《Journal of Plankton Research》:Of sequences and images - diversity and quantity of Arctic epipelagic zooplankton by an integrative approach
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为突破传统显微镜法在北极浮游动物监测中的低通量瓶颈,研究团队首次将COI、18S rRNA V4/V9多标记meta-barcoding与ZooScan图像分析并行应用于巴伦支海—南森盆区0–100 m水层,同步解析58种浮游动物的群落结构与环境驱动机制,证实温度与极地表层水(PSW)占比是调控空间格局的核心因子,提出“成像+条形码”双轨方案可成为北极快速变化背景下生态预警的新一代标配。
北极正以两倍于全球平均的速度升温,海冰锐减与“大西洋化”正重塑上层海洋的物理与生物格局。浮游动物作为能量泵与气候哨兵,其种类与数量的细微波动可能牵动整个极区食物网,但传统显微镜鉴定耗时且易漏检幼体、胶体及稀有物种,导致年际变化信号被噪声淹没。为在“新北极”窗口期建立高分辨率、可重复的监测范式,Silke Laakmann领衔的德—瑞跨国团队搭乘“极星号”破冰船,于2017年6–7月沿巴伦支海陆坡—南森盆区—Yermak高原布设11站,采集0–100 m层浮游动物,首次并排运行多标记meta-barcoding(COI+18S rRNA V4/V9)与ZooScan图像分析,追问三大科学问题:①两种技术谁更能还原真多样性与真数量?②空间梯度上群落如何随环境变量重组?③能否提出一套资源友好、互为校验的北极业务化监测方案?论文最终发表于《Journal of Plankton Research》。
关键技术方法
RMT1网具现场分样→冷冻/甲醛双路保存;ZooScan扫描+EcoTaxa深度学习分类;COI、18S V4、V9三重PCR及Illumina测序;CTD温盐与叶绿素剖面;Ward聚类+nMDS/PCA环境向量拟合。
研究结果
物种鉴定与分辨率
COI检出58种、89.9%序列达种级,18S仅至目级;成像鉴定14种,但给出个体数、生物体积(biovolume)与干质量(mg DM m)的绝对量化。
群落结构与纬度梯度
Calanidae占据主导,其中COI显示Calanus hyperboreus随纬度增加而占优,成像则提示C. finmarchicus在巴伦支海贡献42%个体数;总丰度、生物体积与生物量均自南向北递减,与极地表层水(PSW)比例升高同步。
环境驱动因子
温度与PSW占比在PCA第一轴解释65.9%方差,nMDS表明二者及盐度显著影响群落结构;海冰厚度未显示统计学效应。
方法互校与偏差
Shannon多样性指数在COI与成像间无显著相关,但Jaccard相似性显著(P<0.01);大个体种类在COI读长中过度表达,小个体Pseudocalanus spp.被低估;成像对胶体、碎片分类能力有限,meta-barcoding补全了Cnidaria 8个物种。
结论与讨论
研究证实“COI条形码+ZooScan成像”可在同一Split样品内实现种类、个体数、生物体积与生物量的四重输出,避免单方法盲区;温度与PSW比例是调控北极浮游动物生物地理格局的“双旋钮”。作者建议未来北极年际监测优先采用COI单标记以节省资源,同时保留成像分支用于生物量绝对校准,从而为生态系统模型提供可验证的碳通量参数,也为即将开启的北极中央公海渔业谈判提供基线数据。