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木本多年生植物根系构型分析与模拟的田间-参数化管道:在葡萄砧木中的应用与气候适应性研究
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年02月10日 来源:Plant Phenomics
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这篇研究创新性地开发了一套从田间挖掘到参数化建模的完整流程(field-to-parameter pipeline),用于分析木本多年生植物的根系构型(RSA)。通过结合原位3D数字化技术和根系标记语言(RSML)转换,成功实现了葡萄砧木基因型特异性生长模式与水分吸收功能的模拟。研究验证了挖掘与原位数字化方法的精确性,揭示了砧木基因型间RSA的显著差异,并基于CPlantBox模型开发了静态初始根系和概率性向性函数,为气候变暖背景下木本作物的可持续性研究提供了方法论基础。
研究团队建立了一套完整的田间-参数化分析流程,通过机械辅助挖掘和电磁3D数字化仪(Polhemus Fastrak)原位捕获葡萄砧木根系的空间结构。技术验证显示,该方法平均偏差仅0.075 cm,但随距离发射器远近误差递增(>150 cm时RMSE达0.231 cm)。对比实验证实,原位数字化能更真实反映根系自然分布——与离土悬挂状态相比,根系水平扩展范围被低估84.3%,而深层土壤中的根系长度被高估10.8%。通过冲洗法(washout)与常规挖掘的对比,发现后者会损失约60%的细根长度,但能保留90%以上的分支拓扑信息,为模型参数化提供了可靠基础。
以三个砧木基因型(101-14、SO4、Richter 110)为对象,研究发现种植后6个月时,R110表现出独特的深根特性,其根系高度达116.7 cm,显著高于其他基因型。通过RSML格式转换和CPlantBox建模,团队首次量化了基因型间向性生长差异:R110的初生侧根(type 2)95%表现为向地性(gravitropism),而101-14仅有85%。水力模型显示,R110在91-120 cm土层的标准吸收分数(SUF)达0.09,是其他基因型的9倍,印证了其干旱适应性机制。
研究对CPlantBox进行了两项关键改进:引入静态初始根系(1年生不定根)和概率性向性函数。参数化过程中,最大根长(lmax)和初始伸长速率(r)等参数均来自田间数据,如R110的type 2根长可达110.1 cm。模拟结果与实测RSA高度吻合(R2>0.9),但模型尚未整合根系-土壤反馈机制。研究者建议未来结合覆盖作物管理数据,开发全株模型(如整合Virtual Riesling地上部模型),以模拟葡萄园实际水分竞争场景。
该方法虽需2人日/样本的高成本,但为木本作物(如果树、松树)的根系研究提供了新范式。通过部分挖掘与计算放大技术,可扩展至大田规模研究。研究揭示的砧木RSA差异(如R110的深层水分获取策略)为抗旱育种提供了表型靶点,但需注意电磁干扰(如金属棚架)对数字化精度的影响。
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