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遗传与基因组因素对条纹鲶鱼感染爱德华氏菌宿主性状的影响研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年02月10日 来源:Aquaculture Science and Management
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为解决水产养殖中传染病对可持续生产的威胁,越南RIA2研究所联合澳大利亚阳光海岸大学采用遗传-流行病学模型(GEM),通过挑战试验评估条纹鲶鱼对Edwardsiella ictaluri的抵抗力。研究发现宿主性状(易感性、传染性、死亡率)具有显著遗传力,传染性遗传方差最大(h2=0.36),基因组预测准确度达0.16-0.73。该研究为通过多性状选择指数(遗传增益5.5-10.3%/代)提升种群抗病力提供了新策略。
水产养殖业正面临传染病的严峻挑战,仅条纹鲶鱼因爱德华氏菌(Edwardsiella ictaluri)导致的年损失就高达9400万美元。传统育种方法虽能提升个体抗性,却忽视了群体流行病学特性。为此,越南水产研究所与澳大利亚阳光海岸大学团队创新性地将SIR模型(Susceptible-Infected-Removed)与数量遗传学结合,通过注射和共居挑战试验,对560尾条纹鲶鱼(含490子代和70亲本)展开研究。
研究采用三大关键技术:1) 基于DArTseq技术获取6,470个高质量SNP标记;2) 运用SIRE 2.0软件进行贝叶斯MCMC分析,估计宿主性状遗传参数;3) 通过五折交叉验证评估GBLUP模型预测准确性。实验设计包含10个接触组,采用共居感染法(病原剂量106 CFU/0.2ml),记录23天内死亡时间(days post-challenge)。
遗传参数分析显示:传染性遗传方差最大(1.76,95%CI 0.79-2.45),易感性与传染性呈负遗传相关(rg=-0.40)。GWAS发现SNP呈多基因效应,优势度不完全(Δ=0.476)。基因组预测中,易感性-传染性转换时间预测准确度最高达0.74(仅显著SNP时)。
讨论部分指出,该研究首次在条纹鲶鱼中证实:1) 群体抗病力提升需同时优化易感性、传染性和死亡率;2) 传染性遗传方差显著高于其他性状,提示其可作为选择重点;3) 选择指数设计使年遗传增益提升至10.3%。但存在共居试验无法精确区分个体感染状态的局限,建议未来结合免疫指标(如IgM、IL6)进行多维度筛选。论文发表于《Aquaculture Science and Management》,为水产抗病育种提供了理论框架和实践范式。
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