与EMT相关的lncRNAs的遗传变异调节了中国人群中结直肠癌的风险

《Biochemical Genetics》：Genetic Variants in EMT-Related lncRNAs Modulate the Risk of Colorectal Cancer in the Chinese Population

本研究探讨EMT相关lncRNAs遗传变体与中国人群结直肠癌风险关联，采用病例对照设计分析1888例病例及1888例对照，结合多变量回归、GTEx eQTL分析和TCGA表达数据，发现AC106786.1 rs76180806、rs2277930、LINC00578 rs28711160和RP1-193H18.2 rs17823238显著影响CRC风险（OR值1.52-0.83，P<0.05），其中rs28711160通过调控LINC00578表达显著相关，提示这些SNP可作为CRC候选生物标志物。

　　

摘要

上皮-间充质转化（EMT）在肿瘤进展和转移过程中起着关键作用，长链非编码RNA（lncRNAs）是其中的关键调控因子。本研究探讨了中国人群中与EMT相关的lncRNAs的基因变异与结直肠癌（CRC）风险之间的关联。研究采用了1,888例未经治疗的CRC患者和1,888例无癌对照组的病例对照设计。通过多变量逻辑回归模型评估了SNPs对CRC风险的影响，同时利用基因型-组织表达（GTEx）项目的数据进行了表达数量性状位点（eQTL）分析，并通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库评估了基因表达情况。研究发现4个功能相关的SNPs（AC106786.1 rs76180806、rs2277930、LINC00578 rs28711160和RP1-193H18.2 rs17823238）与CRC风险显著相关（OR = 1.52，95% CI = 1.26–1.83，P = 1.57 × 10^-2；OR = 1.34，95% CI = 1.15–1.57，P = 3.30 × 10^-2；OR = 1.21，95% CI = 1.09–1.33，P = 3.30 × 10^-2；OR = 0.83，95% CI = 0.75–0.92，P = 3.30 × 10^-2）。值得注意的是，rs28711160对LINC00578的表达具有显著的eQTL效应（P = 2.09 × 10^-5），且LINC00578的表达水平与CRC风险密切相关。这些发现表明，与EMT相关的lncRNAs（AC106786.1、LINC00578、RP1-193H18.2）的基因变异可能增加CRC的发病风险，并可作为潜在的生物标志物，为CRC的遗传机制提供新的见解。

图形摘要

上皮-间充质转化（EMT）在肿瘤进展和转移过程中起着关键作用，长链非编码RNA（lncRNAs）是其中的关键调控因子。本研究探讨了中国人群中与EMT相关的lncRNAs的基因变异与结直肠癌（CRC）风险之间的关联。研究采用了1,888例未经治疗的CRC患者和1,888例无癌对照组的病例对照设计。通过多变量逻辑回归模型评估了SNPs对CRC风险的影响，同时利用基因型-组织表达（GTEx）项目的数据进行了表达数量性状位点（eQTL）分析，并通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库评估了基因表达情况。研究发现4个功能相关的SNPs（AC106786.1 rs76180806、rs2277930、LINC00578 rs28711160和RP1-193H18.2 rs17823238）与CRC风险显著相关（OR = 1.52，95% CI = 1.26–1.83，P = 1.57 × 10^-2；OR = 1.34，95% CI = 1.15–1.57，P = 3.30 × 10^-2；OR = 1.21，95% CI = 1.09–1.33，P = 3.30 × 10^-2；OR = 0.83，95% CI = 0.75–0.92，P = 3.30 × 10^-2）。值得注意的是，rs28711160对LINC00578的表达具有显著的eQTL效应（P = 2.09 × 10^-5），且LINC00578的表达水平与CRC风险密切相关。这些发现表明，与EMT相关的lncRNAs（AC106786.1、LINC00578、RP1-193H18.2）的基因变异可能增加CRC的发病风险，并可作为潜在的生物标志物，为CRC的遗传机制提供新的见解。

图形摘要