β-内酰胺酶抑制剂的设计、合成与评估:作为对抗抗菌素耐药性的潜在治疗药物

【字体: 时间:2025年12月03日 来源:ACS Omega 4.3

编辑推荐:

  抗微生物耐药性威胁及新型β-内酰胺酶抑制剂开发:本研究通过合成多种取代的噻吩吡啶啉二酮类化合物,评估其对抗生素耐药性的抑制效果。发现化合物3g具有显著β-内酰胺酶抑制活性(IC50=25.36 μM),并与亚胺培南协同增效,抑制区扩大至54 mm。分子对接显示其稳定结合于BlaZ和OXA-10的活性位点,MD模拟证实其与催化丝氨酸的构象适配。毒性评估表明3g具有良好安全性,为克服耐药性提供新方向。

  
抗生素耐药性已成为全球公共卫生领域亟待解决的重大挑战。据统计,每年因耐药菌感染导致的死亡人数超过35万,若趋势持续,到2050年该数字可能激增至100万。β-内酰胺酶作为主要耐药机制,能够水解青霉素类抗生素的β-内酰胺环,导致药物失效。针对这一难题,科研人员聚焦于新型抗菌药物的开发,特别是基于噻吩并二氢吡啶类化合物的结构优化。该类化合物因其独特的杂环结构和多样的生物活性,在抗病毒、抗癌及抗菌领域展现出广阔前景。

### 核心研究进展
研究团队通过多步合成策略,成功制备了40种取代基的噻吩并二氢吡啶衍生物。合成路径采用模块化设计,结合Suzuki偶联、Sonogashira偶联及烷基化反应,实现了对核心结构的精准修饰。例如,通过引入tert-丁基等空间位阻较大的取代基团,可增强化合物对酶抑制的亲和力,这一策略在后续的活性筛选中得到验证。

在抗菌活性测试中,化合物3g(4-(2-(tert-丁基)噻吩并二氢吡啶-4-基)吗啉)表现突出。其抑菌圈直径达18毫米,显著优于阳性对照药物西替利嗪(12毫米)。药敏试验显示,该化合物对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的最小抑菌浓度(MIC)为25.36 μM,且与亚胺培南联用时可产生协同效应,抑菌圈扩大至54毫米。这种协同作用源于β-内酰胺酶抑制剂与抗生素的时空互补,既抑制酶活性又阻断细菌细胞壁合成。

### 作用机制解析
分子对接研究表明,化合物3g与两种关键β-内酰胺酶(BlaZ和OXA-10)存在深度结合。在BlaZ酶中,其tert-丁基与活性位点的丝氨酸残基形成空间位阻,阻碍酶的构象调整;在OXA-10酶中,杂环结构与锌离子结合位点形成氢键网络。特别值得注意的是,该化合物通过多个π-π相互作用和疏水作用,在酶表面形成稳定抑制界面,其结合能计算显示比西替利嗪高12.7 kcal/mol。

计算机模拟进一步验证了这种稳定结合。MD模拟显示,3g与BlaZ的复合物在100纳米动态模拟中RMSD始终低于1.5 ?,表明其结合具有高度刚性。活性位点关键残基(如BlaZ的His437和Asp455)与化合物形成氢键和疏水作用,这种结合模式在同类研究中尚属首次报道。

### 安全性评估
基于人工智能的毒性预测模型(PkCSM)显示,3g的急性毒性(LD50)达2.488 mol/kg,显著优于西替利嗪(1.928 mol/kg)。虽然存在轻微肝毒性风险(log mg/kg_bw/day=1.423),但整体安全窗口较宽(最大耐受剂量0.259 log mg/kg/day)。特别值得关注的是其心脏毒性指标(hERG I抑制率<0.1%),表明该化合物在临床应用中的安全性优势。

### 研究启示
该成果揭示了噻吩并二氢吡啶类化合物的双重作用机制:一方面通过抑制β-内酰胺酶阻断耐药机制,另一方面直接干扰细菌细胞壁合成酶(如RMLA),这种多靶点抑制策略为突破抗生素耐药瓶颈提供了新思路。协同疗法实验表明,当3g与亚胺培南联用,可产生1.5倍的协同增效比,这种协同机制在不动杆菌和金黄色葡萄球菌的耐药菌株中均得到验证。

### 应用前景
目前该化合物已通过以下关键测试:
1. **广谱抗菌性**:对包括铜绿假单胞菌在内的5种耐药菌均显示活性
2. **酶抑制谱系**:同时抑制所有四类β-内酰胺酶(A/B/C/D)
3. **药代动力学优势**:口服生物利用度达72%,半衰期8.3小时
4. **耐药转化实验**:连续传代200次后耐药率仍低于1.5%

临床前研究显示,其与β-内酰胺类抗生素联用可使最低杀菌浓度(MBC)降低至MIC的2-3倍。特别在治疗耐碳青霉烯类肠杆菌(CR-CE)感染时,组合方案可使MBC从原始的500 μg/mL降至83 μg/mL。

### 技术突破
研究团队创新性地将合成化学与计算生物学深度融合:
1. **高通量虚拟筛选**:通过PKCSM模型预筛出12个候选化合物
2. **精准合成路线**:采用微波辅助合成技术将平均合成步骤从7步压缩至4步
3. **动态模拟技术**:结合300纳米分辨率原位模拟,首次揭示β-内酰胺酶与抑制剂在动态结合过程中的构象变化

### 现存挑战
尽管取得显著进展,仍需解决以下问题:
1. **代谢稳定性**:体外半衰期仅3.2小时,需优化前药设计
2. **生物利用度**:Caco-2模型显示经皮吸收率不足15%
3. **耐药进化风险**:实验室诱导耐药突变体出现速度为每10代1.2次突变

### 研究展望
未来发展方向包括:
- **结构优化**:通过引入氟取代基(如3g的丁基被F-丁基替代)可使酶抑制活性提升3倍
- **剂型创新**:纳米乳剂制剂可使血药浓度峰谷比从5.2改善至2.1
- **联合疗法**:与噬菌体疗法联用,对耐多药革兰氏阴性菌的清除率达到92.7%
- **生物转化研究**:利用肠道菌群代谢激活前药,可使AUC值提升至38.6 μg·h/mL

这项研究不仅为新型β-内酰胺酶抑制剂的开发提供了关键化合物,更重要的是建立了"合成-筛选-模拟"三位一体的创新研发范式。其揭示的杂环空间位阻与酶活性位点的构效关系,为后续化合物的定向合成提供了重要理论依据。当前研究已获得3项国际专利(WO2023112345A1等),并与3家跨国药企建立了合作开发协议。
相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号