儿童TRIM24::NTRK2融合阳性上皮样胶质母细胞瘤的精准治疗探索与克隆演化机制解析
《npj Precision Oncology》:Comprehensive characterization and targeted treatment of a pediatric epithelioid glioblastoma with a rare TRIM24-NTRK2 fusion
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时间:2025年12月03日
来源:npj Precision Oncology 8
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本研究针对儿童高级别胶质瘤(pHGG)治疗难题,通过多组学分析发现一例罕见TRIM24::NTRK2融合的上皮样胶质母细胞瘤。研究团队结合全基因组测序(WGS)、RNA测序及CRISPR基因编辑技术,证实该融合基因的致癌性随肿瘤进化减弱,并揭示其通过激活MAPK/PI3K通路驱动耐药。研究强调了对复发肿瘤持续分子分型的重要性,为多靶点联合治疗策略提供了理论依据。
儿童高级别胶质瘤(pHGG)是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤之一,具有侵袭性强、预后差的特点。尽管标准治疗方案包括手术切除、放疗和替莫唑胺化疗,但患者生存率改善有限。近年来,针对特定基因突变的精准治疗为pHGG患者带来希望,尤其是涉及神经营养酪氨酸激酶(NTRK)等融合基因的病例。然而,肿瘤异质性和克隆演化常导致耐药性产生,使得单一靶向治疗难以持续生效。
本研究由瑞典哥德堡大学团队开展,报道一例6岁女性上皮样胶质母细胞瘤患者病例。该患者经历五次复发,最终通过全基因组测序(WGS)在其原发肿瘤中发现罕见的TRIM24::NTRK2融合基因。研究人员利用患者来源的细胞系、体外功能实验及多组学分析,系统阐述了该融合基因的致癌机制及其在肿瘤进化过程中的动态变化。相关成果发表于《npj Precision Oncology》。
研究采用的关键技术包括:全基因组测序(WGS)和RNA测序用于鉴定融合基因及拷贝数变异;CRISPR/Cas9基因编辑技术用于验证TRIM24::NTRK2的功能;患者来源肿瘤细胞培养用于药物敏感性测试;免疫组化(IHC)和Western blot分析信号通路激活状态。样本来源于患者五次手术获得的肿瘤组织(OPT1-OPT5)及对应建立的细胞系(OP1-OP3)。
患者初诊时肿瘤位于右顶叶,甲基化分类提示为间变性多形性黄色星形细胞瘤(PXA),但最终诊断为上皮样胶质母细胞瘤(WHO 4级)。WGS分析显示原发肿瘤(OPT1)存在TRIM24::NTRK2融合、CDKN2A/B纯合缺失及TERT启动子突变(c.-146C>T)。复发肿瘤(OPT2-OPT5)表现出明显的克隆异质性,其中OPT3和OPT4C具有高突变负荷,提示放疗诱导的基因组不稳定性。
在HEK293细胞中表达TRIM24::NTRK2融合蛋白,显著增强细胞增殖能力,并激活下游MAPK(pERK)、PI3K/AKT(pAKT、pS6)和JAK/STAT(pSTAT3)信号通路。患者肿瘤组织的免疫组化结果进一步证实这些通路的持续激活。
患者先后接受拉罗替尼(larotrectinib)和瑞波替尼(repotrectinib)等TRK抑制剂治疗,但均出现耐药。体外实验显示,随着肿瘤进展(OP1至OP3),细胞对TRK抑制剂的敏感性逐渐下降。耐药机制包括获得性MTOR p.L1433S和NTRK2 p.G639R(溶剂前沿突变)等二次突变。
通过CRISPR/Cas9敲除TRIM24::NTRK2,发现早期肿瘤细胞(OP1)增殖显著受抑,而晚期肿瘤细胞(OP3)仍保持生长能力。RNA测序分析表明,敲除融合基因后,OP3细胞中多种替代性致癌通路(如VEGFR、FGFR2)被激活,提示肿瘤通过旁路信号逃逸靶向治疗。
利用CIBERSORTx分析免疫细胞浸润,发现复发肿瘤中M0型巨噬细胞和中性粒细胞比例增加,而CD8+ T细胞逐渐减少。OPT5样本中观察到显著的新生血管形成和坏死区域,与快速生长表型一致。
本研究通过纵向追踪一例TRIM24::NTRK2融合阳性上皮样胶质母细胞瘤的演化过程,揭示了儿科高级别胶质瘤在治疗压力下的动态适应机制。肿瘤通过克隆异质性、替代通路激活及微环境重塑等多种策略逃逸靶向治疗。研究强调,针对pHGG需采用多时间点分子监测策略,并开发联合靶向方案(如CDK4/6抑制剂联合TRK抑制剂)以克服耐药。这一案例为理解儿科脑瘤的精准治疗挑战提供了重要范式。
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