
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳动的脉搏
DDX60作为胰腺癌新型生物标志物的鉴定及其在肿瘤增殖和预后中的作用机制研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年02月10日 来源:Hereditas 2.1
编辑推荐:
本研究针对胰腺癌诊断和治疗面临的严峻挑战,通过整合TCGA、GEO等多组学数据库分析,结合RNA-seq和分子生物学实验,首次揭示DExD/H-box RNA解旋酶家族成员DDX60在胰腺癌中高表达且与不良预后显著相关。研究人员通过构建DDX60敲除模型,证实其通过调控细胞周期促进肿瘤增殖,并筛选出JW-7-52-1等靶向药物,为胰腺癌精准诊疗提供了新靶点和治疗策略。
胰腺癌作为消化系统最具侵袭性的恶性肿瘤之一,其五年生存率不足10%,被称为"癌中之王"。2023年数据显示,美国新发病例达64,050例,死亡50,550例,凸显其严峻的临床挑战。尽管手术、化疗等治疗手段不断进步,但晚期患者疗效仍不理想,亟需寻找新的诊断标志物和治疗靶点。在这一背景下,厦门大学医学院的研究团队在《Hereditas》发表重要研究成果,首次系统阐明了RNA解旋酶DDX60在胰腺癌发生发展中的关键作用。
研究采用多组学整合分析策略,主要技术方法包括:1) 从TCGA-PAAD和5个GEO数据集(GSE71729等)获取183例胰腺癌样本的转录组数据;2) 使用limma包进行差异表达分析;3) 通过DAVID数据库进行GO/KEGG通路富集;4) 构建DDX60敲除的Panc02细胞模型,采用MTT、LDH和克隆形成实验验证增殖功能;5) 利用pRRophetic包预测靶向药物敏感性。
研究结果部分:
DEGs分析:在5个独立数据集中鉴定出975-2257个差异基因,共同富集于细胞粘附(GO:0007155)、细胞外基质(ECM)等通路,提示DDX60可能参与肿瘤微环境调控。
DDX60表达特征:多数据库验证显示DDX60在胰腺癌组织mRNA和蛋白水平均显著高表达(P<0.05),CPTAC数据库显示其蛋白表达量较正常组织增加2.1倍。
临床预后价值:TCGA分析显示高DDX60组患者中位生存期缩短40%(P=0.001),且与淋巴结转移(N1 vs N0,P=0.026)、高级别病理分级(G3 vs G1,P=3.9e-05)显著相关。
功能机制:RNA-seq揭示DDX60调控细胞周期相关基因(如MCM2/4/8),敲除后导致G1/S期阻滞;GSEA分析发现其富集于B_CELL_RECEPTOR_SIGNALING等免疫通路。
治疗策略:药物敏感性分析筛选出8种潜在靶向药物,其中JW-7-52-1在DDX60高表达组IC50降低67%,体外实验证实Dabrafenib可增强DDX60敲除细胞的杀伤效果。
结论与讨论:
该研究首次确立DDX60作为胰腺癌独立预后因子,其促癌机制涉及:1) 通过调控MCM家族基因驱动细胞周期进展;2) 重塑肿瘤免疫微环境,与Tregs负相关(cor=-0.26);3) 影响化疗敏感性,为临床分层治疗提供依据。值得注意的是,DDX60作为病毒防御因子,其高表达可能反映肿瘤免疫逃逸的特殊机制。研究局限性包括缺乏原代肿瘤样本验证和动物实验,未来需探索DDX60与PD-1/L1等免疫检查点的协同作用。该成果为胰腺癌的分子分型和靶向治疗开辟了新方向,具有重要转化医学价值。
生物通微信公众号
知名企业招聘