微生物产物鸡尾酒:膀胱癌个性化免疫治疗新策略

《Nature Communications》:Microbial Product Cocktails for Personalized Cancer Immunotherapy

【字体: 时间:2025年12月03日 来源:Nature Communications 15.7

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  本研究针对膀胱癌BCG免疫治疗失败率高、缺乏有效替代方案的临床难题,开发了基于人工智能优化的微生物产物鸡尾酒(MPC)个性化免疫治疗平台。通过患者来源肿瘤类器官的免疫比较分析(iCARE)和神经网络模型筛选,研究人员发现MPC能显著增强NK细胞和T细胞的肿瘤浸润活性。在原位膀胱癌模型中,MPC治疗较BCG标准疗法显著延长中位生存期(48天 vs 22天)并提高长期生存率(40% vs 0%),为BCG无应答患者提供了新型治疗策略。

  
当膀胱癌患者对标准的卡介苗(BCG)免疫治疗无应答时,临床上面临着严峻挑战——根治性膀胱切除手术成为唯一选择,但患者生活质量将大幅下降。尽管微生物与免疫系统的相互作用早在19世纪就被发现(如科利毒素的抗癌效应),但一个多世纪以来,BCG仍是唯一获批准的细菌癌症免疫疗法。约40%的患者对BCG治疗无效,而抢救性化疗和免疫检查点抑制剂的应答率仅8-25%,这凸显了开发新型免疫疗法的紧迫性。
近日发表于《Nature Communications》的研究提出了一种创新解决方案:微生物产物鸡尾酒(Microbial Product Cocktails, MPC)个性化免疫治疗平台。该研究团队开发了一套整合患者来源肿瘤类器官、高通量微流控芯片和人工智能优化的系统,成功筛选出能特异性激活个体患者免疫反应的微生物组合。
研究的关键技术突破包括:首先建立了免疫比较分析(immuno-comparative analysis of recruitment and enhancement, iCARE)检测平台,该多层微流控设备可同时评估多种微生物产物对免疫细胞(以NK细胞为主)向肿瘤类器官趋化、接触和浸润的能力。其次,利用神经网络模型对大量微生物组合(包括益生菌、常见病原体和尿路致病菌)进行高效筛选,从10万种可能组合中预测最优MPC配方。最后,通过11例膀胱癌患者(包括初治、复发和BCG难治性病例)的新鲜肿瘤样本和原位小鼠模型验证治疗效力。
免疫细胞招募与增强的比较分析
iCARE检测平台通过三维重构共聚焦图像,将免疫细胞与肿瘤类器官的相互作用精确量化:招募(距离d>0)、接触/排斥(d=0)和浸润(d<0)。该平台兼容膀胱癌细胞系自组装球体、原代膀胱癌细胞和经尿道膀胱肿瘤切除术(TURBT)新鲜分离的类器官。以NK细胞为主要观察指标,因其在BCG免疫治疗中起关键作用且浸润程度与膀胱癌预后正相关。研究发现,长双歧杆菌(B. longum)、大肠杆菌(E. coli)和腐生葡萄球菌(S. saprophyticus)等微生物产物单独或组合使用时,可提升NK细胞招募效率4-15倍。
人工智能引导的MPC优化
研究团队构建包含12个节点的前馈神经网络模型,以微生物产物成分为输入,NK细胞招募数量为输出。通过两轮建模筛选,发现含长双歧杆菌、屎肠球菌(E. faecium)和表皮葡萄球菌(S. epidermidis)的组合(如MPC8、MPC15和MPC17)预测效果最优。实验验证显示,这些MPC不仅能增强NK细胞招募,还促进其浸润至肿瘤球体内部。值得注意的是,最佳MPC组合存在样本特异性:例如MPC5(大肠杆菌产物)对部分患者类器官效果显著,而MPC4(屎肠球菌产物)仅对特定样本有效。
患者来源类器官的MPC免疫增强
对11例临床样本(涵盖Ta、T1、T2期初治/复发/BCG难治性肿瘤)的测试表明,多数MPC可提升基线免疫活性。转录组和蛋白质组分析揭示,高应答样本PPS2呈现基底/鳞状分子亚型特征,高表达IL-6、IL-8、CXCL9等趋化因子。MPC处理可进一步上调这些因子,激活化疗因子-趋化因子受体相互作用通路,从而招募T细胞和NK细胞。相反,MPC对免疫检查点、凋亡相关基因表达无显著影响,提示其作用机制集中于免疫细胞招募与活化。
个性化MPC免疫治疗的临床前验证
在MB49小鼠原位膀胱癌模型中,每周或隔周膀胱内灌注MPC可显著提升肿瘤内淋巴细胞(CD45+)浸润,尤其是T细胞(CD3+)、NK细胞(NK1.1+)和树突状细胞(CD11c+)。MPC17治疗组中位生存期达48天,显著优于BCG组(20天)和对照组(22天),长期生存率提升至40%(对照组仅6%)。机制上,MPC17特异性增强NK细胞中IFN-γ(干扰素-γ)和TNF-α(肿瘤坏死因子-α)表达,而BCG主要激活CD4+ T细胞。纳米生物传感器检测证实,MPC处理后的癌细胞自身也高表达IFN-γ和TNF-α,形成正向免疫循环。
讨论与展望
该研究开创性地将微生物产物组合与人工智能个性化筛选相结合,克服了活菌疗法的安全性和可控性局限。MPC疗法通过上调趋化因子网络增强免疫细胞浸润,其机制不同于BCG依赖的CD4+ T细胞活化,为BCG无应答患者提供了替代方案。未来需优化MPC给药频率、活性成分鉴定,并探索与免疫检查点抑制剂的联合疗法。该平台有望扩展至其他实体瘤治疗,推动微生物免疫治疗进入精准化时代。
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