通过生物信息学分析，比较阴道毛滴虫/鸡Legumain样半胱氨酸蛋白酶1（LEGU-1）与人类Legumain（LGMN）蛋白序列与质子泵抑制剂药物（兰索拉唑、奥美拉唑和埃索美拉唑）之间的相互作用

《Acta Parasitologica》：Comparing the Interactions of Trichomonas vaginalis/gallinae Legumain-Like Cysteine Protease 1 (LEGU-1) and Human Legumain (LGMN) Protein Sequences with Proton Pump Inhibitor Drugs (Lansoprazole, Omeprazole, and Esomeprazole) by Bioinformatics Analyses

滴虫病致病菌LegU-1与人类LGMN的质子泵抑制剂结合机制研究，通过序列分析、3D建模和分子对接，发现两者结构高度保守但氨基酸数量差异导致结合能不同，兰索拉唑结合能最高，为新型抗滴虫及泌尿生殖系统肿瘤疗法提供理论依据。

　　

摘要

目的

鞭毛寄生虫Trichomonas vaginalis是全球滴虫病病例的主要原因，并与多种并发症相关。由于该病原体在附着、繁殖和抗性过程中涉及多种毒力因子，因此需要开发具有预防效果且耐受性良好的化合物。在T. vaginalis中，一种名为LEGU-1的类豆蛋白酶的毒力因子特别值得关注，因为它可能对滴虫病以及泌尿生殖系统的肿瘤发展产生影响，同时它与禽类菌株T. gallinae有密切关系。先前的研究表明，抗肿瘤质子泵抑制剂也具有抑制豆蛋白酶（LGMN）的活性。

方法

因此，本研究旨在通过序列分析、3D建模和分子对接技术，比较T. vaginalis/gallinae的LEGU-1与人类LGMN与质子泵抑制剂药物（兰索拉唑、奥美拉唑和埃索美拉唑）之间的分子相互作用。

结果

尽管序列分析显示T. vaginalis/gallinae的LEGU-1与人类LGMN之间的同源性较低，但二级结构和3D结构比较揭示了它们在结构上的保守性。利用CB-DOCK2在三种蛋白质中识别出的潜在结合位点，并与先前描述的LGMN结合位点进行了对比，随后使用Autodock Vina进行了靶向对接。两个程序均识别出与三种配体相互作用的氨基酸，表明这些结合位点的整体结构具有保守性。三种蛋白质结合位点中氨基酸数量的变化反映了每种配体结合能的差异。实验结果表明，兰索拉唑、奥美拉唑和埃索美拉唑均能结合T. vaginalis/gallinae的LEGU-1和人类的LGMN，其中兰索拉唑的结合能最高。

结论

除了我们取得的有希望的生物信息学结果外，本研究还可以为开发针对滴虫病及其相关疾病的替代治疗方法提供指导。

图形摘要

目的

鞭毛寄生虫Trichomonas vaginalis是全球滴虫病病例的主要原因，并与多种并发症相关。由于该病原体在附着、繁殖和抗性过程中涉及多种毒力因子，因此需要开发具有预防效果且耐受性良好的化合物。在T. vaginalis中，一种名为LEGU-1的类豆蛋白酶的毒力因子特别值得关注，因为它可能对滴虫病以及泌尿生殖系统的肿瘤发展产生影响，同时它与禽类菌株T. gallinae有密切关系。先前的研究表明，抗肿瘤质子泵抑制剂也具有抑制豆蛋白酶（LGMN）的活性。

方法

因此，本研究旨在通过序列分析、3D建模和分子对接技术，比较T. vaginalis/gallinae的LEGU-1与人类LGMN与质子泵抑制剂药物（兰索拉唑、奥美拉唑和埃索美拉唑）之间的分子相互作用。

结果

尽管序列分析显示T. vaginalis/gallinae的LEGU-1与人类LGMN之间的同源性较低，但二级结构和3D结构比较揭示了它们在结构上的保守性。利用CB-DOCK2在三种蛋白质中识别出的潜在结合位点，并与先前描述的LGMN结合位点进行了对比，随后使用Autodock Vina进行了靶向对接。两个程序均识别出与三种配体相互作用的氨基酸，表明这些结合位点的整体结构具有保守性。三种蛋白质结合位点中氨基酸数量的变化反映了每种配体结合能的差异。实验结果表明，兰索拉唑、奥美拉唑和埃索美拉唑均能结合T. vaginalis/gallinae的LEGU-1和人类的LGMN，其中兰索拉唑的结合能最高。

结论

除了我们取得的有希望的生物信息学结果外，本研究还可以为开发针对滴虫病及其相关疾病的替代治疗方法提供指导。

图形摘要