打破传统诊断困境:多模态表面变压器模型开启阿尔茨海默病早期诊断新篇

【字体: 时间:2025年02月18日 来源:Scientific Reports 3.8

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  为解决 AD 传统诊断方法计算资源需求大等问题,釜山国立大学研究人员开展多模态表面变压器模型用于 AD 早期诊断的研究。结果显示该模型诊断准确率高且效率优,为 AD 早期诊断提供新方向,推荐科研读者阅读。

  
在全球老龄化加剧的当下,阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)这个 “大脑健康的头号大敌”,正成为越来越多人关注的焦点。AD 是一种极具破坏性的神经退行性疾病,就像大脑里悄悄蔓延的 “藤蔓”,无情地侵蚀着人们的认知功能。据统计,全球有无数老年人深受其害,生活质量严重下降,家庭和社会的负担也日益沉重。

早期发现 AD 就像是在这场与疾病的战斗中抢占了先机,对患者的治疗和生活改善至关重要。而轻度认知障碍(Mild Cognitive Impairment,MCI)作为 AD 的 “前期预警”,在早期检测中扮演着关键角色。目前,有多种成像技术参与到 AD 的诊断 “大军” 中,比如 T1 加权磁共振成像(T1-weighted magnetic resonance imaging,T1w MRI)能展示大脑的结构 “蓝图”;[18F] 氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描([18F] Fluorodeoxyglucose positron emission tomography,FDG PET)可以测量大脑区域的葡萄糖代谢情况,判断大脑功能是否正常;淀粉样蛋白 -β(amyloid-β,Aβ)PET 和 Tau PET 扫描则能检测与 AD 病理相关的生物标志物沉积。阿尔茨海默病神经影像学倡议(Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative,ADNI)为 AD 研究提供了丰富的 “数据宝藏”。

然而,现有的深度学习诊断方法在利用这些数据时却遇到了难题。大多数方法依赖分析高分辨率 3D 体积特征,就像要在一个巨大的 “数据迷宫” 里找线索,不仅耗费大量计算资源,对 GPU 的性能要求也极高,尤其是在处理多模态数据时,更是困难重重,这对于一些资源有限的小型医疗机构来说,几乎是难以跨越的 “高山”。

与此同时,皮质表面表示(Cortical surface representations)作为一种 “轻量化” 的研究方向,逐渐进入了科学家们的视野。它能详细洞察皮质结构,精准定位大脑活动,在 AD 诊断方面有着独特优势。比如,早期 AD 患者大脑皮层会出现微妙的区域萎缩,通过分析皮质表面的几何形状和厚度,就像用放大镜观察一样,能更有效地发现这些变化。而且,基于表面的配准方法比传统的体积配准方法更胜一筹,它能更好地保留皮层的折叠模式,避免丢失关键信息。可奇怪的是,虽然优势明显,但用多模态基于表面的数据来诊断 AD 的研究却少之又少。

为了攻克这些难题,来自釜山国立大学(Pusan National University)的研究人员勇挑重担。他们在《Scientific Reports》期刊上发表了一篇名为 “Multimodal surface-based transformer model for early diagnosis of Alzheimer’s disease” 的论文,试图为 AD 的早期诊断开辟一条新道路。

在这项研究中,研究人员使用了多个关键技术方法。在表面特征提取环节,他们借助 FreeSurfer 软件对 T1w MRI 扫描数据进行处理,从而得到大脑的皮质表面表示、分区以及包括皮质厚度、脑沟深度和曲率等结构特征。对于 PET 扫描数据,则利用 PETSurfer 工具进行处理,先将 PET 图像与 T1w MRI 扫描的解剖空间配准,然后进行部分容积校正,计算标准化摄取值比(standardized uptake value ratio,SUVR),并将其投影到皮质表面。为了提高效率,他们还优化了表面重建流程,大幅缩短了处理时间。在模型构建方面,他们设计了一种中融合(Middle-fusion)的多模态变压器模型,通过嵌入层、变压器块、mix-transformer 块和分类器等组件,有效融合多模态特征进行 AD 诊断。

