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与糖酵解相关的microRNA(miRNA)特征可以预测肝细胞癌患者的预后、复发风险和治疗反应
《Scientific Reports》:Glycolysis-related MiRNA signature predicts prognosis, recurrence risk, and therapeutic responses in hepatocellular carcinoma
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年12月05日 来源:Scientific Reports 3.9
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本研究基于TCGA和GEO数据库的HCCmiRNA及mRNA表达数据,构建预后风险模型并验证其与免疫微环境及化疗药物敏感性的相关性,为HCC个体化治疗提供依据。
肝细胞癌(HCC)是一种高度异质性的恶性肿瘤,其特点是复发率高且预后较差。近年来,miRNA作为潜在的预后标志物和治疗靶点的研究,以及它们对HCC中葡萄糖代谢途径的调控作用,引起了广泛关注。本研究旨在通过分析差异表达的与糖酵解相关的miRNA来构建一个预测HCC预后的风险模型,并进一步探讨这些miRNA与免疫微环境和药物敏感性之间的关系。本研究从TCGA和GEO数据库中下载了HCC的原始mRNA和miRNA表达数据,共收集了374个TCGA样本和97个GSE30297样本。利用LASSO回归分析构建了HCC的预后风险评分模型,并通过Kaplan-Meier曲线分析了不同风险组之间的生存差异。通过Metascape和GSEA分析进行功能富集,以探索模型中miRNA的潜在分子机制。此外,还使用CIBERSORT算法分析了免疫微环境,并采用“pRRophetic”软件包预测HCC患者对常用化疗药物的敏感性。实时定量PCR(RT-qPCR)用于检测这些具有预后价值的糖酵解-代谢相关miRNA在HCC患者肿瘤组织和相邻正常组织中的表达水平。通过差异表达分析,共筛选出4,421个差异表达的mRNA和106个差异表达的miRNA,其中59个为与糖酵解-代谢相关的miRNA。通过Cox单变量回归和LASSO回归分析选出了10个与预后相关的miRNA,并基于这些miRNA构建了一个风险评分模型。该模型在训练集和测试集上的验证结果表明,高风险组的总体生存期(OS)显著低于低风险组(P?0.05)。诺模图(nomogram)进一步验证了该风险评分对HCC患者预后的独立预测价值。免疫微环境分析显示,高风险组中免疫细胞(如M0巨噬细胞和调节性T细胞(Tregs)的含量较高,而静止NK细胞等免疫细胞的含量较低。药物敏感性分析表明,风险评分与对多种化疗药物(如甲氨蝶呤、紫杉醇)的敏感性显著相关。RT-qPCR的结果显示,hsa-mir-454和hsa-mir-149在HCC中的表达水平上调,而hsa-mir-621的表达水平下调;然而,hsa-mir-653在HCC中的表达水平无显著差异。在复发性和原发性HCC患者中,hsa-mir-454和hsa-mir-621的表达存在显著差异,具体而言,hsa-mir-454在复发肿瘤样本中上调,而hsa-mir-621下调。值得注意的是,hsa-mir-149和hsa-mir-653在两组之间没有显著差异。本研究通过筛选差异表达的与糖酵解相关的miRNA,建立了一个可靠的HCC预后风险评分模型,有效区分了高风险和低风险患者,并能预测患者的生存情况。此外,该模型与免疫微环境和药物敏感性密切相关,为HCC的个性化治疗和临床决策提供了有力支持。