为了揭开这个秘密,华中农业大学的研究人员在《Veterinary Research》期刊上发表了一篇名为 “MoxR effects as an ATPase on anti-stress and pathogenicity of Riemerella anatipestifer” 的论文。研究人员发现,MoxR作为一种 ATP 酶(能利用 ATP 水解产生的能量来干活的酶),对鸭疫里默氏杆菌应对压力和致病能力影响很大。这一发现,就像是找到了对抗鸭疫里默氏杆菌的新 “武器”,为理解它的致病机制提供了新方向,也给研发新疫苗带来了希望。
在这场探索之旅中,研究人员用了不少厉害的技术方法。他们用 PCR 技术(聚合酶链式反应,能快速扩增特定的 DNA 片段 )来扩增基因,构建各种菌株;通过实时荧光定量 PCR(qPCR,能精准测量基因表达量)分析基因的转录水平;用 ATP 水解实验来检测MoxR蛋白的 ATP 酶活性;还做了细菌生长曲线分析、应激实验、细胞黏附和侵袭实验,以及动物感染实验,从不同角度观察鸭疫里默氏杆菌在各种情况下的表现。
研究人员首先想看看MoxR到底是个什么样的 “角色”,于是对它进行了全面分析。通过 Blast 比对发现,Bat 操纵子的核苷酸序列在不同的鸭疫里默氏杆菌菌株里相似度很高,超过 90%,MoxR的氨基酸序列保守性更是突出。进一步分析发现,MoxR的 N 端有 ATP 酶结构域,包含 Walker A、Walker B 和 Sensor I 等重要基序,这些基序对它结合和水解 ATP 很关键;C 端有个 AAA 结构域,虽然具体功能还不太清楚,但可能和与底物蛋白相互作用有关。进化树分析显示,鸭疫里默氏杆菌的MoxR和脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)的关系比较近。预测MoxR的亚细胞定位发现它是一种细胞质蛋白。为了验证MoxR的 ATP 酶功能,研究人员表达并纯化了His? - MoxR融合蛋白,ATP 水解实验表明,MoxR确实具有 ATP 酶活性,随着His? - MoxR和 ATP 浓度增加,反应体系里的磷酸基团浓度也升高。
接着,研究人员开始构建各种菌株,就像打造不同的 “小战士”,来研究MoxR的功能。他们构建了moxR基因缺失突变株(ΔmoxR)、互补株(CΔmoxR)、敲低株(WT::moxRi)和过表达株(WT::moxR) 。用 PCR 和 qPCR 技术确认这些 “小战士” 身份后,就开始研究MoxR对 Bat 操纵子的影响。qPCR 分析发现,ΔmoxR菌株里 Bat 操纵子的转录增加了;而往野生型(WT)或 ΔmoxR菌株里导入外源moxR基因后,Bat 操纵子基因的转录又下调了。这说明MoxR能下调 Bat 操纵子的转录,而且MoxR的表达参与了 Bat 操纵子转录的调控。
致病菌在感染宿主的过程中会遇到各种压力,就像游戏里的重重关卡。研究人员想知道MoxR在鸭疫里默氏杆菌应对这些压力时起什么作用,于是开展了应激实验。结果发现,和野生型菌株比起来,ΔmoxR菌株对热应激的抵抗力下降了,但对氧化应激的抵抗力增强了。给 ΔmoxR菌株补充moxR基因后,它对热应激的抵抗力恢复了,可对氧化应激的抵抗力又明显下降。WT::moxR菌株对热应激的抵抗力增强了,但对氧化应激的抵抗力降低了。研究人员还发现,敲除 Bat 操纵子里的batA基因后,菌株抵抗氧化应激的能力也变弱了。这一系列结果表明,MoxR和鸭疫里默氏杆菌抵抗热应激和氧化应激的能力密切相关,Bat 操纵子在抵抗这些压力中也起着重要作用。