下面我们来看看具体的研究结果。

融合策略


研究人员对早期融合(Early-fusion)、晚期融合(Late-fusion)和中融合这三种融合策略进行了对比。结果发现,中融合模型在所有任务和数据集上都表现出色,比其他两种常见的融合策略有显著提升。这就好比在一场比赛中,中融合策略找到了最佳的 “战术配合”,让模型能更好地发挥实力。于是,研究人员在后续的多模态研究中都采用了中融合策略。

ADNI1 数据集上的结果


在 ADNI1 数据集上,研究人员对比了单模态和多模态方法。结果显示,在 AD 诊断任务中,多模态方法优势明显,平衡准确率达到 0.962 ± 0.012,AUC 为 0.969 ± 0.031。在早期 AD 诊断任务中,优势更为突出,平衡准确率达到 79%,AUC 为 81%。进一步的统计分析表明,MRI 和 FDG 的组合在各项指标上表现最佳,显著优于单独使用 MRI,且与单独使用 FDG 在大多数情况下统计效果相当。这说明研究人员提出的模型就像一个 “信息整合大师”,能有效利用不同模态的互补信息,形成更强的多模态表示。

ADNI2 & ADNI3 数据集上的结果


研究人员在 ADNI2 和 ADNI3 数据集上进一步验证模型。在 AD 诊断任务中,当使用 MRI、Aβ 和 Tau 三种模态时,模型达到最佳性能,平衡准确率为 0.94 ± 0.04,灵敏度为 0.91 ± 0.06,特异性为 0.97 ± 0.03,AUC 为 0.95 ± 0.03。在早期 AD 诊断任务中,同样是三种模态组合时性能最高,平衡准确率为 0.75 ± 0.04,灵敏度为 0.72 ± 0.05,特异性为 0.79 ± 0.05,AUC 为 0.79 ± 0.03。统计分析显示,虽然 MRI + Amyloid + Tau 的组合相比 MRI 显著提高了性能,但与 Amyloid 和 Tau 在平衡准确率和 AUC 上统计效果相当。这再次证明了模型在不同 PET 示踪剂数据上的有效性。

与其他方法的比较


研究人员还将自己的模型与其他方法进行了比较。在 AD 诊断方面,该模型与表现最佳的方法相比具有竞争力,而且输入大小仅为其 1/13,大大节省了计算资源。在早期 AD 诊断任务中,该模型更是表现卓越,在平衡准确率和 AUC 上远超基于体积的方法。与基于图卷积神经网络(Graph Convolutional Neural Networks,GCNs)的方法相比,该模型在大多数指标上也有很大优势。这表明研究人员提出的模型在诊断性能和计算效率上都更胜一筹。

从研究结论和讨论部分来看,研究人员提出的多模态基于表面的变压器模型,为 AD 的早期诊断带来了新的希望。该模型通过中融合策略和跨注意力机制,有效整合了 T1w MRI 和 PET 扫描的多模态特征,在早期 AD 诊断上比基于体积的方法表现更优。这一成果的意义重大,它不仅提高了诊断的准确性,还降低了计算资源的需求,为 AD 的早期诊断提供了一种更高效、更实用的方法,有望在临床实践中得到广泛应用。

不过,研究也存在一些局限性。比如,虽然皮质表面特征能加快训练并减少计算资源需求,但使用 FreeSurfer 进行表面重建仍需约 30 分钟 / 人,耗时较长。未来可以通过整合基于深度学习的表面重建方法来缩短预处理时间。而且,研究中没有明确的质量保证指标和手动校正,可能存在分割不准确或重建伪影的问题。此外,研究对象是基于临床诊断分类的,未来可以探索结合临床和病理标记的分类方法,以更全面地了解疾病进展。

尽管还有一些不足,但这项研究无疑为 AD 早期诊断领域点亮了一盏明灯。它让我们看到了基于表面的注意力建模在 AD 诊断中的巨大潜力,也为后续研究指明了方向。相信在科研人员的不断努力下,未来我们在对抗 AD 这场 “战争” 中会取得更大的胜利,让更多人免受 AD 的困扰。

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