Cellpose3:一键式图像恢复,改进细胞分割

【字体: 时间:2025年02月15日 来源:AAAS

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  一个新版本的Cellpose——由HHMI的Janelia研究校园的研究人员开发的流行工具,可以在显微镜图像中绘制不同细胞的边界——现在可以在不太完美的图像上工作,这些图像有噪声,模糊或采样不足。

  

现在,在扭曲的显微镜图像中挑选单个细胞就像点击一个按钮一样简单。

一个新版本的Cellpose——在显微镜图像中绘制不同细胞边界的流行工具——现在可以在不太完美的图像上工作,这些图像有噪声、模糊或采样不足。

许多用于分割显微镜图像中单个细胞的一般方法,包括以前版本的Cellpose,很难识别被噪声、模糊或欠采样扭曲的细胞边界。

Janelia集团领导人Carsen Stringer和Marius Pachitariu开始着手解决Cellpose3的开发问题。与之前训练模型以提高扭曲图像质量的方法不同,Cellpose3的训练目的是提高对扭曲图像的分割。

将Cellpose3恢复算法应用于失真图像时,可以产生清晰的恢复图像,然后可以很容易地使用原始Cellpose分割算法进行分割。

Cellpose3还在大量不同的图像集合上进行了训练,使用户能够轻松地使用新方法,这是Cellpose应用程序中的“一键”按钮,可以在他们自己的数据上使用。


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