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在肺腺癌的预后和免疫学特征分析中,与棕榈酰化相关的基因的发现与验证
《American Journal of Clinical Oncology》:Development and Validation of Palmitoylation-Related Genes in the Prognostic and Immunologic Characterization of Lung Adenocarcinoma
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年12月02日 来源:American Journal of Clinical Oncology 1.8
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棕榈酰化相关基因影响肺腺癌预后及免疫微环境,通过多组学分析筛选5个预后标志基因,揭示高/低风险组细胞骨架与脂代谢基因差异,并鉴定两种分子亚型。
肺腺癌(LUAD)是最常见的肺癌类型,由于其较高的死亡率,成为全球主要的健康挑战。棕榈酰化作为蛋白质的一种关键翻译后修饰,在肿瘤进展中起着重要作用。然而,它对肿瘤免疫微环境(TME)的塑造及其对患者预后的影响仍不完全清楚。
本研究基于TCGA-LUAD和GSE72094队列数据集,探讨了与棕榈酰化相关的基因(PRGs)在LUAD中的潜在作用。通过差异分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单变量Cox分析和最小绝对收缩选择算法(LASSO)回归分析,筛选出了LUAD的预后基因。此外,还利用ssGSEA和CIBERSORT算法评估了不同组别中免疫细胞的浸润模式。为阐明PRGs在LUAD发病机制中可能介导的生物学过程,采用了GSEA、GO和KEGG富集分析。另外,还使用了共识聚类方法来识别LUAD的分子亚型。
本研究确定了5个与LUAD预后相关的PRGs,并构建了一个稳健的预后模型。免疫浸润分析表明,高风险组患者的免疫细胞浸润水平显著较低。进一步的研究发现,高风险组和低风险组中差异表达基因(DEGs)的上调与细胞骨架有关,而下调的DEGs与脂质代谢有关。此外,该研究成功将LUAD分为两种具有显著差异的分子亚型。
我们的研究深入探讨了LUAD复杂的TME和分子机制,为LUAD的病理机制和治疗策略提供了新的见解。
通俗语言总结:本研究探讨了与棕榈酰化相关的基因(PRGs)对肺腺癌(LUAD)的影响。LUAD是一种常见且致命的肺癌类型。研究人员利用TCGA-LUAD和GSE72094的数据,识别出5个能够预测患者预后的PRGs。研究发现,携带高风险PRGs的患者免疫细胞浸润较少,这可能影响预后。研究还发现,不同风险组中与细胞骨架相关的基因上调,而与脂质代谢相关的基因下调。此外,LUAD被分为两种不同的分子亚型。这些发现为LUAD的病理学和潜在治疗策略提供了新的见解。
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