单细胞RNA测序揭示宫颈小细胞神经内分泌癌的肿瘤异质性及分子亚型进化轨迹

本研究针对宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNECC)这一预后极差的妇科恶性肿瘤，通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术绘制了6例匹配样本的肿瘤微环境图谱。研究人员鉴定出由关键转录因子ASCL1、NEUROD1、POU2F3和YAP1定义的四种分子亚型，揭示了两条独立的肿瘤发生路径，发现P型肿瘤具有更强的免疫浸润特征。通过66例患者队列验证，建立了结合YAP1表达的预后预测模型，为SCNECC的精准治疗提供了新靶点。

　　

宫颈小细胞神经内分泌癌(SCNECC)作为女性生殖道最常见的神经内分泌恶性肿瘤，虽然仅占宫颈癌病例的不足5%，却以早期远处转移和高复发率为特征，患者5年生存率不足20%。这种侵袭性肿瘤90%以上与HPV18感染相关，但传统测序技术未能揭示其驱动基因，且肿瘤微环境(TME)的复杂性严重制约了精准治疗策略的开发。更棘手的是，SCNECC在组织形态和生物学行为上与其他器官的神经内分泌癌存在相似性，使得针对其独特发病机制的研究更具挑战性。

复旦大学附属妇产科医院丁晶新团队在《Communications Biology》发表的研究中，首次应用单细胞RNA测序技术解析了SCNECC的肿瘤异质性。研究人员收集了3对匹配的肿瘤组织和癌旁正常组织，通过10x Genomics平台获得68,455个高质量细胞的转录组数据。研究采用多种生物信息学分析方法包括UMAP降维、SCENIC调控网络推断、Monocle2拟时序分析等，并利用66例患者队列进行免疫组化验证。

研究结果部分，"The single-cell atlas reveals cellular diversity in SCNECC"显示，上皮细胞在肿瘤组织中比例显著增加，且表现出更高的拷贝数变异(CNV)水平。恶性上皮细胞呈现神经内分泌分化增强（如CHGA、DDC表达上调）和上皮角质化减弱（KRT家族下调）的特征。"Heterogeneity of SCNECC epithelial cells"部分通过12个上皮亚群分析，发现恶性细胞具有更复杂的氧化应激、DNA损伤修复等功能特征。

"Molecular subtypes of SCNECC based on epithelial heterogeneity"鉴定出由关键转录因子定义的四种分子亚型：A型（ASCL1⁺）、N型（NEUROD1⁺）、P型（POU2F3⁺）和Y型（YAP1⁺）。SCENIC分析显示这些亚型具有不同的调控网络，如A型受DLX/SOX家族调控，P型以POU2F3为主导。"The tumorigenesis model of SCNECC"部分通过拟时序分析揭示了两条演化路径：Tu P/A路径表现为P型细胞去分化后获得部分A型特征，Tu A/N路径则显示A型向N型的连续神经内分泌分化。

"The immune landscape of SCNECC"发现P型肿瘤具有"热肿瘤"特征，富含SPP1⁺巨噬细胞和耗竭性CD8⁺ T细胞，而A/N型呈现"冷肿瘤"状态。细胞互作分析识别出TIGIT-NECTIN等新型免疫检查点，以及WNT等亚型特异性信号通路。"Subtyping cell lines and possible clinical value of molecular subtyping"证实TC-YIK细胞系属于N型，并发现SLFN11和mTOR在N型中高表达。66例患者免疫组化分为A⁺(54%)、A⁺N⁺(26%)等五种亚型，建立包含YAP1的预后列线图。

讨论部分指出，该研究首次在单细胞层面解析了SCNECC的异质性，提出的A-N-P(Y)分型系统与韩国学者研究相互印证。发现的两种肿瘤发生路径支持了"APUD细胞起源"和"上皮细胞神经内分泌转分化"两种假说。特别值得注意的是，YAP1低表达与不良预后相关，提示HDAC抑制剂可能具有治疗价值。虽然P型患者仅占5%，但其独特的免疫特征为免疫治疗提供了依据。研究局限性在于样本量较小，TC-YIK是唯一可用的细胞系。未来需要通过类器官模型和更大队列验证这些发现，为这种罕见但致命的宫颈癌亚型开发更精准的治疗策略。