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本研究通过全外显子测序（WES），揭示了汗腺癌（EPC）与汗腺瘤（EP）的基因组差异，发现EPC具有更高的突变负荷和独特的基因突变，为开发针对性治疗策略提供了新方向
汗腺癌（EPC）是一种罕见的皮肤恶性肿瘤，起源于汗腺的螺旋导管。其良性对应物汗腺瘤（EP）通常表现为皮肤色或紫红色的结节或丘疹，诊断较为困难。目前对于EPC的治疗主要依赖手术切除，但缺乏标准化的术后治疗方案，且其复发率和转移率较高。为了深入了解EPC的发病机制并寻找新的治疗靶点，芬兰赫尔辛基大学的研究人员开展了一项全外显子测序研究，旨在揭示EPC与EP之间的基因组差异。
研究人员从赫尔辛基生物样本库和芬兰临床生物样本库收集了15例EPC和5例EP的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本，并对其进行了全外显子测序。结果显示，EPC与EP在基因组层面存在显著差异，EPC中存在独特的TP53、NCOR1和CDKN2A基因突变，且突变负荷高于EP。此外，EPC中还富集了与细胞黏附、细胞外基质（ECM）和Ras信号通路相关的基因突变，而EP中则以酮体代谢和氨基酸代谢相关通路的改变为主。研究结果发表在《Orphanet Journal of Rare Diseases》上，为EPC的诊断和治疗提供了新的基因组学依据。
在研究方法方面，研究人员首先从FFPE样本中提取DNA，并利用Twist Human Core Exome EF Multiplex Complete试剂盒进行文库构建。随后，通过Illumina NovaSeq测序平台进行全外显子测序，测序读长为2×151bp。测序数据经过Illumina Dragen v3.8.4软件分析，结合Annovar软件进行变异注释，并通过SigneR R包和MutSignatures R包进行突变特征分析和通路富集分析。样本队列来源于赫尔辛基生物样本库（项目编号：HBP2018003）和芬兰临床生物样本库（项目编号：BB2018-006）。
研究结果方面，全外显子测序显示EPC和EP均存在较高的紫外线诱导突变特征，且EPC的突变负荷显著高于EP。在EPC中，TP53基因突变频率为38%，NCOR1基因突变频率为46%，CDKN2A基因突变频率为8%，而这些基因在EP中均未检测到突变。此外，EPC中还富集了与细胞黏附和ECM相关的基因突变，如整合素介导的细胞黏附、细胞外基质组织等通路的改变。而EP中则以代谢相关通路的改变为主，如酮体代谢和氨基酸代谢。在信号通路方面，EPC中富集了Ras和MAPK信号通路的突变，而EP中未见类似富集。
在结论和讨论部分，研究表明EPC和EP在基因组层面存在显著差异，EPC具有更高的突变负荷和独特的基因突变特征。这些差异可能与EPC的恶性转化和进展有关。研究人员指出，EPC中富集的细胞黏附和ECM相关通路的改变可能与皮肤癌的发生、进展和治疗抵抗有关。此外，Ras和MAPK信号通路的突变可能在EPC的发展中发挥重要作用。这些发现为EPC的诊断和治疗提供了新的基因组学依据，并为开发针对性治疗策略提供了潜在靶点。未来需要进一步验证这些基因和通路在EPC发生发展中的作用，并探索其作为治疗靶点的潜力。
