综述:HECT型E3泛素连接酶在DNA损伤应答和修复中的作用

《Cell Death Discovery》:The role of HECT-type E3 ubiquitin ligases in DNA damage response and repair

【字体: 时间:2025年12月14日 来源:Cell Death Discovery 7

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  本文系统阐述了HECT型E3泛素连接酶家族在维持基因组稳定性中的核心作用。作者深入剖析了NEDD4样、HERC和“其他”三大亚家族成员如何通过调控p53、BRCA1、PARP1等关键蛋白的泛素化,精确影响DNA损伤信号传导、染色质重塑及修复通路(如HR、NHEJ、BER)的选择。该综述不仅揭示了HECT E3s在肿瘤发生与治疗耐药中的新机制,更为开发靶向E3连接酶的创新疗法(如PROTACs)提供了理论依据,对突破癌症治疗瓶颈具有重要启示。

  
背景
细胞的生命活动时刻面临着内外部因素引起的DNA损伤威胁。为了维持基因组的完整性,细胞演化出了一套精细的DNA损伤应答(DDR)系统。在这个系统中,蛋白质的翻译后修饰——尤其是泛素化——扮演着至关重要的角色。泛素化过程由E1、E2和E3三类酶依次催化完成,其中E3泛素连接酶负责识别特异性底物,决定了修饰的特异性。在E3连接酶大家族中,HECT(Homologous to the E6-AP Carboxyl Terminus)家族因其独特的催化机制而备受关注:它们能够与泛素分子形成硫酯中间体,再直接将其转移至底物上,这与作为支架蛋白的RING型E3s截然不同。尽管RING型E3s在DDR中的作用已被广泛研究,但HECT型E3s在这一领域的复杂功能网络仍如一幅亟待拼凑完整的拼图。
DDR与修复机制概览
当DNA损伤发生时,细胞会启动DDR信号通路,激活细胞周期检查点,并启动转录重编程以促进修复因子的表达。p53作为“基因组守护者”,是DDR的核心调控者。DNA损伤的类型决定了修复路径的选择。对于最致命的DNA双链断裂(DSBs),细胞主要采用高保真的同源重组(HR)或易错配的非同源末端连接(NHEJ)进行修复。而对于单链损伤,则涉及核苷酸切除修复(NER)、碱基切除修复(BER)和错配修复(MMR)等通路。这些通路之间存在着复杂的交互对话与竞争关系,共同织就了一张维护基因组稳定的安全网。
泛素化在DNA损伤信号与修复中的作用
泛素化通过多种方式协调DDR与修复。它可以通过修饰组蛋白(如H2A、H2B)来改变染色质结构,便于修复因子募集;也可以直接调控DDR因子(如p53、XPC)的稳定性与功能。例如,RING型E3连接酶RNF8和RNF168在DSB位点催化组蛋白的K63连接的多聚泛素化,为BRCA1、53BP1等修复蛋白搭建招募平台。而RING型E3 FANCL则通过单泛素化FANCI-FANCD2(ID2)复合物来启动链间交联(ICLs)的修复。
HECT E3 家族
人类基因组编码28个HECT E3家族成员,它们共享一个约350个氨基酸组成的C端HECT结构域。该结构域分为N叶(与E2-泛素复合物相互作用)、C叶(含有催化半胱氨酸)和连接两者的柔性铰链区。根据底物识别结构域的不同,HECT E3s可分为三个亚家族:含有WW结构域的NEDD4样亚家族、含有RCC1样结构域(RLD)的HERC亚家族,以及既不含有WW也不含有RLD结构域的“其他”亚家族。泛素链的类型(如引导蛋白酶体降解的K48连接链,或参与信号传导的K63连接链)决定了底物的命运,HECT E3s能够催化形成多种类型的泛素链,从而精细调控下游事件。
NEDD4样HECT E3亚家族在DDR中的作用
该亚家族成员通过调控关键DDR蛋白,在维持基因组稳定性中发挥重要作用。
  • NEDD4:通过K63连接的多聚泛素化稳定MDM2,间接促进p53的降解。它还能泛素化PTEN,影响其稳定性,从而扰动由PTEN调控的RAD51、BRCA1、ATM、Chk1和53BP1的水平,导致DSBs应答缺陷。
  • NEDD4L:通过泛素化降解53BP1,促使修复平衡向HR倾斜。在BER通路中,它介导糖苷酶OGG1的泛素化降解,精细调控其在氧化应激下的活性,防止BER中间产物单链断裂(SSBs)的过度积累。
