印度香蕉（Musa和Ensete属）种质资源中简单序列重复（SSR）标记的遗传多样性、种群结构及其跨物种转移性

《Genetic Resources and Crop Evolution》：Genetic diversity, population structure, and cross-species transferability of simple sequence repeat (SSR) markers in Indian banana (Musa and Ensete spp.) germplasm

香蕉遗传多样性及SSR分子标记研究。通过34对SSR引物分析65份印度香蕉种质资源（AA、AB、AAA、AAB、ABB基因组组及野生近缘种），31对引物产生128个等位基因，平均期望杂合度0.492，野生和AA/AAB组遗传多样性最高，AB组最低。结构分析揭示6个遗传亚种群，AMOVA显示66%方差内群体，34%间群体差异。PCoA和UPGMA聚类与SSR数据一致，SSR标记在野生种间高度可转移（83.87%），5对引物在所有物种中扩增。为种质保护和定向育种提供工具。

　　

摘要

香蕉（Musa属）是发展中国家中第四大重要作物，也是数百万人的主食。印度拥有丰富的可食用香蕉品种，尤其是在南部和东北部地区，但其遗传特征研究仍较为有限。在本研究中，我们筛选了34种特异性的微卫星（SSR）引物，以评估65个香蕉样本的遗传多样性。这些样本涵盖了AA、AB、AAA、AAB和ABB基因组类型以及野生近缘种。共有31个引物产生了清晰且可重复的DNA片段，检测到128个等位基因（每个位点1-8个；平均4.1个），这些等位基因具有较高的多态性信息含量（0.42-0.95；平均0.78）。预期杂合度（He）值介于0.31（MACV77）到0.80（MACV96）之间，平均值为0.55。实际观察到的纯合度（Ho）范围从0.03（MABN20）到0.88（MACV169）不等，平均值为0.34。多样性指标（多态性位点比例、观察到的等位基因数量和有效等位基因数量、香农信息指数、固定指数、预期杂合度和无偏预期杂合度）在野生种、AA和AAB基因组类型中最高，而在AB基因组类型中最低。遗传多样性估计结果显示，平均预期杂合度为0.492。STRUCTURE分析识别出6个遗传亚群（K=6），分子方差分析（AMOVA）表明群体内部的变异占66%，群体间的变异占34%。基于SSR数据的主坐标分析（PCoA）图和未加权配对组平均法（UPGMA）生成的系统发育树将个体根据其遗传组成分为不同的遗传簇。SSR标记在不同野生物种间的交叉转移率很高（平均83.87%），其中有5个引物在所有测试的物种中都能扩增。这些结果为印度Musa种质的遗传多样性和群体结构提供了新的见解，并为定向育种和保护工作提供了基因组工具。