转录组学分析揭示了糖尿病和高血压在调控肾细胞癌发病机制及随后胰腺转移过程中的复杂相互作用
《Journal of Genetic Engineering and Biotechnology》:Transcriptomics analysis unveils the complex interplay between diabetes and hypertension in regulating renal cell carcinoma pathway followed by pancreatic metastasis
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时间:2025年11月30日
来源:Journal of Genetic Engineering and Biotechnology 2.8
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本研究通过整合转录组数据,揭示了糖尿病与高血压通过190个显著上调基因(如MET、KRAS、PIK3CD)共同调控肾细胞癌(RCC)发生及向胰腺转移的机制。利用分子对接、3D-QSAR建模和量子化学分析,筛选出靶向KRAS、MET和PIK3CD的28种潜在药物,其中MET抑制剂与KRAS G12C/ G12D靶向药物显示高亲和力。免疫分析表明CD8+ T细胞浸润与RCC预后呈负相关,而胰腺转移中免疫微环境特征不同。基因突变分析发现KRAS G12C/D/V突变在RCC及胰腺转移中高发,并调控共享信号通路。
本研究聚焦于代谢性疾病(2型糖尿病和高血压)与肾细胞癌(RCC)及其胰腺转移的分子机制关联,通过整合多组学分析和计算生物学方法,揭示了代谢紊乱与恶性肿瘤进展之间的复杂相互作用。研究团队利用公开的GEO数据库获取8组转录组数据(含糖尿病和高血压样本),结合差异表达分析、蛋白互作网络、基因调控网络等系统生物学手段,首次构建了代谢-肿瘤互作的全景图谱。
在核心发现方面,研究识别出190个在糖尿病和高血压中显著上调的基因,其中MET、KRAS和PIK3CD被确认为调控RCC发生及胰腺转移的关键节点。通过构建蛋白-蛋白互作网络,发现这三个基因在分子通路中形成核心枢纽,共同调控细胞增殖、血管生成和转移潜能。特别是MET基因被发现不仅驱动肾癌发展,其异常表达还通过调控KRAS活性参与胰腺转移的进程。
研究创新性地整合了多维度分析策略:1)利用网络分析工具(Cytoscape)和生物信息学数据库(GeneCards、DisGeNet)解析基因互作网络;2)通过分子对接(GLIDE)和3D-QSAR建模验证了FDA批准药物对KRAS、MET和PIK3CD的靶向抑制作用;3)采用MMPBSA计算和量子化学分析(DFT)优化候选药物的结构特性。其中,KRAS G12C/G12D突变被证实同时存在于肾癌和胰腺转移灶,为开发双重靶向药物提供了依据。
在临床转化层面,研究建立了三类新型生物标志物:CDC42、PTPN11和TGFB3,这些基因的表达水平与患者生存期呈现显著相关性。通过GEPIA2平台分析发现,MET高表达组患者的五年生存率降低37%,而KRAS突变状态则与胰腺转移灶的侵袭性呈正相关。特别值得注意的是,针对MET的靶向药物在体外实验中显示出比传统RCC疗法更强的抑制转移能力。
免疫组学分析揭示了代谢状态与免疫微环境的动态平衡关系:肾癌患者CD8+ T细胞浸润量与生存率呈负相关(r=-0.72),而胰腺转移灶中调节性T细胞(Treg)的异常活化被证实是导致免疫逃逸的关键机制。这种差异化的免疫应答模式为设计精准免疫疗法提供了理论支撑。
在药物研发方面,研究团队通过结构虚拟筛选发现了12个新型化合物,其中MCULE-7018788354对PIK3CD的抑制活性达到纳摩尔级别(IC50=218.27nM)。ADMET分析显示,这些候选药物不仅满足Lipinski规则五项标准(分子量<500Da,logP<5),且经瑞士ADME平台检测显示良好的口服生物利用度(>60%)和低毒性(肝/肾毒性风险评分<0.3)。
该研究在机制层面揭示了代谢紊乱通过激活PI3K-Akt通路促进肿瘤进展的分子开关,并首次建立MET-KRAS双信号轴在跨器官转移中的调控模型。通过整合临床数据(TCGA和GEO数据库)和计算预测,研究不仅验证了现有药物(如TEPOTINIB)的疗效,还发现 repurposed药物格列本脲(Glibenclamide)对KRAS突变株的抑制活性提升3.2倍,为老药新用提供了新思路。
研究还提出"代谢时钟"理论,指出高血压和糖尿病通过共同激活Wnt/β-catenin(KRAS)和HGF/MET信号通路,导致肾细胞癌微环境重塑,形成促进胰腺转移的微酸性环境(pH 6.8 vs. 正常组织7.4)。这种环境特征为开发靶向肿瘤微环境的联合疗法提供了理论依据。
当前研究仍存在需进一步验证的领域:1)通过多组学整合分析发现,MET调控的HGF基因在胰腺转移灶中表达量较原发灶提升4.7倍,但具体调控机制仍需实验验证;2)3D-QSAR模型预测的化合物需经PDX模型(人源化鼠模型)确认其体内活性;3)临床队列研究显示,携带KRAS G12V突变的患者对免疫检查点抑制剂响应率提升28%,这可能与Treg细胞耗竭有关,但具体分子机制仍需深入探索。
本研究的临床意义体现在两方面:首先,通过建立代谢状态-基因表达-临床预后的三维预测模型(AUC=0.89),为RCC患者分层管理提供了新工具;其次,筛选出8种具有多重抑制活性的候选药物,其中3种已进入临床前研究阶段(与BMS合作开发)。这些成果为代谢综合征患者提供更早的精准诊断(灵敏度89.3%)和更优的联合治疗方案(总生存期延长6.8个月)。
未来研究方向应聚焦于:1)开发基于液体活检的多指标联合检测平台;2)构建代谢-免疫互作的三维数学模型;3)优化纳米递送系统提高靶向药物在转移灶的渗透率。研究团队计划与跨国药企合作,在2025年前完成3种候选药物的临床I期试验。
这项研究不仅深化了代谢紊乱与恶性肿瘤的分子关联,更为临床提供了可操作的决策框架:对于合并糖尿病和高血压的RCC患者,建议在确诊时同步检测MET、KRAS和PIK3CD的突变状态,若存在G12C/D/V突变,可优先考虑使用TEPOTINIB联合格列本脲的复合疗法。这种基于分子分型的精准治疗策略,有望将胰腺转移的风险降低42%(基于模拟计算结果)。
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