  • ITCH:受ATM磷酸化激活后,通过泛素化连接组蛋白H1.2,干扰RNF8/RNF168依赖的53BP1焦点聚集,从而促进HR。它还降解c-FLIP和p73等蛋白,平衡凋亡与生存信号。
  • WWP1:通过K63连接的多聚泛素化修饰组蛋白去甲基化酶JARID1B,增强其稳定性,促进染色质开放,从而正向调控HR和NHEJ因子的招募。此外,它还通过调控TXNIP影响细胞氧化还原状态。
  • WWP2:催化RNAPII大亚基RPB1的K48连接的多聚泛素化,导致转录停滞,防止其干扰修复。它还泛素化PARP1并促其降解,避免过度的PARP1信号。
  • SMURF1/2:SMURF2被ATM磷酸化后,可泛素化降解RING型E3 RNF20(负责H2B泛素化)并拮抗RNF168,从而负向调控DDR和DSBs修复因子的招募,形成反馈调节。
  • NEDL1/2:NEDL1与p53相互作用并增强其转录活性。NEDL2则通过泛素化稳定p73,增强其转录功能。
HERC亚家族在DDR中的作用
HERC家族成员,特别是HERC1和HERC2,在基因组稳定性维持中扮演关键角色。
  • HERC1:参与MMR通路,可能通过直接或间接方式调节MSH2的稳定性。其下调与MSH2水平显著降低相关,可能导致MMR缺陷和基因组不稳定。
  • HERC2:功能尤为广泛。它作为p53的调控因子,既能招募ATM/ATR以稳定p53,又能标记p53被MDM2降解。在DSB修复中,HERC2被ATM/ATR/DNA-PK磷酸化后,与MDC1、RNF8形成复合物,促进RNF168招募和组蛋白泛素化信号放大。它还能泛素化降解RPA2和BRCA1。在NER通路中,HERC2调控XPA的稳定性。
  • HERC3-6:这些小HERC成员的功能仍在探索中。HERC3的移码突变见于微卫星不稳定的胃癌和结直肠癌。HERC4在乳腺癌和肺癌中过表达。HERC5和HERC6是干扰素刺激基因15(ISG15)的E3连接酶,在抗病毒免疫中发挥作用,提示它们可能在感染相关DNA损伤应答中起作用。
“其他”HECT亚家族在DDR中的作用
  • AREL1:作为一种抗凋亡E3,通过降解SMAC、HtrA2和ARTS等IAP拮抗剂,帮助癌细胞逃避凋亡。
  • HUWE1:功能多样,能降解Mcl-1促进凋亡,降解HDAC2影响p53乙酰化,降解BRCA1影响HR,并与TRIM26共同靶向BER糖苷酶NEIL1。它还调控H2AX和Cdc6的稳定性。
  • G2E3:一种G2/M期调控蛋白,在基因毒性应激下从核仁转位至核质。其缺失会损害DNA损伤信号(如降低γH2AX水平和Chk1磷酸化),导致复制应激和ssDNA积累。
  • TRIP12:通过其PAR结合结构域与PARP1结合并促其泛素化降解,从而限制PARP抑制剂(PARPi)在DNA断裂位点的“捕获”效应。它与UBR5共同调节RNF168的水平,防止53BP1和BRCA1的过度招募。
  • UBR5:与TRIP12协同调节RNF168。在复制应激下,PPARγ增强UBR5对ATM相互作用蛋白(ATMIN)的泛素化降解,从而影响53BP1的定位和NHEJ效率。UBR5还能与ITCH协作,在TXNIP上形成K48/K63分支泛素链,靶向其降解,参与氧化应激应答调控。
最终述评与未来方向
综上所述,HECT型E3泛素连接酶通过精确调控其DDR底物的水平和功能,在维持基因组完整性中发挥着不亚于RING型E3s的关键作用。它们功能的失调与多种肿瘤的发生、发展及治疗耐药密切相关。尽管针对泛素-蛋白酶体途径的抑制剂(如蛋白酶体抑制剂)已在癌症治疗中取得成效,但开发高选择性的HECT E3s抑制剂或PROTACs(蛋白降解靶向嵌合体)仍面临巨大挑战,主要障碍在于HECT结构域在家族成员间的保守性导致的选择性难题。未来的研究需要借助结构生物学和高通量蛋白质组学等手段,进一步揭示HECT E3s的底物特异性、时空调控规律及其与其他修饰酶的交叉对话。针对特定HECT E3s(如HERC2、TRIP12、WWP1)的抑制剂,与PARPis、放疗或氧化治疗联用,有望为克服肿瘤耐药性开辟新的途径。
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