长非编码RNA与mRNA在关中奶山羊精曲小管成熟中的表达谱分析

【字体: 时间:2025年02月19日 来源:BMC Genomics 3.5

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  本研究聚焦精曲小管成熟过程中的基因表达调控,通过分析长非编码RNA(lncRNA)和mRNA的表达模式,揭示其在奶山羊精曲小管发育中的作用,为生殖生物学研究提供新见解。

  本研究深入探讨了长非编码RNA(lncRNA)和mRNA在关中奶山羊精曲小管成熟过程中的表达模式及其调控机制。研究背景部分指出,精子发生是一个复杂的生物学过程,依赖于精曲小管内多种细胞的协同作用,而lncRNA在其中扮演着重要角色。然而,目前对于奶山羊精曲小管中lncRNA和mRNA的表达模式及其在精子发生中的作用仍知之甚少。为了填补这一研究空白,研究人员选取了45天龄(G45)和240天龄(G240)的关中奶山羊精曲小管作为研究对象,通过RNA测序(RNA-Seq)技术分析了这两个发育阶段的lncRNA和mRNA表达谱。
研究人员采用的主要技术方法包括RNA提取、cDNA文库构建、RNA-Seq测序、数据预处理与基因组比对、差异表达分析、基因本体(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析以及共表达网络构建等。样本来源于中国陕西省富平县的一家奶山羊养殖场,选取具有相似遗传背景的关中奶山羊进行实验。
研究结果显示,在G45和G240两个发育阶段的精曲小管中,研究人员共鉴定出11,612个lncRNA和18,217个mRNA,其中7,554个lncRNA和11,986个mRNA表现出显著差异表达。通过GO和KEGG富集分析,发现这些差异表达基因主要富集在与精子发生相关的生物学过程和信号通路中,如PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和Rap1信号通路等。此外,研究人员还构建了lncRNA-mRNA共表达网络,揭示了特定lncRNA及其靶基因在精子发生中的潜在调控作用。
在讨论部分,研究人员认为,精曲小管是精子发生的唯一场所,其内细胞的发育和功能受到lncRNA和mRNA的精细调控。本研究通过对比G45和G240两个发育阶段的精曲小管,揭示了lncRNA和mRNA在奶山羊精曲小管成熟过程中的动态变化及其潜在的调控机制。这些发现不仅为理解奶山羊精子发生和精曲小管发育的分子机制提供了重要参考,还为其他家畜的生殖生物学研究提供了新的视角和研究思路。未来的研究将进一步探索这些关键lncRNA和mRNA在细胞水平上的功能验证,以及它们在精子发生中的具体作用机制。
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