华南主要城市基孔肯雅热本地传播的暴发特征：临床表现多样性、病毒进化新机制与气候驱动因素

《National Science Review》：Emerging local chikungunya virus transmission in a major urban area in Southern China: characteristics of clinical manifestations, viral evolution, and climatic influences

本研究针对2025年中国佛山首次暴发的基孔肯雅热（CHIKF）疫情，通过整合临床流行病学、病毒基因组学与气候数据，系统解析了非流行区输入性疫情的传播动力学。研究发现此次疫情由留尼汪谱系ECSA-2基因型病毒引起，携带E1-A226V/E2-I211T等增强白纹伊蚊传播效力的关键突变；临床表现为关节痛主导的非典型症状组合，且病毒载量与年龄特异性症状严重度相关；同时揭示当地连续38天的适宜气候窗口是蚊媒滋生的关键环境驱动因素。该研究为新兴虫媒病毒在无免疫背景城市的防控提供了“病毒-宿主-环境”交互作用的实证框架。

　　

2025年7月，中国广东省佛山市突然暴发基孔肯雅热疫情，这个拥有950万人口的制造业重镇此前并无本地传播记录，却在短时间内报告超过6300例确诊病例，基本再生数（R₀）高达3.50。这场疫情为何能在非流行区迅速蔓延？是病毒发生了关键变异，还是气候条件为蚊媒提供了温床？患者临床表现是否与经典教科书描述一致？这些问题亟待科学解答。

发表于《National Science Review》的这项研究，首次从临床表现多样性、病毒进化机制和气候驱动三重视角，系统性解析了佛山基孔肯雅热暴发的本质。研究人员在疫情初期快速招募134名住院患者，发现仅29.4%的成人患者以发热、皮疹、关节痛“三联征”起病，而45%的老年患者首发症状仅为关节痛，导致近三成患者初诊流向疼痛科、皮肤科等非感染专科。这种非典型临床表现挑战了传统诊断路径，提示在新发地区需强化对单一关节痛患者的病原筛查。

病毒基因组溯源揭示更深刻的传播机制：22株佛山病毒与2025年留尼汪流行株PV685691高度同源，均属于ECSA-2谱系，而与中国既往的亚洲基因型本土毒株亲缘较远。值得注意的是，所有毒株均携带E1-A226V、E2-I211T和E2-L210Q突变组合——实验研究证实，这些突变能协同增强病毒在白纹伊蚊中肠的感染和扩散效能，这为解释疫情快速扩散提供了分子基础。

气候分析则补全了传播链的最后一环：2025年疫情前，佛山连续出现38天的温度（26-29°C）与湿度（≥80%）双适宜期，创五年最长记录，这种气候窗口显著促进了蚊媒种群扩增。滞后相关性分析进一步表明，地表压力（lag=9天，r=-0.61）和皮肤温度（lag=6天，r=0.57）是病例数的关键预测指标。

在技术方法层面，研究团队通过实时荧光定量PCR（RT-PCR）确认感染，对22例病毒株进行全基因组测序，采用最大似然法构建系统发育树；使用数字评分量表（NRS）和面部疼痛量表修订版（FPS-R）量化关节痛强度；并基于ECMWF ERA5再分析数据集提取气候参数进行滞后相关性分析。

临床特征揭示年龄特异性表现规律

对134例患者症状的细致分析显示，不同年龄组临床表现存在显著差异。成人组（18-64岁）和老年组（≥65岁）分别有29.41%和45.0%以单纯关节痛起病，而未成年组（<18岁）三联征同时出现比例最高（26.92%）。病程进展后，88.8%患者出现关节痛，成人组更易累及踝、腕、膝关节等多部位，疼痛强度（中位评分5-6分）显著高于未成年组（2-3分，P<0.0001）。皮疹分布同样呈现年龄异质性：成人组超30%为全身性皮疹，而未成年人皮疹多局限于四肢。

病毒载量与症状严重度存在年龄分层关联

血清病毒载量（Ct值）监测显示，多数患者住院6-7天后病毒清除。年龄与初始病毒载量呈弱正相关（P=0.0058），分层分析发现成人组病毒载量与疼痛关节数正相关，老年组病毒载量与峰值体温正相关，提示病毒复制水平可能驱动年龄特异性症状表达。

系统发生分析确认输入性病毒来源

基因组进化分析表明，佛山毒株与留尼汪2025年流行株聚集成簇（自举值100%），明显区别于中国既往的亚洲基因型毒株。关键突变E1-A226V和E2-I211T被证实可协同增强病毒对白纹伊蚊的适应性，而NSP2-N495S突变可能影响蛋白底物识别功能。

气候适宜性窗口促发蚊媒暴发

2025年疫情前连续38天的温度-湿度双适宜期显著长于往年（2022-2024年仅23-31天），且地表压力（lag=9天）与温度指标（lag=6天）对病例数预测效力最高，证实气候条件是触发疫情的关键环境因素。

研究结论强调，佛山疫情是输入性病毒株（携带传播增强突变）、人群免疫空白期和气候驱动蚊媒增殖三者协同作用的结果。其重要意义在于首次在中国非流行区验证了“病毒进化-宿主反应-环境驱动”的共促传播模型，为类似区域的疫情预警提供了多维评估框架。作者建议临床工作者对单一关节痛患者保持警惕，公共卫生系统需整合病原基因组监测与气候预警数据，以应对未来可能增加的虫媒病毒输入风险。