中国西南地区儿童和妇女侵袭性感染金黄色葡萄球菌的抗生素敏感性及全基因组测序分子特征研究（2018-2023）

编辑推荐：本研究针对中国西南地区儿童和妇女侵袭性金黄色葡萄球菌（S. aureus）感染的高负担问题，通过全基因组测序（WGS）技术分析108株临床分离株的分子特征及耐药性。发现主要流行克隆为CC59-IV-t437（MRSA）和CC22-t309（MSSA），携带pvl基因率达33.33%，且MRSA对红霉素（ERY）、克林霉素（CLI）耐药率显著高于MSSA。该研究为区域精准防控和临床治疗提供了关键数据。

　　金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）作为人类皮肤和黏膜的常见定植菌，其引发的侵袭性感染可导致高达19.1%的死亡率，是全球公共卫生的重大挑战。尤其在儿童和孕产妇群体中，由于免疫系统发育不完善及特殊生理状态，感染后果更为严重。中国西南地区作为人口密集区域，其金黄色葡萄球菌的分子流行病学特征长期缺乏系统性研究。更令人担忧的是，随着抗生素滥用加剧，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的流行态势不断演变，传统治疗方案面临失效风险。在这一背景下，四川大学华西第二医院的研究团队开展了为期5年的大规模研究，成果发表于《BMC Microbiology》。

研究团队采用全基因组测序（WGS）结合表型药敏试验，对2018-2023年间108例侵袭性感染病例（血培养阳性率95.37%）的菌株进行多维度分析。关键技术包括：①基于Illumina NovaSeq平台的200×覆盖度全基因组测序；②MLST（多位点序列分型）、spa分型和SCCmec分型等分子特征解析；③Vitek AST-GP67卡片的15种抗生素敏感性检测；④通过VFDB和NCBI数据库进行毒力基因和耐药基因注释。

分子流行病学特征揭示：32个ST型中包含8个新发现的序列型（ST8772-ST8792），主要流行克隆呈现显著地域特异性。MRSA组（29株）以ST59/CC59为主导（48.28%），其中SCCmec IV型占比62.07%，spa t437型占44.83%，形成CC59-IV-t437（34.48%）和CC59-V-t437（13.79%）两大优势谱系。MSSA组（79株）则呈现更高遗传多样性，主要流行CC22-t309（18.99%）、CC1-t189（10.13%）和CC5-t002（7.60%）。值得注意的是，CC5-t002谱系对庆大霉素（GEN）、复方新诺明（SXT）和克林霉素（CLI）呈现100%耐药率，提示该克隆可能存在特殊的耐药机制。

耐药谱分析显示：青霉素（PEN）耐药率高达91.67%，MRSA组对四环素（TCY）、红霉素（ERY）和克林霉素（CLI）的耐药率显著高于MSSA组（p<0.05）。特别值得关注的是，CC59谱系MRSA对ERY和CLI的耐药率达100%，而SXT在MRSA中的低耐药率（13.89%）可能为临床治疗提供新选择。全基因组分析发现所有菌株均携带四环素耐药基因tet(38)，但表型耐药率仅12.96%，揭示基因型与表型的不完全对应关系。

毒力基因谱呈现：33.33%菌株携带杀白细胞素基因pvl，高于中国其他地区报道。所有菌株均携带编码蛋白A的spa基因和凝固酶coa基因（以VII型为主）。免疫逃逸相关基因scn、chp和sak的携带率分别达98.15%、75.00%和82.40%，这些因子可能通过干扰宿主先天免疫系统促进感染持续。

该研究首次系统揭示了中国西南地区儿童和妇女侵袭性金黄色葡萄球菌感染的分子特征和耐药模式。研究发现ST22-MSSA克隆的高流行现象值得警惕，因其可能具备更强的组织侵袭能力。CC59-IV-t437作为主导MRSA谱系的发现，为区域感染控制提供了精准靶点。研究强调需加强针对CC5-t002等多重耐药克隆的监测，同时建议临床考虑基于分子分型的个体化治疗策略。这些成果不仅填补了西南地区金黄色葡萄球菌流行病学数据的空白，也为制定国家抗菌药物管理政策提供了重要科学依据。