在过去十年里，虽然对 CLL 肿瘤遗传学的研究不断深入，但这些研究大多是在欧洲血统的患者中进行的，少数族裔在研究中的代表性严重不足。鉴于非洲血统人群在基因组研究中的数据缺失，以及对不同血统 CLL 患者肿瘤遗传学差异的不了解，梅奥诊所（Mayo Clinic）等多个研究机构的研究人员决定开展一项研究，旨在揭示非洲血统和欧洲血统 CLL 患者在遗传和转录组特征上的差异，为后续更精准的诊疗提供依据。这项研究成果发表在了《Blood Cancer Journal》上。
研究人员为了完成这项研究，主要采用了以下关键技术方法：
样本采集与处理：从 597 名 CLL 患者（157 名 AA 和 440 名 EA）采集血液样本，通过主成分分析和基因型数据确定遗传血统，从病历中提取临床特征等信息。同时获取外周血单个核细胞（PBMC），并根据肿瘤细胞纯度分别进行 DNA 和 RNA 提取。
定制面板靶向 DNA 测序：对 59 个 CLL 潜在驱动基因的编码区域进行测序，检测突变情况，分析突变类型和数量。
RNA 测序（RNA-Seq）：对部分 AA 和 EA CLL 患者进行 mRNA 测序，经生物信息学流程处理数据，分析差异表达基因和相关生物学通路。
端粒长度量化：先通过末端限制片段长度（TRF）测量端粒长度，后因该方法对 DNA 需求量大，采用定量 PCR（qPCR）法进行大样本量分析，并进行验证。
统计分析：运用多种统计方法，评估不同因素间的关联。
下面来详细看看研究结果：
基线研究人群特征：AA 和 EA CLL 患者诊断时的中位年龄相似，均为 61 岁。但 AA CLL 患者的 Rai 分期更低，未突变的免疫球蛋白重链可变区（u-IGHV）频率更高。
AA CLL 的遗传景观：在 AA CLL 患者中，最常见的突变基因是 NOTCH1（29%） ，而欧洲血统患者中则是 NOTCH1（16%）。总体上，AA CLL 患者的突变基因数量更多，但在 u-IGHV 状态的患者亚组中，两者相似。u-IGHV 的 AA CLL 患者中，多个驱动基因的突变率更高。
AA CLL 中的 DNA 损伤修复受损和端粒侵蚀增加：AA CLL 患者中与基因组稳定性和细胞 DNA 损伤反应相关的基因显著下调。AA CLL 患者的肿瘤细胞端粒长度比 EA CLL 患者更短，这种差异在 u-IGHV 和突变型 IGHV（m-IGHV）状态的患者中均存在，且在调整相关因素后，遗传血统与端粒侵蚀的关联仍然显著。
AA CLL 中的 NF-κB 信号通路激活：通过无偏通路富集分析，发现 AA CLL 患者中肿瘤坏死因子 -α（TNFα）通过 NF-κB 信号通路显著富集，且关键介质上调，表明该通路在 AA CLL 中被激活。
治疗后的 AA CLL 样本：对治疗后的 AA CLL 样本分析发现，TP53 是最常见的突变基因。治疗后的样本与未治疗样本的转录程序相似，但先前的治疗与端粒侵蚀增加有关。
在讨论部分，研究人员指出，这是首次描述非洲血统 CLL 患者白血病遗传和转录组特征的研究。AA CLL 的基因组复杂性更高，存在更多与 DNA 损伤修复相关的基因突变，端粒更短，NF-κB 信号通路激活，这些都表明 AA CLL 的基因组不稳定性更高。不过，该研究也存在一些局限性，比如 AA 队列样本采集距诊断的时间更长，样本量存在差异，且测序基因是基于欧洲血统患者研究确定的。未来需要进行全基因组测序，进一步研究非洲血统人群内部的异质性对 CLL 的影响。
