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为探究内质网应激(ERS)与肝癌(HCC)上皮 - 间质转化(EMT)的关系,研究人员开展了 ERS 相关超级增强子(SEs)对 HCC 中 EMT 影响的研究。结果发现 ERS 激活经 SE 介导的 CREB5/TNC 通路促进肝癌细胞 EMT。这为防治 HCC 的 EMT 进程提供新方向。
肝癌,这一隐匿起病、高复发转移的恶性肿瘤,长期预后极差,严重威胁人类健康。内质网应激(ERS)在肝癌发展中扮演着重要角色,它可通过多种途径影响肝癌细胞的行为,如促进血管生成、诱导自噬、降低化疗敏感性等。同时,ERS 与上皮 - 间质转化(EMT)紧密相关,在多种癌症中,ERS 能激活 EMT,推动癌细胞的侵袭和转移。然而,在肝癌领域,ERS 究竟如何调控 EMT,其中的机制仍迷雾重重。
超级增强子(SEs)作为一类具有强大转录增强活性的顺式作用元件,对肿瘤细胞关键基因的表达调控至关重要,在肝癌的 EMT 过程中也可能发挥着关键作用。但 ERS 相关的 SEs 及其靶基因在肝癌发展和 EMT 中的具体作用,尚未得到明确阐释。此外,CAMP 反应元件结合蛋白 5(CREB5)虽已被证实与多种癌症的发展相关,在肝癌中也呈现高表达且与不良预后相关,但其参与肝癌细胞 EMT 的具体机制,以及与 ERS 的内在联系,依旧是未解之谜。
为了揭开这些谜题,安徽医科大学第一附属医院等机构的研究人员踏上了探索之旅。他们开展了一系列深入研究,最终发现 ERS 激活可通过 SE 介导的 CREB5/TNC 通路,促进肝癌细胞的 EMT 进程。这一成果犹如一道曙光,为揭示 ERS 调控 EMT 的机制提供了全新视角,也为肝癌的防治策略开发奠定了坚实基础,相关论文发表在《Cell Death and Disease》杂志上。
在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们从 The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取 RNA 测序数据和临床信息,从 EMT 相关数据库 dbEMT 获取 EMT 数据。实验中,通过 RNA 测序(RNA-seq)分析基因表达差异,利用染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)检测 SEs 的变化,借助免疫组化(IHC)染色检测组织中蛋白表达水平,还进行了动物实验验证相关结论 。
研究结果如下:
- CREB5 是 HCC 中 ERS 相关 SE 的关键靶基因:研究人员对经衣霉素(TM)处理和未处理的 HepG2 细胞进行 RNA-seq,发现 1062 个差异表达基因(DEGs);通过 ChIP-seq 分析,确定了 197 个 ERS 特异性 SEs 的变化。综合分析筛选出 CREB5 作为关键研究对象。进一步实验表明,JQ1(一种 BRD4 抑制剂)可抑制 BRD4 和 CREB5 表达,干扰 SE - 启动子相互作用能影响 CREB5 转录水平。
- CREB5 在 HCC 中高表达且与不良预后相关:基于 TCGA 数据集分析,发现 CREB5 在多种肿瘤组织中高表达,且在肝癌组织中的表达显著高于正常组织。其表达与肝癌的组织学分级、残留癌、血管侵犯等临床病理特征相关,高表达的 CREB5 会缩短患者总生存期(OS)和疾病特异性生存期 。对 96 例肝癌患者组织芯片的 IHC 染色以及对 38 例肝癌患者的随访结果,都进一步证实了这一结论。
- ERS 激活上调 HCC 中 CREB5 表达:用不同浓度 TM 处理 HepG2 细胞,发现 CREB5 和葡萄糖调节蛋白 78(GRP78)表达呈剂量依赖性增加,而 ERS 抑制剂 4 - 苯基丁酸(4 - PBA)可抑制这种上调。免疫荧光和 IHC 染色结果也显示,TM 处理后 CREB5 表达增加且定位于细胞核,4 - PBA 则降低其表达。同时,CREB5 表达与 GRP78 水平呈正相关,CREB5/GRP78 双阳性患者的 OS 更短。
- CREB5 促进 HCC 体内外增殖:在不同肝癌细胞系中,CREB5 表达存在差异。敲低 Hep3B 和 LM3 细胞中的 CREB5,可显著抑制细胞增殖,动物实验中肿瘤重量和体积也明显减小;而过表达 HepG2 和 Huh7 细胞中的 CREB5,则促进细胞增殖,体内实验中肿瘤大小和重量显著增加。
- CREB5 促进 HCC 迁移、侵袭并抑制凋亡:敲低 CREB5 可降低 Hep3B 和 LM3 细胞的迁移和侵袭能力,促进细胞凋亡;过表达 CREB5 则增强 HepG2 和 Huh7 细胞的迁移和侵袭能力,抑制细胞凋亡,相关结果通过伤口愈合实验、Transwell 实验和流式细胞术得以验证。
- ERS 通过 CREB5 促进 EMT:TM 处理 HepG2 细胞可诱导 ERS,降低 E - cadherin 表达,增加 N - cadherin 和 vimentin 表达,4 - PBA 可逆转这些变化。相关性分析和基因集富集分析(GSEA)表明,CREB5 与 EMT 标志物、细胞外基质(ECM)降解及相关基因显著相关。在不同肝癌细胞系中,敲低或过表达 CREB5 对 EMT 相关蛋白表达有显著影响,且 CREB5 还可调节 MMP2 和 MMP9 的表达。
- TNC 是 CREB5 的下游效应因子:通过对 TCGA 数据和 RNA - seq 数据的分析,结合 EMT 相关基因集,发现 TNC 是 CREB5 调控 EMT 的关键靶基因。双荧光素酶报告实验和 ChIP - qPCR 实验证实,CREB5 可结合到 TNC 启动子区域,促进其转录。
- CREB5 通过 TNC 促进肝癌细胞 EMT:在 Hep3B 细胞中敲低 TNC,可抑制细胞迁移、侵袭,降低 EMT 相关蛋白和 MMP2、MMP9 的表达,促进细胞凋亡并增加对 lenvatinib 的敏感性。在稳定过表达 CREB5 的 HepG2 细胞中敲低 TNC,可抑制 CREB5 介导的细胞侵袭、迁移和 EMT 促进作用。
研究结论和讨论部分指出,该研究首次证实了 ERS 通过 SEs 的关键靶基因 CREB5 促进肝癌细胞的 EMT,CREB5 直接结合到 TNC 启动子促进其转录,进而推动 EMT 进程。这不仅为理解 ERS 调控 EMT 的机制提供了新信息,也为阻断肿瘤转移的策略开发提供了有价值的见解。尽管仍有一些问题有待进一步研究,如 ERS 与 EMT 之间复杂关系的深入探究,SE 与 CREB5 转录起始位点在三维空间中的相互作用机制等,但该研究已为肝癌的治疗开辟了新的方向,超级增强子和 CREB5 有望成为肝癌治疗的潜在靶点 。