基于血液LncRNA与转录因子共表达特征的视神经脊髓炎诊断新靶点及NF-κB机制研究

《Scientific Reports》:A blood-based co-expression signature of LncRNAs and transcription factors in neuromyelitis optica with diagnostic and mechanistic implications

【字体: 时间:2025年12月12日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对视神经脊髓炎(NMO)缺乏有效外周标志物的临床难题,通过分析40例NMO患者和40名健康对照者血液中7种NF-κB相关转录本(ADINR、ANRIL、NKILA、PACER、DICER-AS、DILC和CEBPA)的表达水平。研究发现所有转录本在NMO患者中均显著上调(P≤0.0001),其中DICER-AS表现最优(AUC=1.00),ROC曲线显示其可完美区分患者与对照。这些转录本构成协同调控模块,提示其通过NF-κB、IL-6/STAT3和髓系调控通路参与NMO发病机制,为疾病诊断和机制研究提供了新的候选生物标志物。

  
在神经免疫疾病领域,视神经脊髓炎(Neuromyelitis Optica,NMO)作为一种主要攻击视神经和脊髓的自身免疫性疾病,其诊断和治疗仍面临重大挑战。这种疾病以水通道蛋白4抗体(AQP4-Ab)阳性为特征,导致严重的炎症反应和组织损伤,患者常表现为视力丧失、肢体瘫痪等功能障碍。尽管全基因组研究已发现MHC区域相关遗传风险因素,但NMO的精确发病机制尚未完全阐明,临床诊断仍缺乏可靠的外周生物标志物。
值得注意的是,核因子κB(NF-κB)信号通路在NMO的病理过程中扮演着关键角色。这一通路不仅调节炎症因子释放,还参与神经元存活调控。特别是,NMO-IgG能够通过激活NF-κB通路诱导星形胶质细胞释放IL-6,这为靶向治疗提供了新思路。然而,NF-κB相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)在NMO中的作用尚未被系统探索。
为此,来自伊朗沙希德·贝赫什提医科大学的研究团队在《Scientific Reports》上发表了最新研究成果,他们聚焦于7个NF-κB相关转录本(包括LncRNAs和mRNAs),旨在探索其在NMO患者外周血中的表达特征及其诊断潜力。
研究方法上,团队采集了40例AQP4-IgG血清阳性NMO患者(男女比例1:4)和40名性别/年龄匹配健康对照者的血液样本。通过实时定量PCR(qPCR)技术检测ADINR、ANRIL、NKILA、PACER、DICER-AS、DILC和CEBPA的表达水平,使用B2M作为内参基因,采用效率调整的ΔCt方法进行相对定量。统计分析包括Mann-Whitney U检验、多元线性回归、ROC曲线分析和Spearman相关性评估。
基因表达在NMO患者与健康对照血液中的差异
研究发现,所有七个转录本在NMO患者中均显著上调。其中DICER-AS表达增加最为显著(log2 FC=16.49),其次是ADINR(log2 FC=11.62)、PACER(log2 FC=10.62)、NKILA(log2 FC=9.27)、ANRIL(log2 FC=9.13)、CEBPA(log2 FC=7.99)和DILC(log2 FC=3.95)。所有比较均达到统计学显著性(P≤0.0001),仅DILC为P=0.0001。
多元分析
多元线性回归显示,疾病状态对所有转录本的表达均有显著影响(P<0.0001),而性别仅对ADINR和CEBPA有轻微影响。这表明观察到的表达差异主要源于疾病本身而非性别因素。
转录本间的两两Spearman相关性(对照vs NMO)
Spearman相关性分析揭示,所有七个转录本在NMO患者和对照组中均呈现强烈的共表达模式。在NMO组内,ADINR与NKILA(ρ≈0.86)、ADINR与DICER-AS(ρ≈0.87)等基因对表现出高度相关性,提示它们可能构成协同调控网络。
诊断性能和样本分类
ROC曲线分析评估了各转录本的诊断价值。DICER-AS表现最佳,在临界值>-7.861时达到100%敏感性和特异性(AUC=1.00)。ADINR也显示出良好的诊断性能(AUC=0.92),而其他转录本虽敏感性高但特异性相对较低。
基因表达与临床变量的相关性(Spearman's ρ)
临床相关性分析发现,ADINR、ANRIL和DILC的表达与患者年龄和发病年龄呈弱到中度正相关。然而,所有转录本均未显示与扩展残疾状态量表(EDSS)评分有显著关联,表明这些标志物可能反映疾病状态而非残疾程度。
研究结论指出,NF-κB相关转录本在NMO患者外周血中协同上调,构成一个紧密共表达的LncRNA-转录因子模块。这一特征不仅具有诊断潜力,还提示NF-κB、IL-6/STAT3和髓系调控通路在NMO发病机制中的协同作用。特别是DICER-AS展现出完美的区分能力,值得在更大队列中进一步验证。
该研究的创新性在于首次系统评估了NF-κB相关LncRNAs在NMO中的表达特征,为理解疾病分子机制提供了新视角。然而,研究也存在一定局限性,如样本量较小、横断面设计以及未进行细胞分型分析等。未来研究需要在不同疾病阶段(复发期、缓解期)患者中验证这些标志物,并通过功能实验明确其具体作用机制。
这项工作的意义不仅在于为NMO诊断提供了潜在的血液生物标志物,更重要的是揭示了LncRNA-转录因子协同调控网络在自身免疫疾病中的重要作用,为开发新的治疗策略奠定了理论基础。
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