综述：Marinobacter liaoningensis 新种，从海洋沉积物中分离得到

《Antonie van Leeuwenhoek》：Marinobacter liaoningensis sp. nov., isolated from the marine sediment

新物种Marinobacter liaoningensis sp. nov. F4206^T从中国北海红海滩沉积物中分离，革兰氏阴性兼性厌氧杆状菌，最适温度20-40℃、pH 6.5、NaCl 10%。分子证据显示其与Marinobacter qingdaonensis、Marinobacter arenosus亲缘关系较近（16S rRNA相似度98.22%），但dDDH（20.5-44.3%）、ANI（78.2-80.5%）均显著低于物种界定标准（70%、95%）。化学特征为占主导的泛醌-9（Q-9）、主要脂肪酸C16:0、C18:1ω9c及C16:1ω9c，极性脂类包括磷脂酰乙醇胺等。DNA G+C含量58.5%。基于表型、系统发育及化学分类综合分析确认为新物种。

　　

摘要

一种革兰氏阴性、兼性厌氧的杆状细菌菌株F4206^T是从中国北海红海滩的沉积物中分离出来的。该菌株的最佳生长温度为20–40°C，最佳pH值为6.5，最佳NaCl浓度为10%。F4206^T与其最接近的亲缘菌株之间的数字DNA-DNA杂交（dDDH）值、平均核苷酸同一性（ANI）值和平均氨基酸同一性（AAI）值分别为20.5%–44.3%、78.2%–80.5%和65.0%–94.8%，这些数值远低于物种划分的公认阈值（70%、95%和95%）。这一确凿的基因组证据进一步得到了系统发育分析的支持：F4206^T被归类为一个与Marinobacter qingdaonensis ASW11-75^T和Marinobacter arenosus CAU 1620^T密切相关的独立谱系，其16S rRNA基因序列相似度为98.22%。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，F4206^T属于Marinobacter属内的一个独特谱系。F4206^T与其亲缘菌株之间的数字DNA-DNA杂交值和平均核苷酸同一性值分别为20.5%–44.3%和78.2%–80.5%，远低于70%和95%的临界值。该菌株的主要呼吸醌类物质是泛醌-9。其主要脂肪酸（占比超过5%）包括C_16:0、C_18:1 ω9c、C_16:1 ω9c、C_12:0 3-OH和C_12:0。F4206^T的主要极性脂质包括磷脂乙醇胺、磷脂甘油、胺脂和氨基磷脂。F4206^T的DNA G+C含量为58.5%。根据表型、系统发育和化学分类学分析，F4206^T被认定为一个新的Marinobacter物种，命名为Marinobacter liaoningensis sp. nov.，其模式菌株为F4206^T（= CGMCC 1.19487^T = KCTC 92054^T）。