣藉亹閻℃棃宕归搹顐f珷闁秆勵殕椤ュ牓鏌涢幘鑼槮濞寸媭鍨堕弻鏇㈠幢濡ゅ﹤鍓遍柣銏╁灡婢瑰棗危閹版澘顫呴柣娆屽亾婵炲眰鍊曢湁闁挎繂妫欑粈瀣煃瑜滈崜姘┍閾忚宕查柛鎰ㄦ櫇椤╃兘鏌ㄥ┑鍡欏ⅵ婵☆垰顑夐弻娑㈠箳閹寸儐妫¢梺璇叉唉婵倗绮氶柆宥呯妞ゆ挾濮烽鎺楁⒑鐠団€虫灁闁告柨楠搁埢鎾诲箣閿旇棄娈ュ銈嗙墬缁矂鍩涢弽顓熺厱婵炲棙鍔曢悘鈺傤殽閻愬弶鍠橀柟顖氱Ч瀵噣宕掑Δ浣规珒

10x Genomics闂備礁鎼崐鐟邦熆濮椻偓楠炴牠鈥斿〒濯爄um HD 闁诲孩顔栭崰鎺楀磻閹剧粯鐓曟慨妯煎帶閻忕姷鈧娲滈崰鎾舵閹烘骞㈡慨姗嗗墮婵啴姊洪崨濠傜瑨婵☆偅绮嶉妵鏃堝箹娴g懓浠㈤梺鎼炲劗閺呮粓鎮鹃柆宥嗙厱闊洤顑呮慨鈧┑鐐存綑濡粓濡甸幇鏉垮嵆闁绘ḿ鏁搁悡浣虹磽娴e憡婀版俊鐐舵铻為柛褎顨呯粈鍡涙煕閳╁啞缂氶柍褜鍏涚划娆撳极瀹ュ鏅搁柨鐕傛嫹

婵犵數鍋涘Λ搴ㄥ垂閼测晜宕查悗锝庡亞閳绘棃鎮楅敐搴″箺缂佷胶娅墂ist闂備線娼уΛ妤呮晝閿濆洨绠斿鑸靛姇濡ɑ銇勯幘璺轰粶缂傚秳绶氶弻娑㈠冀閵娧冣拡濠电偛鐗婇崢顥窱SPR缂傚倷鐒︾粙鎺楁儎椤栫偛鐒垫い鎺嗗亾妞わ缚鍗抽幃褔宕妷銈嗗媰闂侀€炲苯澧村┑鈥愁嚟閳ь剨缍嗛崜姘跺汲閳哄懏鍊垫繛鎴炵懃婵啴鏌涢弮鎾村

闂備礁鎲¢〃鍡椕哄⿰鍛灊闊洦绋掗崵鍕煟閹邦剦鍤熼柕鍫熸尦楠炴牠寮堕幋鐘殿唶闂佸憡鐟ュΛ婵嗩潖婵犳艾惟闁靛绲煎ù鐑芥煟閻樿京鍔嶇憸鏉垮暣閹儵鏁撻敓锟� - 婵犵數鍎戠徊钘夌暦椤掑嫬鐭楅柛鈩冡缚椤╂煡鏌涢埄鍐惧毀闁圭儤鎸鹃々鐑藉箹鏉堝墽绉甸柛搴㈠灥閳藉骞橀姘濠电偞鍨堕幖鈺傜濠婂啰鏆﹂柣鏃囨绾惧ジ鏌涢埄鍐闁告梹甯¢幃妤呭捶椤撶偘妲愰梺缁樼⊕閻熝囧箯鐎n喖绠查柟浼存涧閹線姊洪崨濠傜濠⒀勵殜瀵娊鎮㈤悡搴n唹濡炪倖鏌ㄩ悘婵堢玻濞戙垺鐓欓悹銊ヮ槸閸婂鎮烽姀銈嗙厱婵炲棙锚閻忋儲銇勯銏╁剶鐎规洜濞€瀵粙顢栭锝呮诞鐎殿喗鎮傞弫鎾绘晸閿燂拷

濠电偞鍨堕幐鎼侇敄閸緷褰掑炊椤掆偓杩濇繝鐢靛Т鐎氼噣鎯屾惔銊︾厾鐎规洖娲ゆ禒婊堟煕閻愬瓨灏﹂柟钘夊€婚埀顒婄秵閸撴岸顢旈妶澶嬪仯闁规壋鏅涙俊铏圭磼閵娧冾暭闁瑰嘲鎳庨オ浼村礃閵娧€鍋撴繝姘厸閻庯綆鍋勬慨鍫ユ煛瀹€鈧崰搴ㄥ煝閺冨牆鍗抽柣妯挎珪濮e嫰鏌f惔銏⑩姇闁告梹甯″畷婵嬫偄閻撳宫銉╂煥閻曞倹瀚�

相关新闻
    生物通微信公众号
    微信
    新浪微博
    • 急聘职位
    • 高薪职位

    知名企业招聘

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号