数字病理学H&E染色归一化优化:基于染色向量欧氏距离的大数据整合新策略
《IEEE Open Journal of Engineering in Medicine and Biology》:Optimized Whole-Slide-Image H&E Stain Normalization: A Step Towards Big Data Integration in Digital Pathology
【字体:
大
中
小
】
时间:2025年12月03日
来源:IEEE Open Journal of Engineering in Medicine and Biology 2.9
编辑推荐:
本研究针对全切片图像(WSI)中H&E染色批次差异导致的诊断偏差问题,提出一种基于染色向量欧氏距离的数据驱动归一化方法。通过优化参考WSI数量至50张,将染色收敛效率提升50倍,显著增强计算病理学分析的精准性与可重复性,为胶质母细胞瘤等疾病的自动化诊断提供关键技术支撑。
在医学诊断领域,组织病理学切片是疾病判定的“金标准”,然而传统人工分析效率低下,且受制于主观经验差异。随着数字化技术的普及,全切片图像(Whole-Slide Image, WSI)技术虽能实现活检样本的全程数字化,但不同实验室的染色流程、设备参数差异导致WSI色彩存在显著批间偏差,这种“颜色不一致性”严重干扰计算机辅助诊断模型的泛化能力。尤其对于胶质母细胞瘤(Glioblastoma)等复杂肿瘤,细微的颜色差异可能掩盖关键病理特征,影响治疗策略制定。
为解决这一难题,宾夕法尼亚大学研究团队在《IEEE Open Journal of Engineering in Medicine and Biology》发表研究,提出一种基于染色向量欧氏距离的优化染色归一化(Stain Color Normalization, SCN)方法。该方法突破传统单张WSI参考的局限性,通过数学建模确定最优参考WSI数量,实现高效、精准的大规模WSI队列色彩标准化。
研究利用Ivy胶质母细胞瘤图谱计划(IvyGAP)的1864张WSI作为数据集,通过染色解卷积(Stain Deconvolution)分离H&E组分,仅采用苏木素(Hematoxylin)数据进行简化分析。通过随机分组(2-199张WSI)与1000次排列计算染色向量欧氏距离的标准差比率,结合S型曲线拟合其收敛趋势,确定50张WSI为最优参考数量。最终采用结构保持性颜色归一化算法(Structure-Preserving Color Normalization)对整个WSI队列进行归一化,并通过结构相似性指数(Structural Similarity Index, SSIM)定量评估归一化效果。
染色向量欧氏距离与既往采用的直方图Wasserstein距离呈现强相关性(Pearson相关系数r=0.99),且符合幂律分布(Power-Law Distribution),证明欧氏距离可作为高效替代指标。
通过标准差比率(Rσ(x)=σx+1/σx)分析发现,当参考WSI数量达50时,其导数趋近于零(≈1×10-8),表明色彩收敛达到稳定状态,无需增加更多参考WSI。
欧氏距离计算仅需0.35小时(21分钟),较直方图Wasserstein距离(28小时)提速80倍,且标准差更低(1.4 vs. 28),证明方法兼具高效性与稳定性。
对胶质母细胞瘤细胞肿瘤区域(ROI)的归一化结果显示,随着参考WSI数量增加,SSIM标准差下降,色彩一致性显著提升。视觉对比进一步证实,50张WSI参考即可实现最优归一化效果。
本研究通过数学优化将参考WSI数量从120张降至50张,大幅提升SCN效率,且首次证明染色向量欧氏距离可替代复杂直方图计算。该方法不仅解决了数字病理中的色彩批间偏差问题,为多中心研究提供数据整合基础,更推动了计算病理学在胶质母细胞瘤等疾病诊断中的精准应用。未来通过云端计算扩展与多病种验证,有望进一步优化自动化诊断流程,最终助力个性化医疗发展。
生物通微信公众号
生物通新浪微博
今日动态 |
人才市场 |
新技术专栏 |
中国科学人 |
云展台 |
BioHot |
云讲堂直播 |
会展中心 |
特价专栏 |
技术快讯 |
免费试用
版权所有 生物通
Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved
联系信箱:
粤ICP备09063491号