DBI通过调节CD56dim NK细胞的细胞毒性功能来影响强直性脊柱炎的进展

【字体: 时间:2025年12月04日 来源:Analytical Cellular Pathology 2.7

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  本研究通过加权基因共表达网络分析、机器学习及孟德尔随机化等方法,从58,864个可药物基因中鉴定出新型治疗靶点DBI,揭示其通过调节脂代谢和CD56dim NK细胞毒性功能参与强直性脊柱炎(AS)病理机制,并构建了基于DBI和临床数据的可靠风险预测模型,同时鉴定了多个潜在治疗化合物。

  
强直性脊柱炎(AS)是一种以慢性炎症和脊柱强直为特征的自身免疫性疾病,其病理机制复杂且传统疗法存在局限性。近年来,随着多组学技术和人工智能算法的快速发展,科学家们开始探索新的治疗靶点。一项发表于国际期刊的研究通过整合基因组学、转录组学、单细胞测序及计算生物学手段,成功鉴定出一种名为“二苯胺甲基丁胺结合抑制蛋白(DBI)”的新型潜在治疗靶点,并揭示了其在AS病理中的双重作用机制。该研究不仅为AS的精准治疗提供了新思路,还通过药物筛选和分子对接技术,发现了几种可能具有临床应用价值的化合物。

### 研究背景与意义
强直性脊柱炎的致病机制尚未完全阐明,现有治疗手段如非甾体抗炎药(NSAIDs)和肿瘤坏死因子(TNF)抑制剂对部分患者有效,但仍有40%患者对常规治疗无应答。这一现象凸显了AS治疗靶点的匮乏性。传统研究多聚焦于炎症因子和免疫细胞浸润,但近年来研究逐渐转向代谢调控与免疫细胞功能的交叉领域。DBI作为一种参与脂质代谢的蛋白质,其与免疫细胞功能的关系尚不明确,因此成为本研究的核心探索对象。

### 研究方法与技术创新
该研究采用多学科交叉方法,构建了从基因筛选到药物验证的完整分析链条:
1. **多算法靶点筛选**:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA),从5884个可药物基因中初步筛选出与AS相关的基因模块。结合孟德尔随机化分析(利用eQTL数据和FinnGen队列),排除遗传冗余基因,最终通过递归特征消除(RFE)结合随机森林和支撑向量机算法,确定DBI为关键靶点。
2. **功能验证体系**:
- **生物信息学验证**:通过GO和KEGG富集分析,发现DBI显著调控脂代谢相关通路(如PPAR信号通路),并与炎症反应(TNF信号、NF-κB通路)和骨代谢(破骨细胞分化通路)存在关联。
- **单细胞测序技术**:利用10x Genomics平台对PBMC单细胞数据进行聚类分析,发现DBI在CD56dim NK细胞亚群中高表达,且其表达水平与细胞毒性蛋白( perforin、granzyme A/B)的分泌量呈正相关。
- **分子对接实验**:通过LeDock软件对DBI蛋白结构进行模拟,结合Enrichr数据库预测的25种潜在药物,筛选出5种高亲和力化合物(如PIM1/2激酶抑制剂SMI-16a),其与DBI的相互作用模式显示可能通过激活PPAR通路改善脂代谢紊乱。

### 关键发现与机制解析
1. **DBI的双重病理作用**:
- **代谢调控异常**:DBI作为酰基辅酶A结合蛋白,其功能缺失会导致长链脂肪酸运输障碍,引发脂质代谢紊乱。KEGG分析显示,DBI通过PPAR信号通路调控胆固醇合成和脂肪酸氧化,而AS患者常伴有代谢综合征特征(如血糖异常、血脂升高)。
- **免疫细胞功能抑制**:单细胞分析表明,DBI在CD56dim NK细胞亚群中高表达,且AS患者中该亚群比例显著降低(较健康对照组下降约35%)。进一步研究发现,DBI通过调控perforin(颗粒酶A)和granzyme B的合成,抑制NK细胞的细胞毒性功能。机制模型显示,DBI作为“代谢枢纽”,通过维持免疫细胞的能量供应(如β-氧化供能)和膜结构完整性(如磷脂合成),确保细胞毒性蛋白的活性。当DBI表达不足时,NK细胞分化受阻,导致无法有效清除致病病原体。

2. **临床应用价值**:
- **风险预测模型**:基于DBI表达水平与临床参数(如年龄、炎症指标、HLA-B27状态),构建的AS风险预测模型在ROC曲线中达到AUC=0.878,且经过200次5折交叉验证后稳定性良好。
- **药物靶点预测**:通过药物基因组学数据库Enrichr筛选出SMI-16a等5种候选药物,其中SMI-16a(一种PIM激酶抑制剂)在分子对接中显示与DBI的相互作用能低于3 kcal/mol,且体外实验证实其可部分恢复AS患者PBMC中DBI的表达水平。值得注意的是,该药物在骨代谢研究中已显示抑制破骨细胞分化的潜力,与DBI的骨相关功能高度契合。

### 研究局限与未来方向
1. **样本局限性**:研究队列中AS患者仅40例,且为单一汉族人群,未来需扩大样本量和种族多样性以验证普适性。
2. **技术敏感性**:单细胞测序对低丰度基因的检测存在阈值依赖,需结合多重验证策略(如流式细胞术或qPCR)。
3. **机制待深化**:DBI如何调控PPAR信号与NK细胞分化的具体分子通路尚不明确,需通过CRISPR敲除/过表达实验验证功能必要性。
4. **转化挑战**:候选药物需完成毒理学评估(如SMI-16a在骨髓抑制和肝毒性方面的安全性),并设计针对DBI的特异性抑制剂(如基于DBI的酶活性位点设计小分子拮抗剂)。

### 对AS治疗的启示
该研究首次将代谢组学与免疫组学结合,揭示了AS中“代谢-免疫”轴的调控机制。DBI作为桥梁分子,连接了脂质代谢异常与NK细胞功能衰退,这一发现突破了传统治疗只关注免疫炎症的局限。临床转化中,可考虑以下策略:
- **联合疗法**:在NSAIDs基础上联用PPAR激动剂(如罗格列酮)和DBI表达增强剂(如SMI-16a),协同改善代谢紊乱和免疫抑制。
- **生物标志物开发**:基于DBI表达水平与临床数据的风险模型,可建立早期诊断工具或疗效预测系统。
- **靶向递送系统**:利用DBI的脂溶性特性,设计纳米载体靶向递送至NK细胞浸润的脊柱局部,增强疗效。

### 总结
本研究通过整合计算生物学与实验验证,首次系统阐明DBI在AS中的双重作用机制。其发现不仅补充了AS的代谢调控理论,更为开发“代谢-免疫”双通路靶向药物提供了理论依据。未来需通过多中心临床试验验证DBI抑制剂的疗效,并探索DBI与HLA-B27等遗传因素的交互作用,以推动精准医疗的实现。
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