马蹄蝠基因组研究:解锁染色体演化与免疫适应的遗传密码
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时间:2025年02月08日
来源:Nature Ecology & Evolution 14.1
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马蹄蝠作为人畜共患病毒的天然宿主,其抗病毒免疫的遗传基础尚不明确。研究人员通过对马蹄蝠及其近亲进行染色体水平的基因组组装,发现其经历了染色体重排和基因扩张,这些变化与免疫相关。该研究为理解蝙蝠抗病毒免疫提供了新视角。
马蹄蝠(Rhinolophus)是许多人畜共患病毒的天然宿主,但它们抗病毒免疫的遗传基础却鲜为人知。此次,研究人员构建了两种马蹄蝠物种以及三个近亲的染色体水平基因组组装。研究发现,在马蹄蝠的物种分化过程中,它们经历了广泛的染色体重排,而且与节段性重复相关的基因发生了扩张。功能检测表明,这些基因扩张在 I 型干扰素(IFN)和干扰素刺激基因 ANXA2R 中产生了新的适应性变异,这可能增强了马蹄蝠的抗病毒状态。通过全基因组选择筛选,包括对候选基因渗入区域的筛选,研究人员发现了许多与免疫相关的潜在分子适应性变化,其中就涉及病毒受体。研究人员将分类群扩大到十种马蹄蝠,鉴定出了严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)受体血管紧张素转化酶 2(ACE2)的新变体,并揭示了趋同的功能重要残基,这些残基或许能够解释哺乳动物对病毒易感性的差异。研究表明,马蹄蝠在基因组区域存在多种且多尺度的突变变化,拥有众多适应性特征,其中一些可能与对病毒的免疫反应有关。
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