近乎完整的小麦中国春基因组组装与全面注释：解锁小麦研究与育种新密码

为解决全球通用的小麦中国春（CS）基因组因庞大且高度重复而存在众多缺口的问题，研究人员开展了小麦中国春基因组的相关研究。他们获得了 14.46 Gb 近乎完整的组装基因组，注释出大量基因。该成果为小麦及相关物种研究和育种提供宝贵资源。

　　完整的参考基因组对于生物学研究和遗传改良至关重要。由于小麦中国春（CS）基因组规模庞大且高度重复，全球使用的该基因组存在众多缺口。此次研究生成了大小为 14.46 Gb 近乎完整的 CS 基因组组装，其 contig N₅₀超过 266 Mb，总体碱基准确率达 99.9963%。剩余的 290 个缺口（A、B 和 D 亚基因组分别有 26、257 和 7 个缺口）中，278 个是极高拷贝的串联重复序列，其余 12 个与转座元件（TE）相关。四条染色体（chr1D、chr3D、chr4D 和 chr5D）完全无缺口。对近乎完整基因组的广泛注释揭示了 151405 个高可信度基因，其中 59180 个是新注释的高可信度基因，包括 7602 个新组装的基因。除 chr1B 的着丝粒存在与超长 GAA 重复序列阵列相关的缺口外，其余 20 条染色体的着丝粒序列均完整组装。近乎完整的组装显示，如简单序列重复（SSR）等串联重复序列在不同亚基因组中的分布极不均衡。同样，三个亚基因组着丝粒的重复序列组成也有所不同。在所有六种种子储存蛋白（SSP）的基因组序列完全组装后，发现 ω - 醇溶蛋白的表达完全由 B 亚基因组贡献，而其他 5 种 SSP 的表达在 D 亚基因组中最为丰富。近乎完整的 CS 基因组将为小麦及其相关物种的研究和育种提供宝贵资源。