远程缺血预处理通过细胞外囊泡miRNA系统性下调介导器官保护的新机制

《Scientific Reports》:Systemic downregulation of EV-associated MiRNAs following remote ischemic preconditioning

【字体: 时间:2025年12月12日 来源:Scientific Reports 3.9

编辑推荐:

  本研究针对缺血再灌注损伤(IRI)防治难题,聚焦远程缺血预处理(RIPC)的系统性分子机制。研究人员通过配对分析5例游离皮瓣手术患者RIPC前后的血浆样本,发现RIPC诱导EV-miRNA谱发生快速、系统性改变,其中hsa-miR-505-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-200a-3p和hsa-miR-181b-5p四种miRNA显著下调。基因集富集分析(GSEA)显示其靶基因显著富集于TNF-α/NF-κB、TGF-β、低氧等应激应答通路,提示RIPC通过"减法式调控"解除保护性基因程序的抑制,为临床器官保护策略提供新靶点。

  
当组织经历缺血后恢复血液供应时,反而会引发更严重的损伤——这就是缺血再灌注损伤(Ischemia-Reperfusion Injury, IRI)。在心肌梗死、脑卒中、器官移植和游离皮瓣手术等临床场景中,IRI是影响患者预后的关键因素。尽管血运重建技术不断进步,但能够有效预防IRI的药物治疗方案仍然匮乏。远程缺血预处理(Remote Ischemic Preconditioning, RIPC)作为一种非侵入性策略,通过在对肢体施加短暂、无害的缺血-再灌注循环,能够激活机体内在的保护机制,从而保护远隔器官免受后续严重IRI的损害。虽然RIPC在多种临床环境中显示出明确的保护效果,但其将"预处理"信号从肢体传递到重要器官的系统性分子机制尚未完全阐明。
目前研究表明,RIPC的作用机制涉及神经和体液通路的复杂相互作用。在体液通路中,细胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs)作为纳米级的膜包被囊泡,能够携带蛋白质、脂质和核酸等生物活性物质在血液中循环,并特异性地将 cargo 递送到靶细胞,因此被认为是RIPC体液介质的理想候选者。其中,微小RNA(microRNA, miRNA)因其能够通过转录后调控基因表达,在细胞保护和组织修复中发挥关键作用而备受关注。然而,关于RIPC如何系统性调控循环EV-miRNA谱,以及这些变化如何介导远端保护效应,仍缺乏系统性的认识。
发表在《Scientific Reports》的这项研究正是为了填补这一空白。研究团队假设,RIPC会诱导循环EV-miRNA的快速且显著改变,从而释放特定的miRNA,靶向参与细胞保护的信号通路。为了验证这一假设,他们在人体中进行了直接、高分辨率的比较分析。
研究人员从一项大型临床试验的RIPC干预组中,选取了5例接受游离皮瓣手术的患者作为代表性队列。所有患者在麻醉诱导前接受标准化的RIPC干预(在手臂上使用止血带,以250 mmHg的压力进行3个循环的10分钟阻断/10分钟再灌注)。分别于RIPC前和干预后30分钟内采集血浆样本。通过ExoQuick方法分离EV,并利用RNase A处理确保仅分析囊泡内RNA。提取miRNA后,使用包含384个miRNA的qPCR芯片进行表达谱分析。数据经过严格质控和过滤,最终对134个高置信度miRNA进行后续分析。采用配对统计学方法进行差异表达分析,并通过错误发现率(False Discovery Rate, FDR)校正进行多重假设检验。此外,研究还利用miRTarBase数据库映射已验证的靶基因,进行基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA),并构建miRNA-基因-通路互作网络,以推断miRNA变化的功能影响。
RIPC诱导循环EV-miRNA谱发生系统性改变
主成分分析(Principal Component Analysis, PCA)显示,所有患者的样本在RIPC后均呈现出一致的方向性移动,表明干预对循环miRNA组产生了明显的系统性效应。
差异表达分析进一步揭示了一种不对称的反应模式:四个miRNA被显著下调,包括hsa-miR-505-3p (log2FC = -3.30, p=0.025)、hsa-miR-374a-5p (log2FC = -4.52, p=0.028)、hsa-miR-200a-3p (log2FC = -7.27, p=0.044)和hsa-miR-181b-5p (log2FC = -3.94, p=0.045),且这四种miRNA在所有患者中均呈现一致的下调趋势。相反,没有发现任何miRNA被一致或显著上调。热图分析也证实,RIPC前后的样本分离主要由一个显著下调的miRNA簇所驱动。
功能分析预测关键保护性通路的调控
GSEA分析结果显示,这些下调miRNA的已验证靶基因在多个与细胞应激反应密切相关的Hallmark通路中显著富集。
排名前五的富集通路包括TNF-α信号通路(通过NF-κB)、UV反应下调、TGF-β信号通路、Notch信号通路和血管生成。所有显著富集通路的归一化富集分数(Normalized Enrichment Score, NES)均为正值,表明这些通路的成员基因(即被下调miRNA靶向的基因)在RIPC后可能被解除抑制,从而被激活。此外,与IRI直接相关的低氧和凋亡通路也显著富集。这提示RIPC触发的系统性EV-miRNA信号,可能通过调节基本的炎症、细胞存活和组织重塑级联反应,使远隔组织为后续的缺血应激做好准备。
网络分析揭示协调的调控枢纽
通过构建miRNA-基因-通路互作网络,研究发现hsa-miR-181b-5p和hsa-miR-374a-5p作为核心调控节点,分别靶向68和53个基因,对多个相互关联的应激应答通路具有广泛影响。
许多靶基因是TNF-α/NF-κB信号、低氧反应、TGF-β信号和凋亡等关键通路中的共享组分。这种高度的互联性表明,RIPC触发的EV-miRNA调控以一种系统性的方式,重编程了跨组织的应激适应性基因网络。
本研究证实,人体在经历短暂的RIPC刺激后,循环EV相关的miRNA谱会发生快速、系统性的改变,其特征是少数特定miRNA的协调下调,而非新保护信号的引入。这种"减法式"分子编辑,通过选择性移除EV结合的抑制性miRNA,解除了对下游应激适应性通路(如TNF-α/NF-κB、TGF-β、Notch、低氧、血管生成和凋亡)的 repression,可能使细胞预先进入一种"预备"状态,从而增强对后续IRI的耐受性。研究首次在人体内揭示了RIPC早期(30分钟内)的EV-miRNA响应特征,提出了其介导系统保护的新机制——即通过解除抑制而非引入新效应分子来发挥作用。网络分析突出了miR-181b-5p和miR-374a-5p等核心调控节点的作用。这些发现不仅深化了对RIPC机制的理解,也为开发模拟RIPC保护效应的靶向治疗(如使用antagomirs抑制特定miRNA)提供了潜在的分子靶点和理论依据。当然,由于样本量较小且人群特定,这些结论是探索性的,需要在更大规模、多时间点的队列中进一步验证,并通过功能性实验确认这些miRNA变化与器官保护之间的因果关系。尽管如此,该研究无疑为理解EV-miRNA在缺血预处理中的功能角色开辟了新的视角,对临床防治IRI具有重要的启示意义。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号