将全基因组测序分析与基于患者独特数据的模型相结合,揭示了TFCP2融合型横纹肌肉瘤中具有临床意义的药物靶点 开放获取

【字体: 时间:2025年12月03日 来源:Molecular Cancer Therapeutics 5.5

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  TFCP2重排骨肉瘤的首次患者衍生模型构建及多组学分析揭示PI3K/AKT和PRMT5通路为新型治疗靶点,联合抑制显著改善小鼠存活率。

  
### 研究解读:TFCP2重排骨肉瘤(IORMS)的分子机制与新型靶向治疗策略

#### 一、研究背景与意义
骨肉瘤(Rhabdomyosarcoma, RMS)是一种罕见的软组织恶性肿瘤,其发病与基因融合、信号通路异常及免疫微环境失调密切相关。尽管近年来靶向治疗取得一定进展,但针对RMS亚型的研究仍存在显著空白,尤其是TFCP2基因重排亚型(TFCP2-rearranged RMS)。此类肿瘤以高侵袭性、低生存率及对传统治疗耐药为特征,目前缺乏有效的分子诊断工具和预临床模型,导致治疗选择受限。本研究通过建立首个匹配的PDX(患者来源异种移植)和PDCL(患者来源细胞系)模型,结合多组学分析及功能实验,揭示了TFCP2重排IORMS的分子特征,并筛选出新型联合治疗策略,为罕见肿瘤的精准治疗提供了重要依据。

#### 二、研究核心发现
1. **患者模型与多组学分析**
研究团队以一名28岁男性患者的骨肉瘤为例,通过手术获取肿瘤组织并成功构建PDX和PDCL模型。基因组测序(WGS)和转录组测序(RNA-seq)显示,患者肿瘤存在TFCP2-FUS融合基因,且伴随染色体9p21.3区域 deletes(包括MTAP、CDKN2A等基因缺失)。这一发现与之前的研究一致,但进一步揭示了TFCP2重排亚型在基因表达谱上的独特性,例如显著下调免疫相关基因(如IFN-gene簇),导致肿瘤免疫抑制微环境。

2. **关键分子靶点鉴定**
- **PI3K/AKT通路激活**:通过通路富集分析和Western blotting发现,患者肿瘤及PDX/PDCL模型中AKT磷酸化水平显著升高,提示PI3K/AKT通路异常活化。功能实验证实,PI3K/mTOR抑制剂dactolisib能有效抑制体外细胞增殖,并显著延缓PDX肿瘤生长。
- **PRMT5依赖性**:患者基因缺失导致MTAP(甲基硫鸟氨酸磷酸酶)表达丧失,而MTAP是PRMT5(蛋白精氨酸甲基转移酶5)的辅因子。通过药物筛选发现,PRMT5抑制剂LYY-283单独使用效果有限,但与dactolisib联用可产生协同抗肿瘤效应,抑制细胞迁移并减少肿瘤血管生成(CD31阳性细胞减少)。

3. **治疗耐药机制与新型策略**
- **ALK抑制剂无效的原因**:尽管部分RMS病例存在ALK过表达,但本例患者及模型中ALK表达水平较低,且存在RIT1和MAPK1扩增,提示RAS/MAPK通路激活可能补偿了ALK信号缺失,导致crizotinib无效。
- **组合治疗的协同机制**:dactolisib(抑制PI3K/mTOR)与LYY-283(抑制PRMT5)联用可双重阻断肿瘤促进通路。体外实验显示,组合治疗显著降低p-p70S6K(4EBP1磷酸化)和p-AKT(Ser473磷酸化),同时通过SDMA(对称二甲基精氨酸)水平下降反映PRMT5活性抑制。体内实验进一步验证,组合治疗使PDX小鼠生存期延长,肿瘤体积抑制率超过60%。

#### 三、创新性与临床转化潜力
1. **首个匹配的IORMS患者模型**
传统RMS研究多依赖细胞系或非临床模型,而本研究的PDX/PDCL模型成功保留了患者肿瘤的分子特征(如FUS-TFCP2融合)和微环境特性(如低TIL浸润)。该模型为后续药物测试提供了高度保真的工具,尤其适用于探索免疫治疗耐药机制。

2. **多组学整合的精准靶点发现**
通过基因组(WGS)、转录组(RNA-seq)和蛋白组(Western blot)的多维度分析,研究者揭示了TFCP2重排IORMS的三大核心特征:
- **代谢重编程**:MTAP缺失导致PRMT5活性异常升高,影响组蛋白甲基化修饰,进而调控EMT(上皮-间质转化)相关基因(如SNAI1、TWIST1)表达。
- **信号通路冗余**:PI3K/AKT和RAS/MAPK通路的交叉激活形成治疗耐药“双引擎”。
- **免疫抑制微环境**:CD8+ T细胞浸润不足及Treg/CD8+比值失衡,预示免疫治疗响应有限。

3. **临床转化路径**
- **生物标志物开发**:MTAP缺失联合PI3K通路激活状态可作为IORMS的分子分型标志。
- **药物组合设计**:dactolisib(临床已获批用于其他癌症)与LYY-283(在研PRMT5抑制剂)的组合有望成为新型一线治疗方案。
- **联合疗法的优化**:研究建议在PI3K抑制剂基础上联用PRMT5抑制剂,并监测4EBP1和p-AKT等生物标志物以评估疗效。

#### 四、挑战与未来方向
1. **模型局限性**
PDX模型仍存在个体异质性风险,需扩大样本量验证。此外,部分患者可能存在NF1或PTEN突变,需进一步探索这些基因与PI3K/AKT通路交互作用。

2. **转化医学障碍**
- **药物可及性**:dactolisib虽已上市,但其对IORMS的疗效尚未经临床验证。需开展II期临床试验评估安全性及有效性。
- **联合治疗的安全性**:PI3K抑制剂可能引起脂代谢异常,需监测PRMT5抑制剂对骨髓抑制的影响。

3. **机制深化研究**
- **PRMT5在EMT中的作用**:MTAP缺失导致PRMT5过活性可能通过组蛋白修饰调控EMT相关基因,需通过CRISPR/Cas9敲除实验验证。
- **免疫治疗协同效应**:PRMT5抑制剂可能通过代谢重编程增强抗肿瘤免疫,需联合PD-1/PD-L1抑制剂进一步探索。

#### 五、总结与展望
本研究通过创新性患者模型构建和多组学分析,首次系统阐明了TFCP2重排IORMS的分子特征及治疗靶点。其核心贡献包括:
1. 确立了PI3K/AKT和PRMT5通路在IORMS中的双重驱动作用;
2. 验证了“代谢-信号-免疫”多靶点协同治疗策略的有效性;
3. 提出了基于分子分型的精准治疗框架,为罕见肿瘤研究提供了方法论范式。

未来需开展多中心临床试验,验证组合治疗的生存获益及长期安全性。此外,开发基于MTAP缺失的PRMT5抑制剂(如MRTX1719)可能成为突破性进展。该研究不仅为骨肉瘤亚型治疗提供了新思路,也为罕见肿瘤的转化医学研究树立了标杆。
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